イネの雑種強勢に関する形質指標とゲノム指標の作成

创建水稻杂交活力的性状和基因组指标

• 批准号: 23658001
• 负责人: 貴島 祐治
• 金额: $ 2.5万
• 依托单位: Hokkaido University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
• 财政年份: 2011
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2011 至 2013
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-23658001/
• 关键词: イネ; ヘテロシス; 形質指標; ゲノム指標; 種子形質; マイクロアレイ; 反復配列; 葯; 雑種強勢; F１種子; マイクロアレイ解析

イネのヘテロシスに関して形質の指標とゲノム指標の作成を目標に研究を行ってきた。形質指標に関しては、従来行われたイネのF1種子に比べ、交雑組み合わせや系統数を大幅に増やし、日本晴に対して、コシヒカリ、Taichung65 (T65)、キタアケ、黒色稲２号(A58)、インディカ系統のIR36、Kasalath、Peiku (#108)、アジア栽培稲の近縁野生種(O.　rufipogon)であるW107、W593、W630、アフリカの栽培稲(O. glaberrima)であるWK18、WK21を交配に用いた。組合せは日本晴を基準親として、他の11系統を対応させ、全て相反交雑をした。これら20組み合わせのF1種子を３反復以上で試験することにより、高い精度でイネにおける全体的なヘテロシスの評価を行った。形質調査には、ヘテロシスが現れやすいと言われているF1種子の形質調査を実施し、胚サイズ、種子重量および発芽能について検討した。胚のサイズには交雑の組合せによってヘテロシスが現れ、母性効果と関連している可能性が指摘できた。イネ属内における種間交雑において、インプリンティングが関与した胚乳の発達不良により種子重量が低下することが示唆できた。発芽後3日間シュート長を測定したところ複数の組合せにおいてヘテロシスが確認でき、特に日本晴を雌親としインディカ系統とO.rufipogonおよびO. glaberrimaを雄親とした組合せでは、2日目から3日目のシュートの成長がヘテロシスに対応していることが分かった。ゲノム指標としては、マイクロアレイ解析を実施し、F1個体の葯の反復配列の発現が親に比べて低下することが判明した。以上の結果は、従来のアプローチでは得られない結果であり、本研究の独自の切り口によって明らかになった。研究開始以前の予想とは異なる結論が得られたことも興味深い。

我们一直在进行研究，目的是创建有关水稻杂种的特征指标和基因组指标。关于性状指标，与传统的水稻F1种子相比，跨繁殖组合和菌株的数量显着增加，对于Nipponbara，Koshihikari，Taichikari，Taichung65（T65），Kitaake，Kitaake，Black No. 2（A58），A58），Indica Ir36，Kasalath，Kasalath，Peiku（Peiku（Peiku（Peiku）），敞开（W59） （O. rufipogon）的亚洲水稻种植，以及栽培的非洲大米（O. glaberrima）的WK18和WK21用于穿越。该组合是基于Nihonbari作为参考父母的，并且使用了其他11种菌株，所有这些都处于冲突状态。在3个或更多的重复中测试了这20种F1种子的组合，以高精度评估水稻的整体杂种。在特征调查中，对F1种子的性状调查进行了调查，据说很容易发生杂种，并检查了胚胎大小，种子重量和发芽能力。有人指出，由于杂交的组合，杂种出现在胚胎大小中，这可能与母体作用有关。可以建议，涉及印记的贫困贫困发育可减少水稻属内种间杂交中种子的重量。当发芽后三天测量芽长度时，在多种组合中证实了杂种，发现从第二天到第三天的芽的生长与杂种相对应，尤其是与Nipponhari与Nipponhari组合为女性父母和Indica strains和O. Rufipogon和O. rufipogon和O. Glaberrima。作为基因组指标，进行了微阵列分析，发现与父母相比，F1个体的花药重复序列的表达减少了。上述结果未使用常规方法获得，并通过本研究的独特观点揭示了上述结果。有趣的是，结论与研究开始之前的预测不同。

项目成果

イネゲノム反復配列の発現パターンから見た雄性生殖器官の特徴化

基于水稻基因组重复序列表达模式的雄性生殖器官表征

• 作者: Toriyama K;Kazama T;貴島祐治，石黒聖也，太田雄也，佐藤裕
• 通讯作者: 貴島祐治，石黒聖也，太田雄也，佐藤裕

イネゲノムによるウイルス断片の取り込みとその進化

水稻基因组中病毒片段的整合及其进化

• 发表时间: 2013
• 作者: .A Yasukouchi;T Kozaki,;貴島祐治
• 通讯作者: 貴島祐治

An intact mitochondrial cox1 gene and a pseudogene with different genomic configurations are present in apple cultivars 'Golden Delicious' and 'Delicious' : Evolutionary aspects

苹果品种“金冠”和“美味”中存在完整的线粒体 cox1 基因和具有不同基因组配置的假基因：进化方面

• DOI: 10.1016/j.scienta.2011.05.037
• 发表时间: 2011
• 期刊: Scientia Horticulturae
• 影响因子: 4.3
• 作者: Tetsuo Yasugi;Umetsu Daiki;Satoshi Murakami;Makoto Sato;Tetsuya Tabata;A.Wakatsuki
• 通讯作者: A.Wakatsuki

植物の分子育種学

植物分子育种

• 发表时间: 2011
• 作者: 星野敦;玉田洋介
• 通讯作者: 玉田洋介

イネのゲノム中のAT反復配列は種々のDNAを取り込む進化の原動力

水稻基因组中的 AT 重复序列是进化整合各种 DNA 的驱动力

• 发表时间: 2013
• 期刊: 日本草地学会誌
• 作者: 矢 野峻朗;伊奈深雪;安河内朗;Hung-Lieh Hu;Ya-Hui Chiang;Chien-Chun Lu;小柳香奈子
• 通讯作者: 小柳香奈子