A functional study on the tRNA mimicry complexes in genetic decoding.

基因解码中 tRNA 拟态复合体的功能研究。

• 批准号: 23657071
• 负责人: ITO Koichi
• 金额: $ 2.41万
• 依托单位: The University of Tokyo
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
• 财政年份: 2011
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2011 至 2012
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-23657071/
• 关键词: タンパク質合成; tRNA分子擬態; 遺伝暗号; mRNA品質管理; Gタンパク質; リボソーム; 翻訳終結; 翻訳調節; タンパクs質合成

In order to elucidate the molecular characteristics of tRNA-mimicking proteins involved in genetic decoding and mRNA surveillance, we have conducted following experiments. (i) Structural and Biochemical analyses for the complexes of omnipotent archaeal translation elongation factor (aEF1alpha) with tRNA mimicry proteins (aRF1, aPelota). (ii) Genetic analyses for the functionality of tRNA-mimicking complex on the ribosome. These analyses revealed that the specific regions are located in the binding interface of the tRNA-mimicking complexes and that a novel functional site adjacent to the codon recognition site, on the tip domain that mimics the tRNA anticodon-loop is crucial for their functionality. These novel domains likely participate in decoding and mRNA surveillance, coupled with the GTPase switch function on the ribosome.

为了阐明与遗传解码和mRNA监测有关的模拟tRNA蛋白的分子特征，我们进行了实验后进行了。 （i）用tRNA模拟蛋白（ARF1，apelota）进行无所不能的古细胞翻译伸长因子（AEF1alpha）的复合物的结构和生化分析。 （ii）对核糖体模拟tRNA复合物功能的遗传分析。这些分析表明，特定区域位于模仿tRNA的复合物的结合界面中，并且在模仿tRNA反密码子环路的尖端域上，与密码子识别位点相邻的新功能位点对于它们的功能至关重要。这些新型域可能参与解码和mRNA监视，再加上核糖体上的GTPase开关功能。

项目成果

A Single Amino Acid Substitution Alters Omnipotent eRF1 of Dileptus to Euplotes-type Dualpotent eRF1

单一氨基酸取代将 Dileptus 的全能 eRF1 转变为 Euplotes 型双能 eRF1

• DOI: 10.1016/j.protis.2013.02.004
• 发表时间: 2013
• 期刊: Standard Codon Usage May be Advantageous in Raptorial Ciliates. Protist.
• 作者: Li Y;Kim OT;Ito K;Saito K;Suzaki T,Harumoto T.
• 通讯作者: Suzaki T,Harumoto T.

A Translational Fine-tuning by The Drg2-GTPase/Dfrp2 Complex

Drg2-GTPase/Dfrp2 复合物的翻译微调

• 发表时间: 2011
• 作者: Ryuichiro Ishitani;Kan Kobayashi;Izumi Kikuno;Kazushige Kuroha;Kazuki Saito;Koichi Ito;Toshifumi Inada;and Osamu Nureki;Saito K;Wada M;Kobayashi K;Nureki O;Ishikawa K
• 通讯作者: Ishikawa K

終止コドン解読におけるeRF1とeRF3の共役の解析

终止密码子解码中 eRF1 和 eRF3 耦合分析

• 发表时间: 2013
• 作者: 斎藤和紀;伊藤耕一
• 通讯作者: 伊藤耕一

Translation Termination, In Werner Dubitzky, Olaf Wolkenhauer, Kwang-Hyun Cho, Hiroki Yokota (Eds.), Encyclopedia of systems biology

翻译终止，见 Werner Dubitzky、Olaf Wolkenhauer、Kwang-Hyun Cho、Hiroki Yokota（编辑），系统生物学百科全书

• 发表时间: 2013
• 作者: Saito;K. Ito;K
• 通讯作者: K

Omnipotent Role of Archaeal Elongation Factor 1 Alpha in Translation Elongation, and Termination, and Quality Control of Protein Synthesis

古细菌延伸因子 1 Alpha 在蛋白质合成的翻译延伸、终止和质量控制中的万能作用

• 发表时间: 2011
• 作者: Kan Kobayashi;Kazuki Saito;Ryuichiro Ishitani;Koichi Ito;and Osamu Nureki;Saito K
• 通讯作者: Saito K