Bioinformatics-based functional analysis of telomeric non-coding RNA

基于生物信息学的端粒非编码RNA功能分析

基本信息

批准号：
24650639
负责人：
SEIMIYA Hiroyuki
金额：
$ 2.5万
依托单位：
Japanese Foundation for Cancer Research
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
财政年份：
2012
资助国家：
日本
起止时间：
2012-04-01 至 2014-03-31
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-24650639/
关键词：
テロメア非コードRNA がんバイオインフォマティクス分化

项目摘要

Telomeres are specialized structures that stabilize the genome at the ends of linear chromosomes. Recently, it has been reported that telomeric DNAs are transcribed to non-coding RNAs called TERRA. Since the precise importance of TERRA remains unknown, here we investigated the function of TERRA especially in human cancer cells. As the results, we found that cancer cells with more TERRA expression decrease the expression of protein X, which regulates the growth signal elicited by tyrosine phosphorylation. Telomere elongation enhanced TERRA expression and induced differentiation of cancer cells. These results suggest that TERRA regulates its expression upon the change in telomeric structure and modulates the cancer malignancy. These observations may be utilized for cancer diagnosis and therapeutics.

端粒是稳定线性染色体末端基因组的特殊结构。最近，有报道称端粒 DNA 被转录为称为 TERRA 的非编码 RNA。由于 TERRA 的确切重要性仍不清楚，因此我们在此研究了 TERRA 特别是在人类癌细胞中的功能。结果，我们发现具有更多 TERRA 表达的癌细胞会降低蛋白 X 的表达，该蛋白调节酪氨酸磷酸化引发的生长信号。端粒延长增强了 TERRA 表达并诱导癌细胞分化。这些结果表明 TERRA 根据端粒结构的变化调节其表达并调节癌症恶性肿瘤。这些观察结果可用于癌症诊断和治疗。

项目成果

期刊论文数量（38）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

HDAC8 mutations in Cornelia de Lange syndrome affect the cohesin acetylation cycle.

DOI：
10.1038/nature11316
发表时间：
2012-09-13
期刊：
NATURE
影响因子：
64.8
作者：
Deardorff, Matthew A.;Bando, Masashige;Nakato, Ryuichiro;Watrin, Erwan;Itoh, Takehiko;Minamino, Masashi;Saitoh, Katsuya;Komata, Makiko;Katou, Yuki;Clark, Dinah;Cole, Kathryn E.;De Baere, Elfride;Decroos, Christophe;Di Donato, Nataliya;Ernst, Sarah;Francey, Lauren J.;Gyftodimou, Yolanda;Hirashima, Kyotaro;Hullings, Melanie;Ishikawa, Yuuichi;Jaulin, Christian;Kaur, Maninder;Kiyono, Tohru;Lombardi, Patrick M.;Magnaghi-Jaulin, Laura;Mortier, Geert R.;Nozaki, Naohito;Petersen, Michael B.;Seimiya, Hiroyuki;Siu, Victoria M.;Suzuki, Yutaka;Takagaki, Kentaro;Wilde, Jonathan J.;Willems, Patrick J.;Prigent, Claude;Gillessen-Kaesbach, Gabriele;Christianson, David W.;Kaiser, Frank J.;Jackson, Laird G.;Hirota, Toru;Krantz, Ian D.;Shirahige, Katsuhiko
通讯作者：
Shirahige, Katsuhiko

Targeting glioma stem cells by G-quadruplex ligands

通过 G-四联体配体靶向神经胶质瘤干细胞