転写と共役した遺伝子座の核内局在ダイナミクスの解析

转录耦合基因位点核定位动态分析

• 批准号: 19K06482
• 负责人: 嶋田 美穂
• 金额: $ 2.75万
• 依托单位: Yokohama City University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2019
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2019-03-01 至 2024-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-19K06482/
• 关键词: クロマチン構造; メディエーター; 遺伝子発現; インスレーター; 組換え体たんぱく質; カラムクロマトグラフィー; クロマチン構造変換; CTCF結合; インシュレーター; TAD形成; 遺伝子発現制御; クロマチン; 核内局在

本年度までに精製した、インスレーターを起点としてクロマチンループの形成に必須と考えられている転写因子であるメディエーターとメディエーターと共に機能する伸長因子群を用いて機能解析を行った。メディエーターはプロモーター上に巨大な複合体を呼び込むことで、クロマチンの３次構造を作成する可能性があるために、メディエーターとの結合に必須な領域に変異を入れた変異体も同時に精製し、この仮説を検証した。まず、この変異がメディエーターとの結合に必須であることを結合実験により検証した。また、in vivoでもこの変異体をもつ細胞では、プロモーター上の巨大な複合体形成の阻害が見られ、遺伝子発現にも影響を及ぼした。

使用Mediator（一种被认为对于从绝缘体开始形成染色质环至关重要的转录因子）以及一组与Mediator一起发挥作用的延伸因子（截至今年已被纯化）进行了功能分析。由于介体有可能通过将大型复合物吸引到启动子上来创建三级染色质结构，因此我们同时纯化了与介体结合必需的区域中具有突变的突变体。首先，我们通过结合实验验证了这种突变对于与介体的结合是必需的。此外，在体内，携带该突变体的细胞显示出对启动子上大型复合物形成的抑制，这也影响了基因表达。

项目成果

Vaginal Microbiota and Pregnancy Outcomes of Patients with Conization Histories

• DOI: 10.1089/jwh.2022.0440
• 发表时间: 2023-01-31
• 期刊: JOURNAL OF WOMENS HEALTH
• 影响因子: 3.5
• 作者: Hashiramoto，Shin;Kinjo，Tadatsugu;Aoki，Yoichi
• 通讯作者: Aoki，Yoichi

Two target gene activation pathways for orphan ERR nuclear receptors

• DOI: 10.1038/s41422-022-00774-z
• 发表时间: 2023-01-16
• 期刊: CELL RESEARCH
• 影响因子: 44.1
• 作者: Nakadai，Tomoyoshi;Shimada，Miho;Roeder，Robert G.
• 通讯作者: Roeder，Robert G.

Sumoylation of the human histone H4 tail inhibits p300-mediated transcription by RNA polymerase II in cellular extracts.

• DOI: 10.7554/elife.67952
• 发表时间: 2021-11-08
• 期刊: eLife
• 影响因子: 7.7
• 作者: Leonen CJA;Shimada M;Weller CE;Nakadai T;Hsu PL;Tyson EL;Mishra A;Shelton PM;Sadilek M;Hawkins RD;Zheng N;Roeder RG;Chatterjee C
• 通讯作者: Chatterjee C

Shank2 Binds to aPKC and Controls Tight Junction Formation with Rap1 Signaling during Establishment of Epithelial Cell Polarity

• DOI: 10.1016/j.celrep.2020.02.088
• 发表时间: 2020-04-07
• 期刊: CELL REPORTS
• 影响因子: 8.8
• 作者: Sasaki，Kazunori;Kojitani，Noriko;Ohno，Shigeo
• 通讯作者: Ohno，Shigeo

クロマチン構造変換を伴った遺伝子発現制御機構

伴随染色质结构转换的基因表达控制机制

• 发表时间: 2019
• 作者: Ohnishi T;Balan S;Toyoshima M;Maekawa M;Ohba H;Watanabe A;Iwayama Y;Fujita Y;Tan Y;Hisano Y;Shimamoto-Mitsuyama C;Nozaki Y;Esaki K;Nagaoka A;Matsumoto J;Hino M;Mataga N;Hayashi-Takagi A;Hashimoto K;Kunii Y;Kakita A;Yabe H;Yoshikawa T;棟方有宗;嶋田美穂
• 通讯作者: 嶋田美穂