Development of Computational Methods for Mining Causal Relationships Based on Microscopic Images

基于显微图像的因果关系挖掘计算方法的发展

基本信息

批准号：
19K12226
负责人：
Tohsato Yukako
金额：
$ 2.83万
依托单位：
Ritsumeikan University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份：
2019
资助国家：
日本
起止时间：
2019-04-01 至 2022-03-31
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-19K12226/
关键词：
因果推論時系列データ解析表現型解析 C. elegans データ駆動型解析バイオイメージインフォマティクスシステム生物学物体検出時系列データバイオインフォマティクス顕微鏡画像データ統計的因果推論データマイニング

项目摘要

项目成果

期刊论文数量（7）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

非線形な時系列に対するガウス過程回帰を用いた因果推論

使用高斯过程回归进行非线性时间序列的因果推断

DOI：
发表时间：
2021
期刊：
影响因子：
0
作者：
大山鷹志;遠里由佳子
通讯作者：
遠里由佳子

BD5: An open HDF5-based data format to represent quantitative biological dynamics data

BD5：一种基于 HDF5 的开放数据格式，用于表示定量生物动力学数据

DOI：
10.1371/journal.pone.0237468
发表时间：
2020
期刊：
影响因子：
3.7
作者：
Koji Kyoda; Kenneth H. L. Ho; Yukako Tohsato; Hiroya Itoga; Shuichi Onami
通讯作者：
Shuichi Onami

領域検出における時系列を用いたドメイン適用適応と細胞画像への応用

在区域检测和细胞图像应用中使用时间序列的域自适应适应

DOI：
发表时间：
2021
期刊：
影响因子：
0
作者：
野崎弘晃; 遠里由佳子
通讯作者：
遠里由佳子

生命現象の時空間動態情報の可視化

生物现象时空动态信息可视化

DOI：
发表时间：
2020
期刊：
影响因子：
0
作者：
京田耕司;ホーケネス;糸賀裕弥; 遠里由佳子;大浪修一
通讯作者：
大浪修一

線虫の細胞核の時系列データの HDP-HSMM を用いた分節化

使用 HDP-HSMM 对线虫细胞核的时间序列数据进行分割

DOI：
发表时间：
2020
期刊：
影响因子：
0
作者：
中谷圭志; 遠里由佳子
通讯作者：
遠里由佳子

DOI：
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作者：
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Tohsato Yukako其他文献

Gene Deletion Algorithms for Minimum Reaction Network Design by Mixed-Integer Linear Programming for Metabolite Production in Constraint-Based Models: gDel_minRN

基于约束模型中代谢物生产的混合整数线性规划最小反应网络设计的基因删除算法：gDel_minRN

DOI：
10.1089/cmb.2022.0352
发表时间：
2023
期刊：
影响因子：
1.7
作者：
Tamura Takeyuki;Muto;Tohsato Yukako;Kosaka Tomoyuki
通讯作者：
Kosaka Tomoyuki

NeuroGT: A brain atlas of neurogenic tagging CreER drivers for birthdate-based classification and manipulation of mouse neurons

NeuroGT：神经源标记 CreER 驱动程序的大脑图谱，用于基于出生日期的小鼠神经元分类和操作

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10.1016/j.crmeth.2021.100012
发表时间：
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期刊：
影响因子：
0
作者：
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通讯作者：
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DOI：
10.1016/j.crmeth.2021.100012
发表时间：
2021
期刊：
影响因子：
0
作者：
Hirata Tatsumi;Tohsato Yukako;Itoga Hiroya;Shioi Go;Kiyonari Hiroshi;Oka Sanae;Fujimori Toshihiko;Onami Shuichi
通讯作者：
Onami Shuichi

NeuroGT: A brain atlas of neurogenic tagging CreER drivers for birthdate-based classification and manipulation of mouse neurons

NeuroGT：神经源标记 CreER 驱动程序的大脑图谱，用于基于出生日期的小鼠神经元分类和操作

DOI：
10.1016/j.crmeth.2021.100012
发表时间：
2021
期刊：
影响因子：
0
作者：
Hirata Tatsumi;Tohsato Yukako;Itoga Hiroya;Shioi Go;Kiyonari Hiroshi;Oka Sanae;Fujimori Toshihiko;Onami Shuichi
通讯作者：
Onami Shuichi