Physiological roles of autophagy in commensal and pathogenic C. albicans in host environments
宿主环境中共生和致病性白色念珠菌自噬的生理作用
基本信息
- 批准号:18K07125
- 负责人:
- 金额:$ 2.83万
- 依托单位:
- 依托单位国家:日本
- 项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
- 财政年份:2018
- 资助国家:日本
- 起止时间:2018-04-01 至 2024-03-31
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
我々は、病原真菌Candida albicansのGFP(緑色蛍光タンパク質)によるオートファジーの検出システムを構築し、C. albicansでは栄養に富むYPD培地でも、フラスコバッチ培養すると、糖源の枯渇するタイミングでオートファジーが著しく誘導されることを発見した。その培養過程において、オートファジー不能株であるatg1株は、野生型と増殖曲線において、ほとんど差は見られないものの、メタボローム解析を行った結果、細胞内の代謝物の成分に顕著な差が認められた。このことはC. albicansではオートファジーが強く働くとともに、その機能を代替する機能が存在することが示唆された。続いて、野生型とatg1株の増殖時に経時的にサンプリングを行い、RNAseq解析を行った。得られたカウントデータから、edgeRソフトウエアを用いて、野生株とatg株の発現量の差を経時的に調べた。その結果、atg1株では環境応答にかかわる転写因子の発現量が野生型と比べて顕著に変化していることが分かった。これはC. albicansにおいて、オートファジー以外にも、その役割を代替する生体プロセスを持っていることを示唆していると考えられる。加えて、培養中の細胞内の代謝物の変化についてメタボローム解析を用いて、調べた。その結果においても、atg1株では野生型とは顕著に異なる代謝物のプロファイルを示した。現在、膨大なオミクスデータの解析を完了し、論文へ投稿準備中である。
我们利用致病真菌白色念珠菌中的 GFP(绿色荧光蛋白)构建了自噬检测系统,发现当白色念珠菌在烧瓶中培养时,即使在营养丰富的 YPD 培养基中,当发现糖源耗尽时也会发生自噬。它被显着诱导。在培养过程中,atg1菌株是一种不能自噬的菌株,其生长曲线与野生型几乎没有差异,但代谢组分析显示细胞内代谢成分存在显着差异。这表明自噬在白色念珠菌中发挥着强大的作用,并且存在可以替代它的功能。接下来,在野生型和 atg1 菌株生长过程中随时间采集样本,并进行 RNAseq 分析。根据获得的计数数据,使用edgeR软件检查野生菌株和atg菌株之间表达水平随时间的差异。结果发现,与野生型相比,atg1菌株中参与环境反应的转录因子的表达水平发生了显着变化。这似乎表明白色念珠菌具有除自噬以外的生物过程可以替代其作用。此外,利用代谢组学分析研究了培养过程中细胞内代谢物的变化。结果还表明,atg1 菌株的代谢谱与野生型显着不同。目前我们已经完成了海量组学数据的分析,正准备提交论文。
项目成果
期刊论文数量(2)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Candida albicans の宿主内生存戦略におけるオートファジーの生理機能の解析
自噬在白色念珠菌宿主生存策略中的生理功能分析
- DOI:
- 发表时间:2019
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:小林朋子;鳥居大祐;岩田隆紀;和泉雄一;那須優則;筒井健夫;堀江哲郎,那須優則
- 通讯作者:堀江哲郎,那須優則
Candida albicans のバルクオートファジーの代謝制御における役割の解明
阐明大量自噬在白色念珠菌代谢调节中的作用
- DOI:
- 发表时间:2021
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Nobuyuki Kobayashi;Akiko Ichinose;Tohru Miyoshi-Akiyama;Teruo Kirikae;Fuminori Mizukoshi;Jin Takasaki;Ken Ohta;堀江哲郎
- 通讯作者:堀江哲郎
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