レジオネラ属菌感染リスク評価のためのアメーバ内動態と菌種間相互作用に関する研究

研究阿米巴体内的动态和细菌种类之间的相互作用，以评估军团菌感染的风险。

• 批准号: 19K12376
• 负责人: 中西 典子
• 金额: $ 2.75万
• 依托单位: Kobe Institute of Health
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2019
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2019-04-01 至 2024-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-19K12376/
• 关键词: レジオネラ属菌; アメーバ; 全ゲノム解析; RNA-Seq; 比較ゲノム; アメーバ類; 増殖能; 菌種間相互作用; 比較ゲノム解析; RNA-seq

本研究では、アメーバ内のレジオネラ属菌種間の相互作用に着目し、アメーバ内での動態およびゲノムワイドな多株比較解析からレジオネラ属菌種間のゲノム上の可動性遺伝領域の構造及び組換えの実態を明らかにし、さらにオミクス解析によるアメーバ内のレジオネラ属菌の挙動を分子レベルで明らかにする。本年度は、レジオネラ症が発生した施設について、施設環境調査でL.pneumophilaSG1,SG2,SG3,SG6,SG10, L.maceachernii,L.londiniensisが分離された。また、宿主アメーバとして、Hartmannella.sppとVermamoeba vermiformisを検出したことから、これらの宿主アメーバに寄生することで施設の消毒を逃れていた可能性が考えられた。さらに、同一患者から分離された株をすべてゲノム解析したところ、SNVは0～41個の範囲で多様性があり、同時に複数の遺伝系統に暴露されたことが示唆された。2018年、2019年に種々の環境から分離して室温放置していた無栄養寒天培地からAcanthamoeba、Hartmannella、Naegleriaが発育してくることを確認したが、液体培地での増殖には至っていないので、無菌化条件や様々な液体培地を検討する必要がある。また、種々の環境からL. pneumophilaとともに分離されたレジオネラ属菌の代表株である浴槽室由来のL. londiniensis、L. israelensis、L. micdadei、L. cherrii、L. rubrilucens、冷却塔由来のL. rubrilucens、L. anisa、土壌由来のL. longbeachaeについてNanoporeを用いて完全長配列の決定を進めた。今後、宿主アメーバ標準株および種々の環境から分離したアメーバ内でのレジオネラ属菌の挙動を把握するためにオミクス解析を実施する。

在这项研究中，我们重点研究了阿米巴内军团菌之间的相互作用，并分析了阿米巴内的动态和全基因组多菌株比较分析，以确定军团菌之间基因组上移动遗传区域的结构和组织。将阐明易位的实际状态，并通过组学分析在分子水平上进一步阐明阿米巴体内军团菌的行为。今年，在发生军团病的设施中，在设施环境调查中分离出了嗜肺军团菌 SG1、SG2、SG3、SG6、SG10、L. maceachernii 和 L. londiniensis。此外，由于检测到Hartmannella.spp和Vermamoeba vermiformis作为宿主阿米巴原虫，因此认为病毒可能通过寄生这些宿主阿米巴原虫而逃脱了设施的消毒。此外，对同一患者分离的所有菌株的基因组分析显示，SNV 范围从 0 到 41 不等，表明该患者同时暴露于多种遗传谱系。 2018年和2019年，我们确认棘阿米巴、哈特曼氏菌和耐格里阿米巴原虫是从从各种环境中分离出来并置于室温下的非营养琼脂培养基中生长的，但它们并未在灭菌条件和各种液体培养基中生长。需要考虑。此外，来自浴缸的 L. londiniensis、L. israelensis、L. micdadei、L. cherrii 和 L. rubrilucens 是与来自各种环境的嗜肺军团菌和来自冷却塔的 L. 一起分离出的军团菌的代表菌株。我们继续使用 Nanopore 确定了 L. rubrilucens、L. anisa 和土壤来源的 L. longbeachae 的全长序列。未来，我们将进行组学分析，以了解军团菌在宿主阿米巴标准菌株和从各种环境中分离的阿米巴中的行为。

项目成果

Evaluation of <i>Legionella pneumophila</i> SGUT Serotypes Isolated from Bath Water Using a Multiplex-PCR Serotyping Assay

使用多重 PCR 血清分型测定评估从洗澡水中分离的嗜肺军团菌 SGUT 血清型

• DOI: 10.7883/yoken.jjid.2022.397
• 发表时间: 2023
• 期刊: Japanese Journal of Infectious Diseases
• 影响因子: 2.2
• 作者: Komatsu Shoko;Tanaka Shinobu;Nakanishi Noriko
• 通讯作者: Nakanishi Noriko

Acquisition of antimicrobial-resistant variants in repeated infections caused by Pseudomonas aeruginosa

铜绿假单胞菌引起的重复感染中耐药变异体的获得

• 发表时间: 2020
• 作者: Kayo Osawa;Noriko Nakanishi;Mari Kusuki;Katsumi Shigemura;Takayuki Miyara:
• 通讯作者: Takayuki Miyara:

市内温泉施設における緊急事態宣言後のレジオネラ属菌の検出状況と遺伝子型の推移

宣布紧急事态宣言后全市温泉设施军团菌检测状况及基因型变化趋势

• 发表时间: 2021
• 期刊: 神戸市健康科学研究所報
• 作者: 小松頌子 ;中西典子; 岩本朋忠
• 通讯作者: 岩本朋忠

The genetic characterization of L. pneumophila SG1 isolates from bath water in Kobe City, Japan.

日本神户市洗澡水中分离出的嗜肺军团菌 SG1 的遗传特征。

• 发表时间: 2022
• 作者: Shoko Komatsu;Shinobu Tanaka;Ryohei Nomoto;Noriko Nakanishi
• 通讯作者: Noriko Nakanishi

Whole-Genome analysis of L. pneumophila strains causing outbreak at bath facility in Kobe, Japan.

对导致日本神户洗浴设施爆发的嗜肺军团菌菌株进行全基因组分析。

• 发表时间: 2022
• 作者: Noriko Nakanishi;Shoko Komatsu;Shinobu Tanaka;Ryohei Nomoto.
• 通讯作者: Ryohei Nomoto.