免疫遺伝子発現シグネチャーによる食道がん術前化学療法の奏効予測
使用免疫基因表达特征预测食管癌新辅助化疗的反应
基本信息
- 批准号:19K09206
- 负责人:
- 金额:$ 2.83万
- 依托单位:
- 依托单位国家:日本
- 项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
- 财政年份:2019
- 资助国家:日本
- 起止时间:2019-04-01 至 2021-03-31
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
食道扁平上皮癌73症例のサンプルをご提供いただき、解析を行った。性別は男性60症例、女性13症例であった。術前化学療法の奏効性はResponder 54症例、Non-responder 19症例であった。腫瘍組織を浸潤T細胞の多寡に基づいて、Hot, Coldの二群に分類した。具体的にはRNA-Seqで得られた遺伝子発現量から、Spranger et al, 2015のT細胞シグネチャー13遺伝子 (CD8A, ICOS, CXCL9, CXCL10, GZMK, IRF1, HLA-DOA, HLA-DOB, HLA-DMA, HLA-DMB, CCL2, CCL3, CCL4)の値を抽出し、これに階層的クラスタリング法を適用した。36症例がHot群、37症例がCold群に分類された。術前化学療法の奏効率はHotクラスにおいて86.1% (31/36)、Coldクラスにおいて62.2% (23/37)であり、オッズ比は3.71 (95%信頼区間1.07-15.10)、Fisher検定によるp値は0.032であり、統計学的に有意な差が認められた。性別との関連では、男性における奏効率が73.3% (44/60)、女性で76.9% (10/13)であり、統計的有意差は見られなかった。すなわち食道扁平上皮癌の腫瘍内微小環境、特に浸潤T細胞量が、術前化学療法の高い奏効率と関連することが確認された。今後の研究の展開としては、T細胞以外の免疫細胞と化学療法奏効性の関連を調べることが考えられる。
提供并分析了 73 例食管鳞状细胞癌的样本。从性别看,男性60例,女性13例。术前化疗对 54 名有反应者和 19 名无反应者有效。根据浸润 T 细胞的数量,肿瘤组织分为两组:热组和冷组。具体来说,从RNA-Seq获得的基因表达水平中,我们提取了13个T细胞特征基因(CD8A、ICOS、CXCL9、CXCL10、GZMK、IRF1、HLA-DOA、HLA-DOB、HLA-DMA)的值、HLA-DMB、CCL2、CCL3、CCL4)并对它们应用层次聚类方法。热组36例,寒组37例。热类中新辅助化疗的缓解率为 86.1% (31/36),冷类中新辅助化疗的缓解率为 62.2% (23/37),比值比为 3.71(95% 置信区间 1.07-15.10),p by Fisher's检验值为0.032,差异有统计学意义。就性别而言,男性的应答率为73.3%(44/60),女性的应答率为76.9%(10/13),没有观察到统计学上的显着差异。换句话说,证实食管鳞癌的瘤内微环境,特别是浸润T细胞的数量,与术前化疗的高反应率相关。未来的研究可以探索 T 细胞以外的免疫细胞与化疗效果之间的关系。
项目成果
期刊论文数量(10)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Integrated exome and RNA sequencing of dedifferentiated liposarcoma
- DOI:10.1038/s41467-019-13286-z
- 发表时间:2019-12-12
- 期刊:
- 影响因子:16.6
- 作者:Hirata, Makoto;Asano, Naofumi;Matsuda, Koichi
- 通讯作者:Matsuda, Koichi
12 new susceptibility loci for prostate cancer identified by genome-wide association study in Japanese population
- DOI:10.1038/s41467-019-12267-6
- 发表时间:2019-09-27
- 期刊:
- 影响因子:16.6
- 作者:Takata, Ryo;Takahashi, Atsushi;Nakagawa, Hidewaki
- 通讯作者:Nakagawa, Hidewaki
eVIDENCE: a practical variant filtering for low-frequency variants detection in cell-free DNA
- DOI:10.1038/s41598-019-51459-4
- 发表时间:2019-01-01
- 期刊:
- 影响因子:4.6
- 作者:Mizuno, Kei.
- 通讯作者:Mizuno, Kei.
Genomic analysis of pancreatic juice DNA assesses malignant risk of intraductal papillary mucinous neoplasm of pancreas
- DOI:10.1002/cam4.2340
- 发表时间:2019-08-01
- 期刊:
- 影响因子:4
- 作者:Mateos, Raul N.;Nakagawa, Hidewaki;Fujita, Masashi
- 通讯作者:Fujita, Masashi
Comprehensive analysis of indels in whole-genome microsatellite regions and microsatellite instability across 21 cancer types
- DOI:10.1101/gr.255026.119
- 发表时间:2020-03-01
- 期刊:
- 影响因子:7
- 作者:Fujimoto, Akihiro;Fujita, Masashi;Nakagawa, Hidewaki
- 通讯作者:Nakagawa, Hidewaki
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Hiyama E
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