Molecular mechanisms of a Condensin molecular motor explored by DNA curtain assays and coarse-grained molecular dynamics simulations

通过 DNA 帘式分析和粗粒度分子动力学模拟探索 Condensin 分子马达的分子机制

• 批准号: 19H03194
• 负责人: Terakawa Tsuyoshi
• 金额: $ 11.56万
• 依托单位: Kyoto University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
• 财政年份: 2019
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2019-04-01 至 2022-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-19H03194/
• 关键词: １分子蛍光イメージング; DNAカーテン; 粗視化分子動力学シミュレーション; コンデンシン; 蛍光顕微鏡観察; 一分子実験; 分子モーター

项目成果

The lane switch mechanism: Nucleosome repositioning induced by a DNA translocase

泳道切换机制：DNA 易位酶诱导的核小体重新定位

• 发表时间: 2021
• 作者: Fritz Nagae;Giovanni B. Br;ani;Shoji Takada;Tsuyoshi Terakawa
• 通讯作者: Tsuyoshi Terakawa

Reconstitution of protein functions on chromatin curtain

染色质幕上蛋白质功能的重建

• 发表时间: 2020
• 作者: 寺川剛

Single-molecule junction spontaneously restored by DNA zipper

DNA拉链自发恢复单分子连接

• DOI: 10.1038/s41467-021-25943-3
• 发表时间: 2021
• 影响因子: 16.6
• 作者: Harashima Takanori;Fujii Shintaro;Jono Yuki;Terakawa Tsuyoshi;Kurita Noriyuki;Kaneko Satoshi;Kiguchi Manabu;Nishino Tomoaki
• 通讯作者: Nishino Tomoaki

Modeling of DNA binding to the condensin hinge domain using molecular dynamics simulations guided by atomic force microscopy

使用原子力显微镜引导的分子动力学模拟对 DNA 与凝聚蛋白铰链结构域的结合进行建模

• DOI: 10.1371/journal.pcbi.1009265
• 发表时间: 2021
• 作者: Koide Hiroki;Kodera Noriyuki;Bisht Shveta;Takada Shoji;Terakawa Tsuyoshi
• 通讯作者: Terakawa Tsuyoshi

Reconstitution of protein functions on chromatin curtain

染色质幕上蛋白质功能的重建

• 发表时间: 2020
• 作者: 寺川剛