Whlole genome analysis in exosome from dilated cardiomyopathy occurred by aging

衰老引起的扩张型心肌病外泌体的全基因组分析

基本信息

批准号：
21H03358
负责人：
水上洋一
金额：
$ 11.07万
依托单位：
Yamaguchi University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
财政年份：
2021
资助国家：
日本
起止时间：
2021-04-01 至 2024-03-31
项目状态：
已结题

项目摘要

ヒトは老化に伴い、様々な病気の発症頻度が急激に増加する。心臓は24時間働き続けており加齢の影響が出やすく、心拍数の多さが寿命に関係していると言われている。実際に加齢に伴って心筋症や不整脈など心疾患が増加している。これらの疾患は、DNA変異が関与していることがわかってきており、遺伝性と後天的（孤発性）変異のケースがある。遺伝性の拡張型心筋症は親族の病歴や血液ゲノムの解析から疾患変異が解析されている。しかし、後天的な遺伝子変異の解析は量の関係で不可能であった。研究代表者らは0.2mgの組織から高純度のゲノムDNAを数ng抽出に成功したが、微量のため全ゲノム遺伝子解析はできなかった。そこで過去の心筋症原因遺伝子と報告された2987領域に対するプライマーを設計し、次世代シーケンサーで変異遺伝子を同定した。さらに蛋白質をコードしている領域すべてに対するプライマーで増幅し変異を解析する技術を確立した。その結果、新規の孤発性心筋症特異的な遺伝子変異を発見した。この変異が拡張型心筋症を発症するか検証するため、マウス個体のゲノム編集技術であるi-GONAD法を確立し、この心筋症変異マウスで拡張型心筋症の再現に成功した。しかし、この技術では全ての後天的心筋症の原因遺伝子を行うことができず、抜本的な診断手法の改善が求められる。分泌される小胞(exosome)に存在する癌遺伝子変異が存在することが報告されていることから、分泌小胞内に全遺伝子解析技術の検討を行った。

随着人类年龄的增长，各种疾病的发病率迅速增加。心脏每天24小时都在工作，很容易受到衰老的影响，据说心率高与长寿有关。事实上，心肌病、心律失常等心脏病随着年龄的增长而增加。已知这些疾病与 DNA 突变有关，并且存在遗传性和获得性（散发性）突变的病例。根据亲属病史和血液基因组分析，对遗传性扩张型心肌病的疾病突变进行了分析。然而，由于数量限制，无法对获得性基因突变进行分析。尽管主要研究人员成功从0.2毫克组织中提取了几纳克的高纯度基因组DNA，但由于数量太少，无法进行全基因组基因分析。因此，我们针对之前报道的导致心肌病的2987区域设计了引物，并使用下一代测序仪来鉴定突变基因。此外，我们建立了一种使用所有蛋白质编码区域的引物来放大和分析突变的技术。结果，我们发现了散发性心肌病特有的新基因突变。为了验证这种突变是否会导致扩张型心肌病，我们建立了i-GONAD方法，这是一种针对个体小鼠的基因组编辑技术，并成功在这种心肌病突变小鼠中复制了扩张型心肌病。然而，这项技术无法识别所有获得性心肌病的致病基因，需要对诊断方法进行大幅改进。由于有报道分泌囊泡（外泌体）中存在癌症基因突变，因此我们研究了分泌囊泡内的全基因分析技术。

项目成果

期刊论文数量（7）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

加齢に伴って変化する子宮遺伝子群のトランスクリプトーム解析

随年龄变化的子宫基因簇的转录组分析

DOI：
发表时间：
2021
期刊：
影响因子：
0
作者：
諌山慧士朗;渡邉健司;坂口修一;村田智昭;水上洋一
通讯作者：
水上洋一

Hydrogen sulfide suppresses the proliferation of intestinal epithelial cells through cell cycle arrest

硫化氢通过细胞周期阻滞抑制肠上皮细胞的增殖

DOI：
10.1016/j.abb.2021.109044
发表时间：
2021
期刊：
影响因子：
3.9
作者：
Xu Wenxi;Watanabe Kenji;Mizukami Yoichi;Yamamoto Yoshinari;Suzuki Takuya
通讯作者：
Suzuki Takuya

高濃度トレハロースを用いた自家細胞由来3次元皮膚シート作製法開発

开发使用高浓度海藻糖的自体细胞3D皮肤片的制造方法

DOI：
发表时间：
2021
期刊：
影响因子：
0
作者：
武藤潤;福田信治;渡邊健司;水上洋一;佐山浩二
通讯作者：
佐山浩二

GRP78 Antibodies Are Associated With Blood-Brain Barrier Breakdown in Anti-Myelin Oligodendrocyte Glycoprotein Antibody-Associated Disorder

GRP78 抗体与抗髓磷脂少突胶质细胞糖蛋白抗体相关疾病中的血脑屏障破坏相关

DOI：
10.1212/nxi.0000000000001038
发表时间：
2021
期刊：
影响因子：
0
作者：
Shimizu F; Ogawa R; Mizukami Y; Watanabe K; Hara K; Kadono C; Takahashi T; Misu T; Takeshita Y; Sano Y; Fujisawa M; Maeda T; Nakashima I; Fujihara K; K;a T.
通讯作者：
a T.

犬のリンパ球における5-アミノレブリン酸のIL-17産生増強作用

5-氨基乙酰丙酸对狗淋巴细胞IL-17产生的促进作用