Transmission of SARS-CoV-2 and influenza viruses

SARS-CoV-2 和流感病毒的传播

• 批准号: 21H03184
• 负责人: 中屋 隆明
• 金额: $ 11.15万
• 依托单位: Kyoto Prefectural University of Medicine
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
• 财政年份: 2021
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2021-04-01 至 2024-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-21H03184/
• 关键词: ウイルス; SARS-CoV-2; インフルエンザウイルス; 伝播機構; 薬剤耐性ウイルス; コロナウイルス; COVID-19; 飛沫; インフルエンザ; ウイルス粒子構造

１．「コロナウイルスの生体（皮膚）表面および環境中におけるウイルス粒子安定性の解析」OC43ヒトコロナウイルスの環境下での感染力の経時変化（残存性）を解析した（Microbiol Spectr. 2023 Feb 22;11(2):e0238122.）。また、これまでに報告されている疫学上懸念されるSARS-CoV-2変異ウイルス（VOC）を用いた解析を行い、進化に伴うウイルス粒子の環境中安定性の変遷を評価した。その結果、武漢株（パンデミック発生時）から順に出現したアルファ株、ベータ株、ガンマ株、デルタ株、オミクロン株（BA.1およびBA.2）の環境中（プラスチック上、皮膚上）の残存時間（中央値）はそれぞれ8.6、19.6，11.0，16.8および21.1，22.5時間でありオミクロン株の環境中安定性が高いことが示唆された。一方で、上記全ての株は35%エタノール処理により15秒以内に完全に失活することも明らかにした（Clin Microbiol Infect. 2022 Nov;28(11):1486-1491.）。２．「COVID-19感染者におけるウイルス変異の意義を探求する研究」主に長期間ウイルスを保持している免疫抑制下のCOVID-19感染者におけるウイルス遺伝子型の経時的変化を解析した。その中で、抗ウイルス薬である抗体医薬（sotrovimab）およびremdesivirに対する薬剤耐性ウイルスの出現とそのウイルス学的解析を行い、スパイクタンパク質とRNA dependent RNA polymeraseに耐性変異を見出した。これらの得られた成果をまとめて論文投稿中である。

1. “冠状病毒在活体（皮肤）表面和环境中的病毒颗粒稳定性分析”我们分析了环境中OC43人类冠状病毒感染性的时间变化（持续性）（Microbiol Spectr. 2023年2月22日；11（2）： e0238122。）。我们还使用先前报道的流行病学关注的 SARS-CoV-2 突变病毒 (VOC) 进行了分析，并评估了病毒颗粒在进化过程中环境稳定性的变化。结果，从武汉菌株（在（中位值）分别为 8.6、19.6、11.0、16.8 和 21.1、22.5 小时，表明 Omicron 菌株在环境中具有较高的稳定性。另一方面，还揭示了通过用35％乙醇处理，所有上述菌株在15秒内完全失活(Clin Microbiol Infect.2022 Nov;28(11):1486-1491.)。 2. “研究探索病毒突变在 COVID-19 感染者中的重要性”我们分析了长期主要携带病毒的免疫抑制的 COVID-19 感染者中病毒基因型随时间的变化。其中，我们对抗病毒药物抗体药物（索托维单抗）和瑞德西韦出现耐药病毒进行了病毒学分析，发现刺突蛋白和RNA依赖性RNA聚合酶存在耐药突变。目前正在提交一份总结这些结果的论文。

项目成果

An autopsy case of COVID ‐19 with a sudden death: Clinico‐pathological comparison

<scp>COVID</scp> ‐19猝死尸检病例：临床病理比较

• DOI: 10.1002/ccr3.5961
• 发表时间: 2022
• 影响因子: 0.7
• 作者: Shishido‐Hara Yukiko;Furukawa Keizo;Nishio Manabu;Honda Kohei;T;o So;Yaoi Takeshi;Kawamoto Masataka;Maehara Yosuke;Nakaya Takaaki;Itoh Kyoko
• 通讯作者: Itoh Kyoko

Downregulation of calcium-regulated heat stable protein 1 expression by low-temperature stimulation causes reduction of interferon-β expression and sensitivity to influenza viral infection

低温刺激下调钙调节热稳定蛋白1表达导致干扰素-β表达和对流感病毒感染的敏感性降低

• DOI: 10.1016/j.virusres.2021.198659
• 发表时间: 2022
• 作者: Nishioka K; Daidoji T; Nakaya T.
• 通讯作者: Nakaya T.

Evaluation of Environmental Stability and Disinfectant Effectiveness for Human Coronavirus OC43 on Human Skin Surface

人冠状病毒OC43对人体皮肤表面的环境稳定性及消毒效果评价

• DOI: 10.1128/spectrum.02381-22
• 发表时间: 2023
• 影响因子: 3.7
• 作者: Watanabe Naoto;Hirose Ryohei;Yamauchi Katsuma;Miyazaki Hajime;B;ou Risa;Yoshida Takuma;Doi Toshifumi;Inoue Ken;Dohi Osamu;Yoshida Naohisa;Uchiyama Kazuhiko;Ishikawa Takeshi;Takagi Tomohisa;Konishi Hideyuki;Ikegaya Hiroshi;Nakaya Takaaki;Itoh Yoshito
• 通讯作者: Itoh Yoshito

Stimulation of IFN-beta responses by aberrant SARS-CoV-2 small viral RNAs

异常 SARS-CoV-2 小病毒 RNA 刺激 IFN-β 反应

• 发表时间: 2022
• 作者: 荒井泰葉

Differences in environmental stability among SARS-CoV-2 variants of concern: both omicron BA.1 and BA.2 have higher stability

值得关注的 SARS-CoV-2 变种环境稳定性差异：omicron BA.1 和 BA.2 均具有更高的稳定性

• DOI: 10.1016/j.cmi.2022.05.020
• 发表时间: 2022
• 影响因子: 14.2
• 作者: Hirose Ryohei;Itoh Yoshito;Ikegaya Hiroshi;Miyazaki Hajime;Watanabe Naoto;Yoshida Takuma;B;ou Risa;Daidoji Tomo;Nakaya Takaaki
• 通讯作者: Nakaya Takaaki