Development of a new functional genomics mothod to perform single-cell enhancer identification

开发一种新的功能基因组学方法来进行单细胞增强子鉴定

基本信息

批准号：
20K21407
负责人：
Murakawa Yasuhiro
金额：
$ 4.16万
依托单位：
Institute of Physical and Chemical Research
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
财政年份：
2020
资助国家：
日本
起止时间：
2020-07-30 至 2022-03-31
项目状态：
已结题

项目摘要

项目成果

期刊论文数量（23）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

APOBEC3B is preferentially expressed at the G2/M phase of cell cycle

APOBEC3B 优先在细胞周期的 G2/M 期表达

DOI：
10.1016/j.bbrc.2021.02.008
发表时间：
2021
期刊：
影响因子：
3.1
作者：
Hirabayashi Shigeki;Shirakawa Kotaro;Horisawa Yoshihito;Matsumoto Tadahiko;Matsui Hiroyuki;Yamazaki Hiroyuki;Sarca Anamaria Daniela;Kazuma Yasuhiro;Nomura Ryosuke;Konishi Yoshinobu;Takeuchi Suguru;Stanford Emani;Kawaji Hideya;Murakawa Yasuhiro;Takaori
通讯作者：
Takaori

A new genomic and computational approach to study human genomic enhancers and its association with diseases

研究人类基因组增强子及其与疾病关联的新基因组和计算方法

DOI：
发表时间：
2021
期刊：
影响因子：
0
作者：
村川泰裕
通讯作者：
村川泰裕

Identification of Transcriptional Regulators Using Novel Next-generation Sequencing Technology

使用新型下一代测序技术鉴定转录调节因子

DOI：
发表时间：
2021
期刊：
影响因子：
0
作者：
村川泰裕
通讯作者：
村川泰裕

Expression of matrix metalloproteinase‐3 and ‐10 is up‐regulated in the periodontal tissues of aged mice

老年小鼠牙周组织中基质金属蛋白酶-3和-10的表达上调

DOI：
10.1111/jre.12996
发表时间：
2022
期刊：
影响因子：
3.5
作者：
Kageyama Yoko;Nakamura Megumi;Igari Yohei;Yamaguchi Satoshi;Oguchi Akiko;Murakawa Yasuhiro;Hattori Yoshinori;Sasano Yasuyuki
通讯作者：
Sasano Yasuyuki

RNAの生死から俯瞰する遺伝⼦発現制御

从RNA生与死的鸟瞰角度进行基因表达控制

DOI：
发表时间：
2021
期刊：
影响因子：
0
作者：
村川泰裕
通讯作者：
村川泰裕

DOI：
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作者：
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Murakawa Yasuhiro其他文献

Prediction of the cell-type-specific transcription of non-coding RNAs from genome sequences via machine learning

通过机器学习从基因组序列预测非编码 RNA 的细胞类型特异性转录

DOI：
10.1038/s41551-022-00961-8
发表时间：
2022
期刊：
影响因子：
28.1
作者：
Koido Masaru;Hon Chung;Koyama Satoshi;Kawaji Hideya;Murakawa Yasuhiro;Ishigaki Kazuyoshi;Ito Kaoru;Sese Jun;Parrish Nicholas F.;Kamatani Yoichiro;Carninci Piero;Terao Chikashi
通讯作者：
Terao Chikashi

CAGE-Seq Reveals that HIV-1 Latent Infection Does Not Trigger Unique Cellular Responses in a Jurkat T Cell Model

CAGE-Seq 揭示 HIV-1 潜伏感染不会在 Jurkat T 细胞模型中触发独特的细胞反应

DOI：
10.1128/jvi.02394-20
发表时间：
2021
期刊：
影响因子：
5.4
作者：
Matsui Hiroyuki;Shirakawa Kotaro;Konishi Yoshinobu;Hirabayashi Shigeki;Sarca Anamaria Daniela;Fukuda Hirofumi;Nomura Ryosuke;Stanford Emani;Horisawa Yoshihito;Kazuma Yasuhiro;Matsumoto Tadahiko;Yamazaki Hiroyuki;Murakawa Yasuhiro;Battivelli Emilie;Verdin
通讯作者：
Verdin

Significance of HMGA2 expression as independent poor prognostic marker in perihilar and distal cholangiocarcinoma resected with curative intent

HMGA2 表达作为治疗性切除的肺门周围和远端胆管癌独立不良预后标志物的意义

DOI：
10.1016/j.ejso.2020.08.005
发表时间：
2021
期刊：
影响因子：
0
作者：
Takahashi Tomoaki;Kawaji Hideya;Murakawa Yasuhiro;Hayashizaki Yoshihide;Murakami Takashi;Yabushita Yasuhiro;Homma Yuki;Kumamoto Takafumi;Matsuyama Ryusei;Endo Itaru
通讯作者：
Endo Itaru

Codon bias confers stability to human mRNAs

密码子偏倚赋予人类 mRNA 稳定性

DOI：
10.15252/embr.201948220
发表时间：
2019
期刊：
影响因子：
7.7
作者：
Hia Fabian;Yang Sheng Fan;Shichino Yuichi;Yoshinaga Masanori;Murakawa Yasuhiro;V;enbon Alexis;Fukao Akira;Fujiwara Toshinobu;L;thaler Markus;Natsume Tohru;Adachi Shungo;Iwasaki Shintaro;Takeuchi Osamu
通讯作者：
Takeuchi Osamu

HTLV-1 bZIP factor suppresses TDP1 expression through inhibition of NRF-1 in adult T-cell leukemia

HTLV-1 bZIP 因子通过抑制成人 T 细胞白血病中的 NRF-1 来抑制 TDP1 表达

DOI：
10.1038/s41598-017-12924-0
发表时间：
2017
期刊：
影响因子：
4.6
作者：
Takiuchi Yoko;Kobayashi Masayuki;Tada Kohei;Iwai Fumie;Sakurada Maki;Hirabayashi Shigeki;Nagata Kayoko;Shirakawa Kotaro;Shindo Keisuke;Yasunaga Jun;Murakawa Yasuhiro;Rajapakse Vinodh;Pommier Yves;Matsuoka Masao;Takaori
通讯作者：
Takaori