エンハンサープロファイリングによる造血器腫瘍の分子病態理解と治療法の開発

了解造血肿瘤的分子病理学并使用增强子分析开发治疗方法

基本信息

批准号：
18K19960
负责人：
三田貴臣
金额：
$ 39.44万
依托单位：
Nagoya City University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Fund for the Promotion of Joint International Research (Home-Returning Researcher Development Research)
财政年份：
2020
资助国家：
日本
起止时间：
2020-04-01 至 2024-03-31
项目状态：
已结题

项目摘要

三年度においては、二年度に引き続いて、成人Ｔ細胞性白血病（ATL）、形質細胞白血病（PCL）と多発性骨髄腫（MM）、びまん性大細胞性リンパ腫（DLBCL）と二次性白血病を対象として、エンハンサー解析、遺伝子発現解析とゲノム解析を行った。まず、ATLに関して、前年度までに同定した遺伝子異常に注目して機能解析を行った。特にTP73遺伝子に着目し、スーパーエンハンサーが存在する部位に一致してDNA切断点が認められ、これらがエキソン2と3の欠失を招いてTP73遺伝子の機能変化をもたらし、結果的にATL細胞の増殖促進に働く可能性があることを報告した。また、新たに同定した新規non-coding RNAに関して、CRISPR/Cas9やRNA-seqを用いてその機能解析を行った。次に、PCLに関して、MMから二次性PCLに進展したケースに注目し、同一患者由来の複数のステージや異なる病変（骨髄、末梢血、胸水）からのサンプルを用いて、全ゲノム解析と遺伝子発現解析を行った。データ解析により、全ての段階で共通して認められる遺伝子異常、並びに、それぞれのサンプルで特徴的に認められる異常を選定した。例えば、KRAS遺伝子の変異がMMの段階から全てのサンプルで認められた一方で、PCLの段階で骨髄や末梢血サンプルのみで認められる異常が存在しており、それぞれが別のクローンとして進化している可能性が示唆された。また、DLBCLへの化学療法を契機に慢性単球性白血病と急性骨髄性白血病を発症した例について全ゲノム解析を行い、MLL遺伝子を含む新たな染色体転座を同定し、急性骨髄性白血病への進展時にKRAS遺伝子の変異を新たに獲得して、これらが白血病クローンの形質転換に寄与した可能性を報告した。

在2013财年，在2013财年之后，对成人T细胞白血病（ATL），浆细胞白血病（PCL），多发性骨髓瘤（MM），差异大细胞淋巴瘤（DLBCL）和次生白血病进行了增强子分析，基因表达分析和基因组分析。首先，进行功能分析，并注意上一年鉴定出的遗传异常。我们特别关注TP73基因，并报道发现DNA断点与超级体现者存在的位点一致，并且这些可能导致外显子2和3的缺失，从而导致TP73基因的功能变化，从而导致ATL细胞增殖的促进。此外，使用CRISPR/CAS9和RNA-SEQ对新鉴定的新型非编码RNA进行了功能分析。接下来，我们专注于PCL从MM从MM发展到次级PCL的病例，并且使用来自同一患者的多个阶段和不同病变（骨髓，外周血，胸膜积液）的样品进行了整个基因组分析和基因表达分析。数据分析在每个样本中通常发现的所有阶段中通常发现的基因异常以及异常。例如，尽管在MM阶段的所有样品中都观察到KRAS基因中的突变，但在PCL阶段，只有在骨髓和外周血样本中观察到的异常，这表明每个人都可能作为单独的克隆演变而来。我们还对DLBCL化学疗法进行了慢性单核细胞白血病和急性髓样白血病的病例进行了全基因组分析，并确定了含有MLL基因的新染色体易位，并报道KRAS基因的新突变在急性骨髓白血病的发展过程中得到了促成和贡献的贡献，这些突变是在急性髓样白血病的开发过程中得到的。