Synthetic lethality with gene silencing

基因沉默的综合致死率

基本信息

批准号：
21H02773
负责人：
牛島俊和
金额：
$ 11.23万
依托单位：
Hoshi University (2022-2023)National Cancer Center Japan (2021)
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
财政年份：
2021
资助国家：
日本
起止时间：
2021-04-01 至 2024-03-31
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-21H02773/
关键词：
エピゲノム合成致死 DNAメチル化

项目摘要

遺伝子機能欠失を利用した創薬のために合成致死が注目されているが、利用可能な突然変異が少ないためにこれまでの成功例は限られる。研究代表者は、従来、DNAメチル化異常は突然変異に比べて非常に多く存在することを見いだしており、研究開始前までに、FAT4遺伝子のDNAメチル化異常がβ-catenin阻害と合成致死である可能性も見いだした。本研究では、新たなDNAメチル化合成致死を着実に得ると同時に、合成致死の全く新しい起点となるエピゲノム異常を解明する。2年目の本年度は、メチル化合成致死の新規組み合わせとしてSMARCA1メチル化とピリミジン合成経路の阻害の組み合わせを同定した。この組み合わせの有用性を実験的に検証するために、SMARCA1がメチル化されている細胞株（44As3、AGS、GC2、KatoIII、RKO）、及び、メチル化されていない細胞株（MKN7、MKN45、N87、TMK1、HT29、T84）をピリミジン合成経路阻害剤BAY 2402234で処理した。その結果、メチル化細胞株においては増殖抑制が認められたにに対して、非メチル化細胞株では認められなかった。このことから、SMARCA1がメチル化されているがん細胞はピリミジン合成経路の阻害に対して高感受性であることが示された。また、遺伝子サイレンシングとは異なる機序でのメチル化合成致死を解明するために、エンハンサー領域のメチル化を起点とした新規メチル化合成致死の組み合わせ候補を探索した。その結果、胃がんにおいて4個、肺がんにおいて57個の組み合わせを同定した。

合成致死性吸引了使用基因功能删除的药物发现的关注，但是由于可用突变的数量有限，迄今为止，成功的病例受到限制。首席研究者先前已经发现，DNA甲基化异常的存在远远超过突变，并且在研究开始之前，他还发现FAT4基因的DNA甲基化异常可能是β-catenin抑制和合成致死性。这项研究稳定地获得了新的DNA甲基化合成致死性，同时还阐明了表观基因组异常，这是合成致命的全新起点。今年，第二年，我们确定了Smarca1甲基化和抑制嘧啶合成途径的结合，是甲基化合成致死性的一种新型组合。为了实验验证这种组合的实用性，具有SMARCA1甲基化的细胞系（44AS3，AGS，GC2，GC2，KatoIII，RKO）和非甲基化细胞系（MKN7，MKN45，N87，TMK1，TMK1，HT29，T84）与吡啶胺的rimidine as as as a in 240 in 240 in 240 in 240 in 240在甲基化的细胞系中观察到，而在非甲基化细胞系中未观察到非甲基化细胞系。这表明Smarca1-甲基化的癌细胞对嘧啶合成途径的抑制高度敏感。此外，为了阐明与基因沉默不同的机制中的甲基化综合杀伤力，我们搜索了新的组合候选物，以作为起点的增强剂区域的甲基化。结果，在胃癌中鉴定了四种组合，在肺癌中发现了57个组合。