Large-scale analysis of archived sequencing data in public database for functional analysis of long non-coding RNAs
对公共数据库中存档的测序数据进行大规模分析，以进行长非编码 RNA 的功能分析
基本信息
- 批准号：20K12041
- 负责人：
- 金额：$ 2.83万
- 依托单位：
- 依托单位国家：日本
- 项目类别：Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
- 财政年份：2020
- 资助国家：日本
- 起止时间：2020-04-01 至 2023-03-31
- 项目状态：已结题
- 来源：
- 关键词：
项目摘要
项目成果
期刊论文数量（10）
专著数量（0）
科研奖励数量（0）
会议论文数量（0）
专利数量（0）
Finding the Direct Optimal RNA Barrier Energy and Improving Pathways with an Arbitrary Energy Model
寻找直接最佳 RNA 屏障能量并使用任意能量模型改进途径
- DOI：10.1093/bioinformatics/btaa469
- 发表时间：2020
- 期刊：
- 影响因子：5.8
- 作者：Hiroki Takizawa; Junichi Iwakiri; Goro Terai;Kiyoshi Asai
- 通讯作者：Kiyoshi Asai
DDX41 coordinates RNA splicing and transcriptional elongation to prevent DNA replication stress in hematopoietic cells
DDX41 协调 RNA 剪接和转录延伸以防止造血细胞中的 DNA 复制应激
- DOI：10.1038/s41375-022-01708-9
- 发表时间：2022
- 期刊：
- 影响因子：11.4
- 作者：Satoru Shinriki;Mayumi Hirayama;Akiko Nagamachi;Akihiko Yokoyama;Takeshi Kawamura;Akinori Kanai;Hidehiko Kawai;Junichi Iwakiri;Rin Liu;Manabu Maeshiro;Saruul Tungalag;Masayoshi Tasaki;Mitsuharu Ueda;Kazuhito Tomizawa;Naoyuki Kataoka;Takashi Ideue;Yutaka S
- 通讯作者：Yutaka S
DDX41 coordinates RNA splicing and transcriptional elongation to prevent DNA replication stress in hematopoietic cells
DDX41 协调 RNA 剪接和转录延伸以防止造血细胞中的 DNA 复制应激
- DOI：10.1038/s41375-022-01708-9
- 发表时间：2022
- 期刊：
- 影响因子：11.4
- 作者：Satoru Shinriki;Mayumi Hirayama;Akiko Nagamachi;Akihiko Yokoyama;Takeshi Kawamura;Akinori Kanai;Hidehiko Kawai;Junichi Iwakiri;Rin Liu;Manabu Maeshiro;Saruul Tungalag;Masayoshi Tasaki;Mitsuharu Ueda;Kazuhito Tomizawa;Naoyuki Kataoka;Takashi Ideue;Yutaka S
- 通讯作者：Yutaka S
Extended ensemble simulations of a SARS-CoV-2 nsp1-5'-UTR complex
SARS-CoV-2 nsp1-5-UTR 复合物的扩展整体模拟
- DOI：10.1371/journal.pcbi.1009804
- 发表时间：2022-01
- 期刊：
- 影响因子：4.3
- 作者：Sakuraba S;Xie Q;Kasahara K;Iwakiri J;Kono H
- 通讯作者：Kono H
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Iwakiri Junichi其他文献
Remarkable improvement in detection of readthrough downstream-of-gene transcripts by semi-extractable RNA-sequencing
通过半提取 RNA 测序对通读下游基因转录本的检测有显着改进
- DOI：
10.1261/rna.079469.122 - 发表时间：
2022 - 期刊：
- 影响因子：4.5
- 作者：
Iwakiri Junichi;Tanaka Kumiko;Chujo Takeshi;Takakuwa Hiro;Yamazaki Tomohiro;Terai Goro;Asai Kiyoshi;Hirose Tetsuro - 通讯作者：
Hirose Tetsuro
Remarkable improvement in detection of readthrough downstream-of-gene transcripts by semi-extractable RNA-sequencing
通过半提取 RNA 测序对通读下游基因转录本的检测有显着改进
- DOI：
10.1261/rna.079469.122 - 发表时间：
2022 - 期刊：
- 影响因子：4.5
- 作者：
Iwakiri Junichi;Tanaka Kumiko;Chujo Takeshi;Takakuwa Hiro;Yamazaki Tomohiro;Terai Goro;Asai Kiyoshi;Hirose Tetsuro - 通讯作者：
Hirose Tetsuro
m6A modification of HSATIII lncRNAs regulates temperature‐dependent splicing
HSATIII lncRNA 的 m6A 修饰调节温度依赖性剪接
- DOI：
10.15252/embj.2021107976 - 发表时间：
2021 - 期刊：
- 影响因子：0
- 作者：
Ninomiya Kensuke;Iwakiri Junichi;Aly Mahmoud Khamis;Sakaguchi Yuriko;Adachi Shungo;Natsume Tohru;Terai Goro;Asai Kiyoshi;Suzuki Tsutomu;Hirose Tetsuro - 通讯作者：
Hirose Tetsuro
m6A modification of HSATIII lncRNAs regulates temperature‐dependent splicing
HSATIII lncRNA 的 m6A 修饰调节温度依赖性剪接
- DOI：
10.15252/embj.2021107976 - 发表时间：
2021 - 期刊：
- 影响因子：0
- 作者：
Ninomiya Kensuke;Iwakiri Junichi;Aly Mahmoud Khamis;Sakaguchi Yuriko;Adachi Shungo;Natsume Tohru;Terai Goro;Asai Kiyoshi;Suzuki Tsutomu;Hirose Tetsuro - 通讯作者：
Hirose Tetsuro
Capturing alternative secondary structures of RNA by decomposition of base-pairing probabilities
通过分解碱基配对概率捕获 RNA 的替代二级结构
- DOI：
10.1186/s12859-018-2018-4 - 发表时间：
2018 - 期刊：
- 影响因子：3
- 作者：
Hagio Taichi;Sakuraba Shun;Iwakiri Junichi;Mori Ryota;Asai Kiyoshi - 通讯作者：
Asai Kiyoshi
Iwakiri Junichi的其他文献
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相似国自然基金
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Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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24K11548 - 财政年份：2024
- 资助金额：
$ 2.83万 - 项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
Preclinical validation of synthetic biomolecules to treat Breast Cancer from AI-enabled discovery of novel lncRNA therapeutic targets.
通过人工智能发现新型 lncRNA 治疗靶点，对合成生物分子治疗乳腺癌进行临床前验证。
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細胞周期とミトコンドリア代謝を制御するlncRNAによる消化器がん促進機構の解明
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Hippoシグナルを介して臓器横断的治療の感受性に影響を与えるlncRNAの単離、解析
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24K10411 - 财政年份：2024
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$ 2.83万 - 项目类别：
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