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RNA高次構造ダイナミクスを介した植物環境応答システムの解明
通过 RNA 构象动力学阐明植物环境响应系统
基本信息
- 批准号：20K21415
- 负责人：
- 金额：$ 4.16万
- 依托单位：
- 依托单位国家：日本
- 项目类别：Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
- 财政年份：2020
- 资助国家：日本
- 起止时间：2020-07-30 至 2024-03-31
- 项目状态：已结题
- 来源：
- 关键词：
项目摘要
本研究では、植物のロバストな細胞形質発現を可能にする環境応答システムとして「RNA高次構造ダイナミクス」に着目し、温度依存的なRNA高次構造ダイナミクス情報の新規取得、さらには、植物における「RNAサーモメーター」の同定を目指して解析を行っている。2021年度の22℃、28℃の温度条件で育てたシロイヌナズナ芽生えに関するトランスクリプトームデータの比較解析の結果、温度依存的にオーキシン関連遺伝子のmRNA代謝が大きく変化することが明らかとなっていた。一方で、シロイヌナズナpre-mRNAスプライシング関連変異体の解析から、芽生えの成長は温度（16℃、22℃、28℃）とサイトカイニンの両方に依存することがわかった。そこで、サイトカイニン、温度の両条件を変化させた条件でトランスクリプトーム解析を行った結果、新たに温度とサイトカイニンに依存したオーキシン関連遺伝子の発現変動が検出された。以上はmRNAプロセシング制御に対する温度と植物ホルモンの複雑な相互作用性を示唆しており、予想外ながらも非常に興味深い成果であった。
这项研究的重点是“ RNA结构动力学”作为一种环境响应系统，该系统可以在植物中实现强大的细胞性状表达，并进行分析，目的是获得新的温度依赖性RNA结构动力学信息并识别植物中的“ RNA温度计”。在2021年温度条件下生长的拟南芥新芽的转录组数据的比较分析表明，生长素相关基因的mRNA代谢以温度依赖性方式发生了巨大变化。另一方面，对拟南芥剪接相关的突变体的分析表明，芽的生长取决于温度（16°C，22°C，28°C）和细胞分裂素。因此，在改变细胞分裂素和温度条件的条件下进行了转录组分析，并检测到生长素相关基因表达的新温度依赖性变化。这表明温度与植物激素之间在mRNA加工控制上的相互作用是一个意外但非常有趣的结果。
项目成果
期刊论文数量（14）
专著数量（0）
科研奖励数量（0）
会议论文数量（0）
专利数量（0）
Importance of Nonsense-mediated mRNA Decay in Auxin Signaling during in vitro Organogenesis and Development in Plants
无义介导的 mRNA 衰变在植物体外器官发生和发育过程中生长素信号传导中的重要性
- DOI：
- 发表时间：2021
- 期刊：
- 影响因子：0
- 作者：Chiam Nyet-Cheng;藤村 朋世;佐野 亮輔;出村 拓;大谷 美沙都
- 通讯作者：大谷 美沙都
Characteristics of plant pre-mRNA splicing and its physiological significance
植物mRNA前体剪接特征及其生理意义
- DOI：10.14952/seikagaku.2022.940861
- 发表时间：2022
- 期刊：
- 影响因子：0
- 作者：高柳なつ;大谷美沙都
- 通讯作者：大谷美沙都
Roles for mRNA quality control in the organ regeneration of plants
mRNA 质量控制在植物器官再生中的作用
- DOI：
- 发表时间：2020
- 期刊：
- 影响因子：0
- 作者：山口夏実;有吉眞理子;深川竜郎;Misato Ohtani
- 通讯作者：Misato Ohtani
栄養条件依存的な植物成長制御にはマイナータイプスプライシングが関与する
次要型剪接参与营养依赖性植物生长控制
- DOI：
- 发表时间：2022
- 期刊：
- 影响因子：0
- 作者：石橋鴻大;荒江星拓;吉積毅;栗原志夫;黒森崇;松井南;大谷美沙都
- 通讯作者：大谷美沙都
How to transcribe and modify what kinds of snRNAs: Metabolic regulation of snRNAs is a key to environment-appropriate control of plant development
如何转录和修饰什么样的snRNA：snRNA的代谢调控是环境适宜控制植物发育的关键
- DOI：
- 发表时间：2021
- 期刊：
- 影响因子：0
- 作者：Ayumi Masui;Keisuke Yuzu;Keiichi Yamaguchi;Yuji Goto;Yasushi Kawata;and Eri Chatani;藤田恭之;Ohtani M
- 通讯作者：Ohtani M
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