網羅的遺伝子・エピゲノム解析による性成熟疾患の病因の解明
通过综合遗传和表观基因组分析阐明性成熟疾病的病因
基本信息
- 批准号:20K08876
- 负责人:
- 金额:$ 2.75万
- 依托单位:
- 依托单位国家:日本
- 项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
- 财政年份:2020
- 资助国家:日本
- 起止时间:2020-04-01 至 2022-03-31
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
本研究の目的は、性成熟疾患における新規発症責任遺伝子を同定することとエピゲノム状態の変化を明らかにすることである。本年度は、思春期遅発症患者を対象にDNAメチル化解析を行い、下記の成果を得た。思春期遅発症に関与するDNAメチル化変化を同定するため、既知責任遺伝子バリアント陽性の思春期遅発症男性患者9例、健常成人男性8例と健常男児4例を対象に網羅的DNAメチル化アレイ解析を行った。得られたデータを用いてバイオインフォマティクス解析を行い、思春期遅発症男性患者と健常男性群との間でDNAメチル化レベルに有意な差を認める1,000以上のプローブを同定した。有意差を認める1,000以上のプローブの中から、つぎに挙げる2つの方法でメチル化異常を示すプローブを抽出した。第一に、ベン図解析を行い、患者間で重複して変化するプローブを抽出した。第二に、2,000 bp以内の領域で3つ以上のメチル化変化を示したプローブを含む領域をメチル化可変領域 (DMR)と定義し、DMR領域とDMR領域内に存在するプローブを抽出した。2つの独立した方法で抽出したプローブのDNAメチル化変化が思春期遅発症男性患者において存在するか否かを明らかにするため、解析対象数を増やしてパイロシーケンス法によるDNAメチル化解析を行った。既知責任遺伝子バリアント陽性の思春期遅発症男性患者13例、原因不明思春期遅発症男性患者31例、健常成人男性50例を対象にパイロシークエンス法を用いてDNAメチル化率を算出した。一部の既知責任遺伝子バリアント陽性の思春期遅発症男性患者においてエピゲノム変化が存在するという結果を得ている。現在、得られた結果について論文投稿の準備を進めている。
本研究的目的是确定导致性成熟疾病新发的基因,并阐明表观基因组状态的变化。今年,我们对青春期延迟发生的患者进行了DNA甲基化分析,得到了以下结果。为了确定与青春期延迟相关的 DNA 甲基化变化,我们对 9 名已知相关基因变异呈阳性的青春期延迟男性患者、8 名健康成年男性和 4 名健康男孩进行了全面的 DNA 甲基化阵列分析。利用获得的数据进行生物信息学分析,鉴定出1000多个探针,显示青春期延迟男性患者和健康男性受试者之间DNA甲基化水平存在显着差异。从1000多个表现出显着差异的探针中,使用以下两种方法提取表现出甲基化异常的探针。首先,我们进行维恩图分析以提取患者之间冗余变化的探针。其次,将2000bp的区域内含有显示出3个以上甲基化变化的探针的区域定义为甲基化可变区(DMR),提取DMR区域和存在于DMR区域内的探针。为了阐明使用两种独立方法提取的探针中是否存在青春期延迟的男性患者的DNA甲基化变化,我们增加了受试者数量并使用焦磷酸测序进行了DNA甲基化分析。使用焦磷酸测序技术计算了 13 名已知负责基因变异呈阳性的青春期延迟男性患者、31 名原因不明的青春期延迟男性患者和 50 名健康成年男性的 DNA 甲基化率。结果表明,一些青春期延迟的男性患者存在表观基因组改变,这些患者对已知的相关基因变异呈阳性。我们目前正准备提交有关所获得结果的论文。
项目成果
期刊论文数量(2)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
生殖年齢の非閉塞性無精子症患者におけるモザイクY染色体喪失は稀である
育龄非梗阻性无精症患者的马赛克 Y 染色体丢失很少见
- DOI:
- 发表时间:2021
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:鈴木 江莉奈;小堀 善友;勝見 桃理;牛嶋 規久美;内山 徹;岡田 弘;宮戸 真美;深見 真紀
- 通讯作者:深見 真紀
NDNF variants are rare in patients with congenital hypogonadotropic hypogonadism
NDNF 变异在先天性低促性腺激素性性腺功能减退症患者中很少见
- DOI:10.1038/s41439-021-00137-x
- 发表时间:2021
- 期刊:
- 影响因子:1.5
- 作者:Tamaoka Satoshi;Suzuki Erina;Hattori Atsushi;Ogata Tsutomu;Fukami Maki;Katoh
- 通讯作者:Katoh
生殖年齢の非閉塞性無精子症患者におけるモザイクY染色体喪失は稀である
育龄非梗阻性无精症患者的马赛克 Y 染色体丢失很少见
- DOI:
- 发表时间:2021
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:鈴木 江莉奈;小堀 善友;勝見 桃理;牛嶋 規久美;内山 徹;岡田 弘;宮戸 真美;深見 真紀
- 通讯作者:深見 真紀
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鈴木 江莉奈其他文献
中枢性思春期早発を招くMKRN3異常の主体は、 de novo変異の発生ではなく、父由来変異の伝達である
MKRN3异常导致中枢性性早熟的主要原因不是新生突变的发生,而是父系突变的传递。
- DOI:
- 发表时间:
2019 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
鈴木 江莉奈; 島 彦仁; 鏡 雅代; 曽根田 瞬; 田中 敏章; 八ツ賀 秀一; 西岡 淳子; 大戸 佑二; 神谷 敏也; 内木 康博;緒方 勤; 藤澤 泰子; 中村 明枝; 川嶋 明香; 森川 俊太郎; 堀川 玲子; 佐野 伸一郎; 深見 真紀 - 通讯作者:
深見 真紀
アジアの中枢性思春期早発症患者においてMKRN3遺伝子変異・異常は稀である
亚洲中枢性性早熟患者中 MKRN3 基因突变/异常很少见
- DOI:
- 发表时间:
2020 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
鈴木 江莉奈; 宮戸 真美; 田中 敏章; 八ツ賀 秀一; 西岡 淳子; 緒方 勤; 堀川 玲子; 深見 真紀 - 通讯作者:
深見 真紀
アジアの中枢性思春期早発症患者においてMKRN3遺伝子変異・異常は稀である
亚洲中枢性性早熟患者中 MKRN3 基因突变/异常很少见
- DOI:
- 发表时间:
2020 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
鈴木 江莉奈; 宮戸 真美; 田中 敏章; 八ツ賀 秀一; 西岡 淳子; 緒方 勤; 堀川 玲子; 深見 真紀 - 通讯作者:
深見 真紀
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