乳がんのネオアンチゲンにおけるHLA Class II拘束性ペプチドの網羅的探索

乳腺癌新抗原中HLA II类限制性肽的全面搜索

基本信息

批准号：
21K08614
负责人：
坂東裕子
金额：
$ 2.75万
依托单位：
University of Tsukuba
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份：
2021
资助国家：
日本
起止时间：
2021-04-01 至 2024-03-31
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-21K08614/
关键词：
neoantigen HLA class II 抗腫瘍免疫乳癌 public neoantigen HLA class II拘束性ペプチド HLA Class II拘束性ペプチド MHC-density assay

项目摘要

本研究の目的は、ホルモン感受性（HR+）難治性乳癌のpublic neoantigenからHLA class IIに提示されうるペプチド配列を見出すことである。抗腫瘍免疫には細胞傷害性T細胞だけでなくHLA class IIとヘルパーT細胞による免疫応答も中心的な役割を担うことがよく知られているが、HR+難治性乳癌が免疫療法の標的となるかは明らかにされていない。患者間共通のpublic neoantigenの中からT細胞に認識されるHLA class II拘束性ペプチドが同定されれば、汎用性の高い治療標的となりうる。そこで、HLA class IIとHR+乳癌で共有されるpublic neoantigenとの相互作用を測定し標的可能性を探索した。これまでにHLA class II拘束性ペプチドを計算機上で予測するアルゴリズムの開発が行われているが、予測精度が低いことが長年の課題であった。本研究ではHLA class II-ペプチド複合体の安定性を細胞表面発現量で評価する新規測定系を用いて、HLA class IIが提示しうるpublic neoantigenを探索する。令和3年度は、HR+難治性乳癌で共有されるpublic neoantigenから設計した変異ペプチドとHLA class IIとの結合性を新規測定系を用いて評価した。令和４年度は、結合性が高いと予測された領域に関して野生型配列との結合性を比較し、低い領域はHLA class IIアレルを変更して結合性を再評価した。また、T細胞による認識の有無（免疫原性）を確認するため、変異ペプチドと強い結合を示すHLA class IIアレルを有する健常ドナーの末梢血単核細胞(PBMC)を用いてEnzyme-Linked ImmunoSpot (ELISpot)アッセイを行うための予備検討を開始した。

本研究的目的是寻找可以从激素敏感（HR+）难治性乳腺癌的公共新抗原呈递给 HLA II 类的肽序列。众所周知，不仅细胞毒性T细胞，HLA II类和辅助性T细胞的免疫反应在抗肿瘤免疫中发挥着核心作用，而HR+难治性乳腺癌是免疫治疗的靶点尚未被揭示。如果在患者常见的公共新抗原中鉴定出 T 细胞识别的 HLA II 类限制性肽，它们可能会成为高度通用的治疗靶点。因此，我们测量了 HLA II 类与 HR+ 乳腺癌共有的公共新抗原之间的相互作用，并寻找可能的靶点。已经开发出在计算机上预测 HLA II 类限制性肽的算法，但预测准确性低一直是一个长期存在的问题。在这项研究中，我们将使用一种新的测量系统来探索 HLA II 类可以呈现的公共新抗原，该系统根据细胞表面表达水平评估 HLA II 类肽复合物的稳定性。在 2021 财年，我们使用了一种新的测量系统来评估由 HR+ 难治性乳腺癌共享的公共新抗原设计的突变肽与 HLA II 类的结合。在 2020 财年，我们将预测具有高结合的区域的结合与野生型序列进行了比较，在低结合的区域中，我们改变了 HLA II 类等位基因并重新评估了结合。此外，为了确认 T 细胞是否存在识别（免疫原性），我们使用了酶联免疫斑点（我们已经开始进行 ELISpot 测定的初步研究。