B型・C型肝炎ウイルスの遺伝子変化の特徴と病態との関連性の解明

阐明乙型和丙型肝炎病毒的遗传变化特征及其与病理状况的关系

基本信息

批准号：
21K07980
负责人：
上田佳秀
金额：
$ 2.66万
依托单位：
Kobe University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份：
2021
资助国家：
日本
起止时间：
2021-04-01 至 2024-03-31
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-21K07980/
关键词：
C型肝炎ウイルス B型肝炎ウイルス遺伝子変異遺伝子構造変化

项目摘要

1. C型慢性肝炎患者の経過におけるC型肝炎ウイルス（HCV）遺伝子変異バイアスの特徴： C型慢性肝炎患者4例ならびに肝移植C型肝炎再発症例4例の抗HCV治療開始前ならびに治療終了後の血清におけるHCV遺伝子配列を1分子リアルタイム・シーケンサーならびに次世代シーケンサーを用いて同定した。HCV遺伝子配列の変化を経時的に比較して分子系統樹解析を行い、HCV遺伝子変異バイアスの特徴としてtransition変異が多く生じていること、中でもA→GとU→C変異の頻度が高いことを明らかにした。一方で、既知の薬物耐性変異はtransversion変異によっても生じており、変異が生じたHCVクローンが選択されて増殖していることを示した。以上の結果を論文発表した。2. B型肝炎ウイルス（HBV）の遺伝子構造変化の意義： HCVで解析した方法と同様に、B型慢性肝炎患者10例の血清よりDNAを抽出し、HBV-DNAをPCRにて増幅し、1分子リアルタイム・シーケンサーならびに次世代シーケンサー解析を行った。その結果、大きな変化としてHBVのpreS/S領域ならびにC領域に欠失を認めるHBVの構造変化を多数例で認めた。このHBV構造変化と臨床経過の特徴との関連を解析し、HBe抗体陰性例や肝酵素高値例で多様な遺伝子欠失を認めていることを明らかにした。以上の結果を論文発表した。

1.慢性丙型肝炎患者病程中丙型肝炎病毒（HCV）基因突变偏向特征：4例慢性丙型肝炎患者和4例肝移植后复发丙型肝炎患者完成抗HCV治疗前后我们使用单分子实时测序仪和下一代测序仪鉴定了患者血清中的 HCV 基因序列。我们通过比较 HCV 基因序列随时间的变化进行了分子系统发育树分析，发现作为 HCV 基因突变偏向的一个特征，过渡突变频繁发生，并且 A→G 和 U→C 突变尤其频繁。另一方面，我们发现已知的耐药突变也是由颠换突变引起的，并且选择具有突变的HCV克隆进行增殖。上述结果发表在一篇论文中。 2、乙型肝炎病毒（HBV）基因结构变化的意义：与分析HCV的方法类似，从10例慢性乙型肝炎患者的血清中提取DNA，通过PCR扩增HBV-DNA，单分子进行了实时测序仪和下一代测序仪分析。结果，在许多情况下观察到HBV的结构变化，包括HBV前S/S区和C区的缺失。我们分析了这些 HBV 结构变化与临床病程特征之间的关系，发现在 HBe 抗体阴性病例和肝酶水平高的病例中观察到各种基因缺失。上述结果发表在一篇论文中。

项目成果

期刊论文数量（3）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

Evolutional transition of HBV genome during the persistent infection determined by single-molecule real-time sequencing

单分子实时测序测定持续感染过程中HBV基因组的进化转变

DOI：
10.1097/hc9.0000000000000047
发表时间：
2023-02-27
期刊：
Hepatology Communications
影响因子：
5.1
作者：
S. Arasawa;Haruhiko Takeda;A. Takai;Eriko Iguchi;Y. Eso;Takahiro Shimizu;Ken Takahashi;Taiki Yamashita;Y. Ueda;H. Marusawa;H. Seno
通讯作者：
H. Seno

Mutational spectrum of hepatitis C virus in patients with chronic hepatitis C determined by single molecule real-time sequencing

单分子实时测序测定慢性丙型肝炎患者丙型肝炎病毒突变谱

DOI：
10.1038/s41598-022-11151-6
发表时间：
2022-04-30
期刊：
影响因子：
4.6
作者：
Nakamura F;Takeda H;Ueda Y;Takai A;Takahashi K;Eso Y;Arasawa S;Iguchi E;Shimizu T;Mishima M;Kumagai K;Yamashita T;Uemoto S;Kato N;Marusawa H;Sekine A;Seno H
通讯作者：
Seno H

必携内科医のための臓器移植診療ハンドブック

内科医生必备的器官移植治疗手册

DOI：
发表时间：
2023
期刊：
影响因子：
0
作者：
一般財団法人日本移植学会Transplant Physician委員会
通讯作者：
一般財団法人日本移植学会Transplant Physician委員会

Mutational spectrum of hepatitis C virus in patients with chronic hepatitis C determined by single molecule real-time sequencing

单分子实时测序测定慢性丙型肝炎患者丙型肝炎病毒突变谱

DOI：
10.1038/s41598-022-11151-6
发表时间：
2022
期刊：
影响因子：
4.6
作者：
Nakamura Fumiyasu;Takeda Haruhiko;Ueda Yoshihide;Takai Atsushi;Takahashi Ken;Eso Yuji;Arasawa Soichi;Iguchi Eriko;Shimizu Takahiro;Mishima Masako;Kumagai Ken;Yamashita Taiki;Uemoto Shinji;Kato Nobuyuki;Marusawa Hiroyuki;Sekine Akihiro;Seno Hiroshi
通讯作者：
Seno Hiroshi

必携内科医のための臓器移植診療ハンドブック

内科医生必备的器官移植治疗手册