Clinical characteristic and molecular epidemiology of high-risk clone Bacillus cereus ST1420

高危克隆蜡样芽胞杆菌ST1420的临床特征及分子流行病学

基本信息

批准号：
20K08853
负责人：
鈴木里和
金额：
$ 2.75万
依托单位：
National Institute of Infectious Diseases
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份：
2020
资助国家：
日本
起止时间：
2020-04-01 至 2024-03-31
项目状态：
已结题

项目摘要

今年度、異なる医療機関の血流感染症患者由来10株および病院給食由来株2株を入手しゲノム解析を実施した。MLST解析から血流感染症患者由来株10株のうち4株はST365-complexに属していた。当初日本国内でのハイリスククローンと考えられたST1420 はallele番号では62-1-93-109-55-102-210となりST365の34-1-32-1-18-33-24とは1alleleのみの一致であるため、allele番号の一致数による分類であるST365-complexには属しない。しかし、昨年度同様、7つのalleleをすべて連結したconcatenate配列の系統解析とPriestらの分類名に基づくと、ST1420とST365 complexはいずれもB. anthracisに近縁とされるclade1のCereusIIIに属していた。ST365 complexに属する株は国内の異なる地域の医療機関より散発的に分離されており、血流感染症の割合が高かった。今年度解析を行った、ST365 complexに属する株のうち2株は新規alleleを含む新規STであった。B. cereus血流感染症や院内感染事例の報告は海外に比べ日本からが多いこと、ハイリスククローンとして報告されたST1420も新規STであったことから、我が国特有のB. cereus系統株が国内に広く存在し、感染症、特に血流感染を引き起こしている可能性が示唆された。さらに、今年度の臨床情報の収集からB. cereusの血流感染症は採血時の汚染との鑑別が困難な症例から、数日で死に至る転帰となる劇症型の症例に分かれ、この劇症型血流感染症とST365-complexとの関与が示唆された。今後はこれら劇症型血流感染症由来の菌株のゲノム配列上の特徴を明らかにし、病原因子および検出に有用な遺伝子配列の検証を行う。

今年，我们获得了来自不同医疗机构的血流感染患者的10株菌株和来自医院午餐的2株菌株，并进行了基因组分析。 MLST分析显示，来自血流感染患者的10株菌株中有4株属于ST365复合体。 ST1420最初在日本被认为是高风险克隆，其等位基因号为62-1-93-109-55-102-210，与ST365的34-1-32-1-18-不同33-24，只有1个等位基因，因为这是一个匹配，所以它不属于ST365-complex，它是根据等位基因编号中的匹配数来分类的。然而，与去年一样，根据连接所有七个等位基因的串联序列的系统发育分析以及 Priest 等人的分类学名称，ST1420 和 ST365 复合体均属于进化枝 1，Cereus III，与炭疽芽孢杆菌密切相关。 .全国不同地区的医疗机构零星分离出属于ST365复合体的菌株，发生血流感染的比例较高。今年分析的属于 ST365 复合体的两个菌株是含有新等位基因的新 ST。日本报告的蜡状芽胞杆菌血流感染和医院感染病例比其他国家多，而被报道为高危克隆的ST1420也是一种新的ST病毒，表明该病毒广泛存在于日本。人类并可能引起感染，尤其是血液感染。此外，根据今年收集的临床信息，蜡状芽孢杆菌引起的血流感染可分为难以与采血时污染区分的病例和可导致几天内死亡的暴发性病例ST365之间的关系。 - 提示复杂性和血流感染。未来，我们将阐明这些暴发性血流感染菌株的基因组序列特征，并验证可用于检测的致病因子和基因序列。