世界初となる単為生殖型肝蛭3倍体の分子学的識別法の開発

开发出世界上第一个单性生殖肝吸虫三倍体分子鉴定方法

• 批准号: 21K05954
• 负责人: 関 まどか
• 金额: $ 2.66万
• 依托单位: Iwate University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2021
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2021-04-01 至 2024-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-21K05954/
• 关键词: 肝蛭; 遺伝子型解析; 定量的PCR; 単為生殖型肝蛭; 人獣共通感染症; 寄生虫; 単為生殖; 2倍体; 3倍体; 獣医学; 寄生虫学

本年度は、予定外のリアルタイムPCR装置の変更に伴い、昨年度に確立した定量的PCRの条件を再度検討した。その結果、これまで以上の精度で遺伝子型を判定可能になった。一方、サンプリング条件が整わず、死後時間が経過してから固定された虫体から抽出したゲノムDNAを用いると、定量的PCCRで理論通りの遺伝子型判定が困難であることが判明した。したがって、今後、判定に適するDNAの品質を検討する必要が示された。また、これまでは核DNAマーカーであるホスホエノールピルビン酸カルボキシキナーゼ（pepck）とDNAポリメラーゼδ（pold）をターゲットとしてきたが、より多くのマーカーを用いれば遺伝子型の判定精度が上がると考えたことから、新たな核DNAマーカーとしてFatty acid binding protein type I（FABP typeI）に着目した。pepckとpoldと同様にFABP type Iも、種鑑別マーカーとして十分な信頼性を有しており、単為生殖型肝蛭の遺伝子型判定に有用であることが明らかとなった。現在、FABP type Iをターゲットにした遺伝子型判定のための定量的PCRを検討中である。次年度以降は、DNAの品質の課題を解決するとともに、世界各地の肝蛭を用いた疫学調査を行い、単為生殖型肝蛭2倍体と3倍体の分布状況と遺伝子型を明らかにし、3倍体の出現様式を解明する予定である。

今年，由于实时PCR设备发生意外变更，我们重新审查了去年建立的定量PCR条件。因此，比以往任何时候都更精确地确定基因型成为可能。另一方面，我们发现，如果采样条件不合适，并且使用从死亡后固定的昆虫尸体中提取的基因组DNA，则很难像预期的那样利用定量PCCR确定基因型。因此，有必要考虑适合将来测定的DNA质量。此外，到目前为止，我们已经针对核DNA标记物磷酸烯醇丙酮酸羧激酶（pepck）和DNA聚合酶δ（pold），但我们相信使用更多的标记物将提高基因分型的准确性，因此，我们重点关注I型脂肪酸结合蛋白。 （FABP I 型）作为新的核 DNA 标记。与 pepck 和 pold 类似，FABP I 型作为物种分化标记也具有足够的可靠性，并且已被发现可用于孤雌性肝吸虫的基因分型。我们目前正在研究用于针对 I 型 FABP 基因分型的定量 PCR。明年起，我们将解决DNA质量问题，利用世界各地的肝吸虫进行流行病学调查，明确孤雌肝吸虫二倍体和三倍体的分布和基因型，并计划阐明三倍体的出现模式。 。

项目成果

牛に寄生するSetaria marshalliの分子学的解析

牛寄生的马氏狗尾草的分子分析

• 发表时间: 2021
• 作者: 北島ちひろ;一條俊浩;関まどか
• 通讯作者: 関まどか

Molecular and phylogenetic analysis of E. vermicularis in appendectomy specimens from Iran

伊朗阑尾切除标本中蛲虫的分子和系统发育分析

• DOI: 10.1016/j.meegid.2022.105391
• 发表时间: 2023
• 作者: Shafiei Reza;Jafarzadeh Fatemeh;Bozorgomid Arezoo;Ichikawa;Mirahmadi Hadi;Raeghi Saber
• 通讯作者: Raeghi Saber

Population structure, molecular characterization, and phylogenetic analysis of Fasciola gigantica from two locations in Uganda

乌干达两个地点巨片形吸虫的种群结构、分子特征和系统发育分析

• DOI: 10.1016/j.meegid.2022.105359
• 发表时间: 2022
• 作者: Vudriko Patrick;Echodu Richard;Tashiro Michiyo;Oka Nozomi;Hayashi Kei;Ichikawa
• 通讯作者: Ichikawa

Identification of novel yolk ferritins unique to planarians: planarians supply aluminum rather than iron to vitellaria in egg capsules

涡虫特有的新型卵黄铁蛋白的鉴定：涡虫向卵囊中的黄藻提供铝而不是铁

• DOI: 10.1007/s00441-021-03506-8
• 发表时间: 2021
• 影响因子: 3.6
• 作者: Kawase Osamu;Iwaya Hisashi;Asano Yoshiya;Inoue Hiromoto;Kudo Seiya;Sasahira Motoki;Azuma Nobuyuki;Kondoh Daisuke;Ichikawa;Xuan Xuenan;Sakamoto Kimitoshi;Okamoto Hikaru;Nakadate Hinaki;Inoue Wataru;Saito Ikuma;Narita Miyu;Sekii Kiyono;Kobayashi
• 通讯作者: Kobayashi

Fasciola 属を識別するためのFABP15 遺伝子に基づくMultiplex PCR法の確立

基于FABP15基因的片形吸虫属多重PCR鉴定方法的建立

• 发表时间: 2022
• 作者: 関まどか;岡本衣美;田代みちよ;Pedro Ortiz;Uday Kumar Mohanta;Cristian Hoban;Cesar A. Murga;Jose M. Angulo
• 通讯作者: Jose M. Angulo