miRNA発現パターンと病理所見に基づく機械学習による冠動脈硬化症のクラスター化

基于 miRNA 表达模式和病理结果的机器学习对冠状动脉粥样硬化进行聚类

• 批准号: 21K10533
• 负责人: 鉄 堅
• 金额: $ 2.66万
• 依托单位: Nihon University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2021
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2021-04-01 至 2024-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-21K10533/
• 关键词: 血漿試料の収集; MicroRNAマーカー; TaqMan Assayの解析; CAD病理学的評価; 相関性の解析; SNP; 遺伝子; 動脈硬化; miRNA

アテローム性動脈硬化症はよく見られる血管疾患であり、冠動脈疾患(CAD)は心臓の血管の疾患です。動脈硬化性CADは年齢とともに増加する傾向があり、一般的で致命的な心血管疾患と考えられています。既知のmiRNAに関するCAD危険因子の中で、Has-miR-143及びHas-miR-146aについて数多く報告されました。最近、これらのmiRNAをコードする遺伝子rs41291957及びrs2910164のGenotypingの種類とCAD発病のリスクと関係することが明らかになりました。しかし、日本人集団に関する報告はほとんどないので、本研究は法医学解剖事例を試料として冠状動脈硬化の状況を観察したうえで血液を採取しmiRNAの発現量を測定するとともにその対応するSNP遺伝子のパターンも解析しました。血漿からRNAを精製し、逆転写によりcDNAを得られTaqMan assay法を用いmiRNAの発現量を測定しました。さらにmiR-143とmiR-146aについてそれぞれ関連する遺伝子rs41291957及びrs2910164をターゲットとしてTaqMan SNPアッセイを使用して2つのSNP遺伝子座のGenotypingを調べました。解剖所見と顕微鏡観察により151人の試料を解析しました。主冠動脈、前下行枝、回旋動脈、および右冠動脈の閉塞の程度を評価するためにImageJソフトウェアを使用して、アテローム硬化性閉鎖が10% 未満 (コントロール) および 10% を超える2つのグループに分かれて分析しました。その結果、後者はコントロールグループよりrs2910164 CC遺伝子型は多く確認されたことで研究集団におけるCADのリスクと関連していたことが示唆されました。ただし、Has-miR-143 rs41291957遺伝子型は、CADリスクとの明確な関連性を示しませんでした。

动脉粥样硬化是一种常见的血管疾病，冠状动脉疾病（CAD）是心脏血管的疾病。动脉粥样硬化的CAD倾向于随着年龄的增长而增加，被认为是一种常见的致命心血管疾病。在MIRNA的已知CAD危险因素中，已经报道了Has-Mir-143和Has-Mir-146A的许多报告。最近，已经揭示了编码这些miRNA RS41291957和RS2910164的基因与基因分型类型和发展CAD的风险有关。但是，关于日本人群的报道很少，因此本研究进行了法医解剖结构样本，并观察到冠状动脉僵硬的状态，然后收集血液以测量miRNA表达水平，并分析了相应的SNP基因的模式。从血浆中纯化RNA，通过逆转录获得cDNA，并使用Taqman分析方法测量miRNA表达水平。此外，我们使用针对相关基因rs41291957和miR-143和miR-146a的taqman SNP测定法研究了两个SNP基因座的基因分型。通过解剖发现和微观观察分析151个样品。我们使用ImageJ软件分析了两组<10％（对照）和> 10％的动脉粥样硬化闭合，以评估主要冠状动脉，前降，圆周动脉和右冠状动脉的闭塞程度。结果表明，后者与研究人群中CAD的风险有关，因为比对照组确认了更多的RS2910164 CC基因型。但是，HAS-MIR-143 RS41291957基因型与CAD风险没有明显关联。