3世代コホート調査を用いた生殖補助技術特有のゲノム遺伝子異常の探索的研究

使用三代队列研究对辅助生殖技术特有的基因组遗传异常进行探索性研究

基本信息

批准号：
21K09487
负责人：
菅原淳史
金额：
$ 2.66万
依托单位：
Tohoku University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份：
2021
资助国家：
日本
起止时间：
2021-04-01 至 2024-03-31
项目状态：
已结题

项目摘要

今年度は東北メディカル・メガバンク機構UnitC下でART例、非ART例のトリオでの全ゲノム情報を用いて、ART特異的なゲノム異常の探索を行なっている。具体的にはまず、三世代コホート調査の調査票から、親子関係、年齢、妊娠方法(狭義の体外受精か、顕微授精か、それ以外か)などの基本情報を抽出する。その中でも当機構で既に全ゲノム解析が終了しているサンプルが研究の対象になる。現時点では5万人の全ゲノム解析が終了しているが、その中でもトリオ全ての解析が終了したものは1200トリオ程度、また、さらにその中で妊娠方法が明らかになっているものは200トリオ程度に限定される。現在はそれらのトリオを対象に、次世代に受け継がれるde novo 変異を抽出している。抽出したトリオの全ゲノム解析結果に対して、両親から受け継いだもの以外のゲノム変化(de novo変異)の抽出をおこなっている。具体的には、構造異型(欠失、重複、逆位など)を、コピー数変化を元に解析している。さらに、片親性ダイソミーも解析の対象としている。片親性ダイソミーとは、片親由来のアレルが、児の両方のアレルで観察される状態である。片親由来の片方のアレルが複製され児の両方のアレルで確認されるものをアイソダイソミー、片親由来の両方のアレルが児に引き継がれるものをヘテロダイソミーと呼んでいるが、今回は数々の報告から顕微授精が児の分節型の片親性アイソダイソミーを引き起こすのではないかという仮説の上、これらの解析を開始している。

今年，在Tohoku Medical Megabank Unitc下，我们正在使用艺术和非艺术案例三人组中的全基因组信息来搜索特定于艺术的基因组异常。具体而言，首先，从问卷调查表中提取了三代同类群调查的问卷，例如，从问卷提取了基本信息，例如亲子关系，年龄和妊娠方法（在狭窄的意义上，体外受精，接种或其他方式）。其中，已经在此机制上完成了整个基因组分析的样本将是研究的主题。目前，已经完成了50,000人的全基因组分析，但是其中只有大约1,200个三人组已经完成，并且只有大约200个三重奏已确定已知怀孕方法。目前，我们针对这些三个三重奏来提取将传递给下一代的从头突变。提取的三重奏的整个基因组分析的结果是针对基因组变化（从头突变）的，而不是从父母继承的基因组变化（从头突变）。具体而言，根据副本编号的变化，分析了结构变体（删除，重复，倒置等）。此外，单亲生疾病也需要进行分析。单亲疾病是在儿童的两个等位基因中观察到从一个父母中衍生出的等位基因的条件。从孩子中的两个等位基因复制并确认了单亲的一个等位基因，称为异构症，而单亲父母的等位基因称为异疾病，但是在本文中，我们已经基于静脉内启示可能会导致静脉内剂可能会导致儿童的静脉内剂量分析的假设。