多次元質量分析による大動脈疾患のメタボロームバイオマーカー解析

使用多维质谱分析主动脉疾病的代谢组生物标志物

• 批准号: 21K08086
• 负责人: 冨田 翔大
• 金额: $ 2.58万
• 依托单位: Jichi Medical University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2021
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2021-04-01 至 2024-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-21K08086/
• 关键词: 大動脈解離; バイオマーカー; 大動脈疾患; メタボローム

Myh11リジン残基1256を欠損したマウスを樹立し、Myh11変異マウスはヒトの家族性大動脈瘤・解離をミミックすることを明らかにした。続いて、Myh11変異マウスのメタボロームとトランスクリプトームの解析を行い、大動脈解離のバイオマーカー候補となる代謝物の同定を試みた。まず、RNAseqから得られたトランスクリプトームデータのパスウェイ解析を行った。Myh11 K1256ホモ欠損型マウスとヘテロ欠損型マウスに共通して22のパスウェイが減少していることを突き止めた。さらに、そのうち19は膜輸送に関連するパスウェイであった。さらに、メタボローム解析を行ったところ、トランスクリプトーム解析で同定したパスウェイを支持する結果を得た。さらにトランスクリプトーム解析を進め、細胞膜を裏打ちするタンパクの発現が低下していることを明らかにした。このタンパクは細胞膜タンパクの足場を形成している可能性がある。ここまでのメタボローム解析とトランスクリプトーム解析を組み合わせたmultiomics研究の結果をまとめた論文を投稿中である。

建立了缺乏MYH11赖氨酸残基1256的小鼠，并揭示了MYH11突变小鼠模仿家族性主动脉瘤和人类解离。随后，分析了MYH11突变小鼠的代谢组和转录组，以鉴定可能是主动脉夹层生物标志物的代谢产物。首先，进行了从RNASEQ获得的转录组数据的途径分析。我们发现MYH11 K1256均缺陷小鼠和异性缺陷小鼠的共同点降低了22个途径。此外，其中19个是与膜运输相关的途径。此外，进行了代谢组分析，并通过转录组分析确定的途径支持结果。此外，进行了转录组分析，表明细胞膜内衬的表达减少了。该蛋白可能会形成细胞膜蛋白的支架。我目前正在提交一篇论文，总结了我的多素研究结果，该论文结合了迄今为止代谢组和转录组分析。