Construction of DNA Methylation Markers for liqid biopsy of Pancreatic Cancer.

用于胰腺癌液体活检的 DNA 甲基化标记物的构建。

基本信息

批准号：
21K07222
负责人：
横山勢也
金额：
$ 2.66万
依托单位：
Kagoshima University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份：
2021
资助国家：
日本
起止时间：
2021-04-01 至 2024-03-31
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-21K07222/
关键词：
PDAC DNA methylation MPS BSAS prognosis prediction cholangiocarcinoma NGS

项目摘要

当該プログラムにおいては，膵癌臨床検体（針生検検体・細胞診検体・凍結組織検体・摘出組織検体・FFPE組織検体・体液検体）において，各ムチン遺伝子を含むがん遺伝子・がん抑制遺伝子のDNAメチル化状況と，その組織における発現との相関を明らかにする．さらに，予後を含む臨床情報を用いて統計的因果分析ならびに高次予測可能機械学習を行うことで摘出術奏功性評価を含めた悪性度予測モデルの構築，ならびにリキッドバイオプシへ向けたバイオマーカー開発の可能性を探索する．本年度においてDNAメチル化解析を用いた機械学習モデルへ適応可能な臨床検体の検討を行った．細胞診検体の余剰分への適応範囲を広げるために，細胞診検体において凍結保存・FFPE保存・LBC保存における解析結果への影響を確認した．微量検体より抽出可能なＤＮＡ量においても対応可能なＮＧＳによるアンプリコンシークエンスを応用した当該方法は，約１％程度のメチル化より検出可能であった．当該方法を臨床検体に適応することで，膵臓癌の悪性度を予測可能な検出法となりえると考えられる．今後は針生検検体・体液検体とより低侵襲性でチャレンジングな検体での解析結果とその予後を含めた臨床情報との比較検討を行わなければならない．現行法では手のつけようのない膵臓癌の克服に向けて，悪性度予測モデルの構築を目指す．当研究計画により針生検などの微小組織検体や低侵襲的に採取可能な膵液・胆汁液検体を用いた摘出術奏功性評価を含めた診断法の有用性を世界に先駆けて報告できると考えている．

在该程序中，癌症基因的DNA甲基化状态与癌症抑制每个粘蛋白基因的基因及其在临床胰腺癌的组织中的表达之间的相关性（针头活检标本，细胞学标本，细胞学标本，冻结的组织标本，冻结的组织，组织的组织标本，FPPE组织，组织，体细胞和体细胞，身体和体细胞。此外，通过使用临床信息（包括预后）进行统计因果分析和可预测的机器学习，我们探索了建立恶性预测模型的可能性，包括评估切除成功，并为液体活检开发生物标志物。今年，我们研究了可以使用DNA甲基化分析来适应机器学习模型的临床标本。为了扩大对过量细胞学样本的应用范围，我们确认了在细胞学样本中存储冷冻，FFPE和LBC时对分析结果的影响。该方法使用NGS应用扩增子测序，该方法也可以在可以从痕量样品中提取的DNA量中使用，可通过约1％的甲基化检测。通过将这种方法适应临床标本，可以认为它可以是一种检测胰腺癌恶性肿瘤的方法。将来，我们将需要与更微型且具有挑战性的标本以及临床信息在内的临床信息进行比较和检查针头活检和体液标本的分析结果。我们旨在建立一个恶性预测模型来克服胰腺癌，这在当前方法下是不可避免的。该研究计划是世界上第一个报告诊断方法有用的有用性的计划之一，包括使用小动物样本（例如针头活检和微创胰腺和胆汁液样品）进行成功去除的评估。

项目成果

期刊论文数量（5）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

Gallbladder microbiota composition is associated with pancreaticobiliary and gallbladder cancer prognosis.

DOI：
10.1186/s12866-022-02557-3
发表时间：
2022-05-27
期刊：
BMC microbiology
影响因子：
4.2
作者：
通讯作者：

University of Nebraska Medical Center(米国)

内布拉斯加大学医学中心（美国）

DOI：
发表时间：
期刊：
影响因子：
0
作者：
通讯作者：

DNAメチル化解析による胆管癌術後予後予測手法の構築

利用DNA甲基化分析预测胆管癌预后的方法的构建

DOI：
发表时间：
2022
期刊：
影响因子：
0
作者：
横山勢也;霧島茉莉;東美智代
通讯作者：
東美智代

Construction of prognosis prediction method for after surgery of Cholangiocarcinoma using aberrant methylation status

基于异常甲基化状态的胆管癌术后预后预测方法的构建

DOI：
发表时间：
2022
期刊：
影响因子：
0
作者：
Kirishima M;Yokoyama S;Matsuo K;Hamada T;Shimokawa M;Akahane T;Sugimoto T;Tsurumaru H;Ishibashi M;Mataki Y;Ootsuka T;Nomoto M;Hayashi C;Horiguchi A;Higashi M;Tanimoto A;横山勢也;Seiya Yokoyama
通讯作者：
Seiya Yokoyama