銀ナノ錯体バイオチップを活用したヌクレオソーム解析による新規大腸癌診断法の確立

使用银纳米复合物生物芯片进行核小体分析建立新的结直肠癌诊断方法

• 批准号: 21K07181
• 负责人: 金城 達也
• 金额: $ 2.5万
• 依托单位: University of the Ryukyus
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2021
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2021-04-01 至 2024-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-21K07181/
• 关键词: 銀ナノ錯体バイオチップ; ヌクレオソーム; エピジェネティック; 次世代シーケンサー; 大腸癌

大腸癌のスクリーニング法が現状では煩雑であり、また沖縄県では検診及び精検受診率も極めて低く、進行癌の診断率が高い。その結果、大腸癌死亡率が非常に高く、島嶼県、高齢者及び併存疾患保有率の急増など、沖縄県特有の背景が拍車をかけている。近年、核酸解析によるリキッドバイオプシー研究が急速に発達しているが、未だ解析精度の点で課題が多い。癌研究分野では、エピジェネティクス変化も網羅する新たな指標として、血中ヌクレオソームが注目されている。これまでに銀ナノ錯体バイオチップを使用し、血中癌細胞由来ヌクレオソーム検出による簡便かつ迅速な大腸癌診断の研究を蓄積してきた。大腸癌の発癌・進行過程と血中ヌクレオソーム及び付帯する癌遺伝子及びエピジェネティック変化には、どのような関連があるのか？本研究では銀ナノ錯体バイオチップを活用し、ヌクレオソーム解析及び沖縄県内で実証試験を実施し、新規大腸癌スクリーニング法の確立及び臨床応用にも追究する。令和4年は銀ナノ錯体バイオチップ捕捉塩基配列解析と手術患者を対象としたレジストリ作成を継続。銀ナノ錯体バイオチップにより捕捉されたヌクレオソームの自家発光波長による癌診断とDNA塩基配列の解析を実施。捕捉血清癌由来ヌクレオソーム検出のため、特定波長を使用し、蛍光物質の面積値を測定し、Ratio値のカットオフ値を決定し、さらに捕捉血清癌由来ヌクレオソームからDNAを抽出し、抽出される微量DNAの精製および増幅の条件について検討を行い、次世代シークエンサーを用いてDNA塩基配列を行い、特徴を捉える。

结肠癌的筛查方法目前很复杂，在冲绳县，筛查和处方检查的速度极低，晚期癌症的诊断率很高。结果，结肠癌的死亡率极高，冲绳县的独特背景激增，岛县，老年人和合并症疾病的数量迅速增加。近年来，使用核酸分析的液体活检研究一直在迅速发展，但是在分析准确性方面仍然存在许多挑战。在癌症研究领域，血核小体吸引了人们的注意，这是一个涵盖表观遗传变化的新指标。到目前为止，我们使用使用银纳米复合物生物芯片从血液癌细胞衍生的核小体来积累了对简单和快速的结直肠癌诊断的研究。结肠癌的癌变与进展与血核小体以及伴随的肿瘤基因和表观遗传变化之间的关系是什么？这项研究利用银纳米复合物生物芯片在冲绳县内进行核小体分析和演示测试，还将研究建立一种新的结直肠癌筛查和临床应用的方法。在2022年，我们继续分析被捕获的银纳米复合物生物芯片的碱基序列，并为手术患者创建注册表。我们使用银纳米复合物生物芯片捕获的核小体的自主发射波长进行了癌症诊断和DNA核苷酸序列分析。为了从捕获的血清癌中检测核小体，使用特定波长来测量荧光物质的面积值，确定比率值的临界值，然后从捕获的血清癌中提取DNA，并检查了提取的痕量DNA的纯化和扩增的条件，并使用DNA碱基序列进行了下一次捕获序列的序列，以捕获序列序列。