銀ナノ錯体バイオチップを活用したヌクレオソーム解析による新規大腸癌診断法の確立

使用银纳米复合物生物芯片进行核小体分析建立新的结直肠癌诊断方法

• 批准号: 21K07181
• 负责人: 金城 達也
• 金额: $ 2.5万
• 依托单位: University of the Ryukyus
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2021
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2021-04-01 至 2024-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-21K07181/
• 关键词: 銀ナノ錯体バイオチップ; ヌクレオソーム; エピジェネティック; 次世代シーケンサー; 大腸癌

大腸癌のスクリーニング法が現状では煩雑であり、また沖縄県では検診及び精検受診率も極めて低く、進行癌の診断率が高い。その結果、大腸癌死亡率が非常に高く、島嶼県、高齢者及び併存疾患保有率の急増など、沖縄県特有の背景が拍車をかけている。近年、核酸解析によるリキッドバイオプシー研究が急速に発達しているが、未だ解析精度の点で課題が多い。癌研究分野では、エピジェネティクス変化も網羅する新たな指標として、血中ヌクレオソームが注目されている。これまでに銀ナノ錯体バイオチップを使用し、血中癌細胞由来ヌクレオソーム検出による簡便かつ迅速な大腸癌診断の研究を蓄積してきた。大腸癌の発癌・進行過程と血中ヌクレオソーム及び付帯する癌遺伝子及びエピジェネティック変化には、どのような関連があるのか？本研究では銀ナノ錯体バイオチップを活用し、ヌクレオソーム解析及び沖縄県内で実証試験を実施し、新規大腸癌スクリーニング法の確立及び臨床応用にも追究する。令和4年は銀ナノ錯体バイオチップ捕捉塩基配列解析と手術患者を対象としたレジストリ作成を継続。銀ナノ錯体バイオチップにより捕捉されたヌクレオソームの自家発光波長による癌診断とDNA塩基配列の解析を実施。捕捉血清癌由来ヌクレオソーム検出のため、特定波長を使用し、蛍光物質の面積値を測定し、Ratio値のカットオフ値を決定し、さらに捕捉血清癌由来ヌクレオソームからDNAを抽出し、抽出される微量DNAの精製および増幅の条件について検討を行い、次世代シークエンサーを用いてDNA塩基配列を行い、特徴を捉える。

结直肠癌的筛查方法目前很复杂，在冲绳县，筛查和仔细检查率极低，晚期癌症的诊断率很高。结果，结直肠癌的死亡率很高，冲绳县独特背景的背景刺激了岛屿县的持有率，老年人和相关疾病的迅速增加。近年来，通过核酸分析进行的液体活检研究已经迅速发展，但是在分析准确性方面仍然存在许多问题。在癌症研究领域，血液中的核小体引起了人们的注意，这是表观遗传学变化的新指标。迄今为止，我们已经使用银纳米复合物生物芯片来通过检测源自血液癌细胞的核小体来积累简单和迅速的结直肠癌诊断的研究。结直肠癌的癌变 /进步过程，血腥的某些人和附着的癌症基因与表观遗传学变化之间的相关关系是什么？在这项研究中，银纳米BI -CHIP将用于进行核体分析和冲绳县的示范测试，以追求新的结直肠癌筛查的建立和临床应用。在第四年，银纳米复合物生物芯片捕获了基本序列分析，并为手术患者进行了注册。通过银纳米复合物生物芯片捕获的核体和DNA碱基序列的自我发射波长进行了癌症诊断和DNA碱基序列。使用特定的波长来测量荧光物质的面积，确定比率的切割值，并从源自捕获的血清癌的核小体中提取DNA，以检测从捕获的血清癌中衍生的核小体DNA纯化和扩增的条件，使用下一个代序列器进行DNA碱基序列以捕获特征。