バーチャルスライドを用いた牛呼吸器病症候群病理診断データベースの構築

利用虚拟切片构建牛呼吸道疾病综合征病理诊断数据库

• 批准号: 21K05965
• 负责人: 木村 久美子
• 金额: $ 2.58万
• 依托单位: National Agriculture and Food Research Organization
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2021
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2021-04-01 至 2024-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-21K05965/
• 关键词: バーチャルスライド; 牛呼吸器病症候群; データベース; 病理組織学的診断; 獣医病理; 免疫組織化学; WSI

牛呼吸器病症候群（BRDC）は、様々な要因が複雑に関与することによって引き起こされる牛の呼吸器障害の総称である。BRDCでは病態と病原体分離結果が一致しないことも多く、病理学的所見も複雑となり、診断が困難な症例も少なくない。本研究では、BRDCの病理組織学的診断精度向上のために、バーチャルスライド(Whole Slide Image: WSI）によるデジタル画像を用いて、BRDCの病理組織像を比較できるデータベースを構築し、組織所見から類似症例を容易に抽出する方法を開発する。本データベースの構築は、診断の効率化及び標準化に有用である。今年度は、R3年度にWSI化した症例のメタデータを整理し、一部の症例については特殊染色標本、免疫染色標本のWSIデータを追加した。これらの症例について、農研機構統合データベースにデジタル画像とメタデータの登録を行った。それぞれのファイルにはサムネイル画像を付け、ファイルを開かずに画像を確認できるようにした。また、新たにBRDC 7症例を収集し、病理組織学的に解析を行った。一部の症例についてはTeamsやZoomを利用してWSI画像を遠隔地と供覧し、病理組織像の解説あるいはディスカッションを行った。既存および新規症例をあわせて19症例92枚(累計46症例159枚)のBRDC症例をWSI化し、アノテーションを行っている。作成したデータベースの検索には、データベース管理ソフトの活用を検討していたが、他プロジェクトにて構築するWSIメタデータ検索システムを活用することとした。そのために、メタデータ項目を同検索システムと統一させた。今後、メタデータ内の専門用語を同検索システムの語彙に一致するよう修正する予定である。

牛呼吸道疾病综合征（BRDC）是牛的一般术语，这是由于各种因素的复杂参与而引起的。在BRDC中，病理状况和病原体分离结果通常不匹配，病理发现变得复杂，许多情况很难诊断。在这项研究中，为了改善BRDC的组织病理学诊断，我们将构建一个数据库，可以使用虚拟幻灯片（WSI）比较BRDC的组织病理学图像，并开发一种方法来轻松从组织病理学发现中提取相似病例。构建此数据库对于提高诊断效率和标准化非常有用。今年，我们组织了在2013财年转化为WSI的病例的元数据，并在某些特殊的染色标本和免疫染色标本的情况下添加了WSI数据。数字图像和元数据在日本农业研究所的这些情况下的综合数据库中注册。每个文件都有缩略图映像，因此您可以在不打开文件的情况下检查图像。此外，收集了7例新的BRDC病例并在组织病理学上分析。在某些情况下，使用团队和变焦在偏远的位置查看了WSI图像，并对组织病理学图像进行了解释和讨论。总共19例，包括现有病例和新病例，已转换为WSI，并总共有92例BRDC病例（159个累积总数）。我们正在考虑使用数据库管理软件搜索创建的数据库，但决定使用将在其他项目中构建的WSI元数据搜索系统。为此，我们将元数据项目与相同的搜索系统统一。将来，我们计划修改元数据中的术语，以匹配搜索系统的词汇。

项目成果

Co-infection of Deep-seated Mycosis caused by <i>Candida albicans</i>, <i>Aspergillus</i> spp., and Mucorales with Bovine Adenovirus Type 4 Infection in a Japanese Black Calf

日本黑牛犊白色念珠菌、曲霉和毛霉菌与牛腺病毒 4 型合并感染引起的深部真菌病

• DOI: 10.12935/jvma.75.e18
• 发表时间: 2022
• 期刊: Journal of the Japan Veterinary Medical Association
• 作者: 鈴田史子;寺山好美;浦川 了;熊谷飛鳥;木村久美子
• 通讯作者: 木村久美子

牛の肺：牛のRhodococcus equiによる化膿性肉芽腫性肺炎

牛肺：马红球菌引起的牛脓性肉芽肿性肺炎

• 发表时间: 2023
• 作者: 木村久美子;加藤 智
• 通讯作者: 加藤 智