Conservation study of the marine invertebrate brittle star, Ophiothela danae, based on museum specimen DNA

基于博物馆标本 DNA 的海洋无脊椎动物脆星蛇尾蛇 (Ophiothela danae) 保护研究

基本信息

批准号：
21K05632
负责人：
岡西政典
金额：
$ 2.66万
依托单位：
Hiroshima Shudo University (2022)The University of Tokyo (2021)
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份：
2021
资助国家：
日本
起止时间：
2021-04-01 至 2024-03-31
项目状态：
已结题

项目摘要

本研究では、インド―西太平洋海域に生息する小型の海産無脊椎動物である，ニシキクモヒトデ（Ophiothela danae）について，50年前より国立科学博物館（科博）に保管されている日本産の過去の標本と新規採集標本のDNA配列の比較を行うことを目的とした．2022年度は解析を本格化し、2010年代以降に和歌山、神奈川、鹿児島、高知、熊本、沖縄、静岡、三重、長崎、パラオ、タイ、ミャンマーから得られた計156個体の標本より、DNA解析用の腕の断片を収集した。これらは東南アジアを含む日本沿岸を網羅的にカバーし、各地点で5個体以上を含むサンプリングとなるようにつとめ、これらについて、DNAの抽出、濃縮、断片度の測定、並びに次世代シーケンサーによるMI g-seq解析を行った。その結果、全ての標本から目的配列が得られた。これらの断片化を測定したところ、年代が古くなると断片化が進んでいる傾向が確認された。これは、海産無脊椎動物においては、初めての成果となる。同時に、この傾向に合わない標本も見られることから、海産無脊椎動物のDNA解析用の標本の作成のためには、標本液に漬けている時間ではなく、採集から標本化までの時間が重要であることを示していると考えられた。また、これらの配列の解析結果から、東南アジア地域において、北東ほど遺伝的多様性が高いという結果が得られた。このことから、ニシキクモヒトデの分布の中心は温帯域であるという結果が得られた。この成果も海産無脊椎動物では前例がほとんどなく、かつ、他の生物における先行研究とは異なる貴重なものである。

在这项研究中，Nishikikumhitode（Ophiothela Danae）是一个居住在西部的小海洋无脊椎动物，自50年前以来一直存储在国家科学博物馆（部门博物馆）中。标本和新的收集标本。在2022财年，该分析变得完整 - 自2010年代以来，从Wakayama，Kanagawa，Kanagawa，Kochi，Kochi，Kumamoto，Kumamoto，Okinawa，Okinawa，Shizuoka，Shizuoka，Mie，Nagasaki，Palau，Palau，Palau，Palau，Palau，Palau，Thailand，Thailand，Thailand，总计156个标本，用于DNA的DNA。我在手臂上收集了碎片。这些覆盖了日本的海岸，包括东南亚，每个点进行5个或更多，这些是mi g，并且在下一代序列中进行了DNA提取，浓度和片段分析的MI G。。结果，从所有标本中获得目标阵列。当测量这些碎片化时，可以证实当年龄变老时碎片正在发展。这是海上产生的无脊椎动物的第一成就。同时，某些不匹配这种趋势的标本，因此重要的是要收集样品，而不是浸入样品溶液的时间，以创建用于海上生产无脊椎动物的DNA分析的标本动物。此外，对这些阵列的分析也获得了，在东南亚地区，遗传多样性较高。由此，结果是Nishikikumohitode的分布的中心是温度区。这项成就在生产无脊椎动物中也很有价值，并且与其他生物体的研究不同。