Analyse der Evolution von bakteriellen metabolischen Netzwerken durch Verbindung von Systembiologie mit vergleichender Genomik
通过系统生物学与比较基因组学的结合分析细菌代谢网络的进化
基本信息
- 批准号:15805619
- 负责人:
- 金额:--
- 依托单位:
- 依托单位国家:德国
- 项目类别:Research Grants
- 财政年份:2005
- 资助国家:德国
- 起止时间:2004-12-31 至 2009-12-31
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
Die gegenwärtige evolutionäre Dynamik metabolischer Netzwerke ist weitgehend unverstanden. Die wichtigsten genetischen Mechanismen in diesem Prozess sind Genduplikation und horizontale Gentransfers zwischen Bakterienstämmen. Überraschenderweise zeigen unsere Vorarbeiten, dass Genduplikationen nur wenig zur jüngeren Netzwerkevolution in E. coli beigetragen haben. Mit Ansätzen der vergleichenden Genomik werden wir Genduplikationen, horizontale Gentransfers sowie Genverluste innerhalb von 50+ vollständig sequenzierten Bakterienstämmen identifizieren. Mit einem systembiologischen Ansatz werden wir dann die Verteilung von Metabolitenströmen im rekonstruierte Netzwerk von E. coli bestimmen, und damit den Einfluss von Genzugängen und Genverlusten auf das Netzwerk untersuchen. Weiterhin werden wir bestimmen, inwieweit die evolutionären Schicksale von interagierenden Genen verbunden sind, und wie die Genomzusammensetzung die Fähigkeit einer Bakterienart beeinflusst, sich neuen Umgebungen anzupassen. Schließlich werden wir die Transkriptionsregulation von Genen charakterisieren, die erst in jüngerer Zeit in das metabolische Netzwerk integriert wurden.
Netzwerke的演变是第一个死亡的人。该公司将来在Genduplikation的世界中拥有强大的业务,未来已宣布。该公司在Bakterienstenders地区拥有强大的业务。该公司在Genduplikation行业领域拥有强大的业务,目前在该地区未密封。该公司致力于为世界提供最具创新性和创新性的服务。该公司致力于为世界提供最具创新性和创新性的服务。 Schicksale是您可以到达世界边缘和Bakterienart Beeinflusst的地方,而Bakterienage是您可以到达世界边缘的地方。 SchließlichWerdenWirden是转运的地方,Bakterienage是第一次。
项目成果
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