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Repeat structure description within a chromosome 11 target used for Cot-1 tests.

基本信息

DOI：
10.1371/journal.pone.0111756.t002
发表时间：
2014-01-01
期刊：
Figshare
影响因子：
--
通讯作者：
Song, Jun
中科院分区：
其他
文献类型：
Data set
作者： Day, Kenneth;Absher, Devin;Song, Jun研究方向： -- MeSH主题词： --
关键词： --
来源链接：pubmed详情页地址

文献摘要

atotal captured target size is 247.6 kb; target region shown in Figure 4.bout of 50 million sampled reads at 20* Cot-1 concentration.call repeat hg19 coordinates, sizes, and Smith-Waterman (SW) scores obtained from RepeatMasker within the UCSC Genome Browser. For descriptions of RepeatMasker, http://www.repeatmasker.org/.Repeat structure description within a chromosome 11 target used for Cot-1 tests.
捕获的目标总大小为247.6kb；目标区域如图4所示。在20×Cot - 1浓度下，从5000万个采样读段中。调用来自UCSC基因组浏览器中RepeatMasker的重复hg19坐标、大小和Smith - Waterman（SW）分数。有关RepeatMasker的描述，请访问http://www.repeatmasker.org/。用于Cot - 1测试的11号染色体目标内的重复结构描述
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Song, Jun
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