喵ID:RiqZLJ免责声明

基于CD169表达水平的小鼠脾红髓巨噬细胞分型研究

基本信息

DOI:
10.3969/j.issn.1674-8115.2020.06.008
发表时间:
2020
期刊:
上海交通大学学报. 医学版
影响因子:
--
通讯作者:
刘智多
中科院分区:
其他
文献类型:
--
作者: 杨施琪;李梦瑶;刘思明;刘智多研究方向: -- MeSH主题词: --
关键词: --
来源链接:pubmed详情页地址

文献摘要

Objective: Based on the expression level of sialoadhesin (Sn), namely CD169 molecule, in mouse splenic red pulp macrophages, to study the differences in gene expression profiles between CD169+ and CD169- red pulp macrophage subsets. Methods: Flow cytometry and immunofluorescence were used to detect the expression of CD169 in splenic red pulp macrophages of C57BL/6J wild-type (WT) mice, with CD169 knockout (CD169KO) mice as a negative control. The F4/80+ splenic red pulp macrophages were enriched and two subsets of CD169+ and CD169- were sorted out for RNA sequencing. The DESeq2 software was used to screen out differentially expressed genes with the condition of P < 0.05 and |log2FC| ≥ 1. Through the Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG) functional analysis, the differential genes were classified according to the pathways or functions they participated in. Some of the differential genes were verified by quantitative real-time PCR (qPCR). Results: Flow cytometry and immunofluorescence confirmed that some red pulp macrophages expressed CD169. There were 485 differentially expressed genes in the CD169+ and CD169- subsets. Some genes related to mediating inflammation were highly expressed in the CD169- subset. Conclusion: CD169+ and CD169- red pulp macrophages have different transcriptional profiles, and the CD169- red pulp macrophage subset has more characteristics of M1-type macrophages.
目的·基于小鼠脾红髓巨噬细胞唾液酸黏附蛋白(sialoadhesin,Sn)即CD169分子的表达水平,研究CD169~+ 和CD169~- 红髓巨噬细胞亚群的基因表达谱差异。方法·采用流式细胞术和免疫荧光法检测C57BL/6J野生型(WT)小鼠脾红髓巨噬细胞中CD169的表达,以CD169敲除(CD169KO)小鼠为阴性对照。富集F4/80~+ 的脾红髓巨噬细胞并分选出CD169~+ 和CD169~- 2个亚群,进行RNA测序。利用DESeq2软件以P<0.05且|log_2FC| ≥ 1为条件筛选出差异表达基因,通过京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes,KEGG)功能分析,将差异基因按照参与的通路或功能进行分类。通过实时荧光定量PCR(quantitative realtime PCR,qPCR)验证部分差异基因。结果·流式细胞术和免疫荧光法证实部分红髓巨噬细胞表达CD169。CD169~+ 和CD169~- 亚群拥有485个差异表达基因。一些与介导炎症相关的基因在CD169~- 亚群中高表达。结论·CD169~+ 和CD169~- 红髓巨噬细胞有不同的转录谱,CD169~- 红髓巨噬细胞亚群具有更多M1型巨噬细胞的特征。
参考文献(0)
被引文献(0)

数据更新时间:{{ references.updateTime }}

关联基金

CCR4控制调节性T细胞的空间分布及其对自身免疫性疾病的作用
批准号:
31870871
批准年份:
2018
资助金额:
60.0
项目类别:
面上项目
刘智多
通讯地址:
--
所属机构:
--
电子邮件地址:
--
免责声明免责声明
1、猫眼课题宝专注于为科研工作者提供省时、高效的文献资源检索和预览服务;
2、网站中的文献信息均来自公开、合规、透明的互联网文献查询网站,可以通过页面中的“来源链接”跳转数据网站。
3、在猫眼课题宝点击“求助全文”按钮,发布文献应助需求时求助者需要支付50喵币作为应助成功后的答谢给应助者,发送到用助者账户中。若文献求助失败支付的50喵币将退还至求助者账户中。所支付的喵币仅作为答谢,而不是作为文献的“购买”费用,平台也不从中收取任何费用,
4、特别提醒用户通过求助获得的文献原文仅用户个人学习使用,不得用于商业用途,否则一切风险由用户本人承担;
5、本平台尊重知识产权,如果权利所有者认为平台内容侵犯了其合法权益,可以通过本平台提供的版权投诉渠道提出投诉。一经核实,我们将立即采取措施删除/下架/断链等措施。
我已知晓