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The complete mitochondrial genome of Himalayan Snowcock (Tetraogallus himalayensis)

喜马拉雅雪鸡 (Tetraogallus Himalayensis) 的完整线粒体基因组

基本信息

DOI:
10.3109/19401736.2015.1079889
发表时间:
2016-09
期刊:
Mitochondria DNA
影响因子:
--
通讯作者:
Lixun Zhang
中科院分区:
其他
文献类型:
--
作者: Lixun Zhang研究方向: -- MeSH主题词: --
关键词: --
来源链接:pubmed详情页地址

文献摘要

We reported here the first complete sequences of mitogenome of Tetraogallus himalayensis.obtained by next generation sequencing methods. The assembled mitogenome is a 16 692 bp.circle, comprising of 13 protein-coding genes, two rRNA genes (12S rRNA and 16S rRNA), 22.tRNA genes, and one control region. The resultant phylogenetic tree supported T. himalayensis.and T. tibeanus are sister taxon, and Tetraogallus with Alectoris and coturnix formed a.monophyletic group.
我们在此报道了通过新一代测序方法获得的喜马拉雅雪鸡(Tetraogallus himalayensis)线粒体基因组的首批完整序列。组装后的线粒体基因组是一个16692bp的环状结构,包含13个蛋白质编码基因、两个核糖体RNA基因(12S rRNA和16S rRNA)、22个tRNA基因以及一个控制区。由此构建的系统发育树支持喜马拉雅雪鸡和藏雪鸡(T. tibeanus)为姐妹分类群,并且雪鸡属(Tetraogallus)与石鸡属(Alectoris)和鹌鹑属(Coturnix)构成一个单系群。
参考文献(6)
被引文献(1)
Relaxation of selective constraints on avian mitochondrial DNA following the degeneration of flight ability
DOI:
10.1101/gr.093138.109
发表时间:
2009-10-01
期刊:
GENOME RESEARCH
影响因子:
7
作者:
Shen, Yong-Yi;Shi, Peng;Zhang, Ya-Ping
通讯作者:
Zhang, Ya-Ping
Phylogenetic position of the genus Tetraophasis (Aves, Galliformes, Phasianidae) as inferred from mitochondrial and nuclear sequences
DOI:
10.1016/j.bse.2008.01.007
发表时间:
2008-08-01
期刊:
BIOCHEMICAL SYSTEMATICS AND ECOLOGY
影响因子:
1.6
作者:
Meng, Yang;Dai, Bo;Yue, Bisong
通讯作者:
Yue, Bisong
Phylogeny and Molecular Evolution of Tetraogallus in China
DOI:
10.1007/s10528-005-8167-y
发表时间:
2005-10
期刊:
Biochemical Genetics
影响因子:
2.4
作者:
Ruan Luzhang;Zhang Lixun;Wen Long-ying;Sun Qingwei;Liu Naifa
通讯作者:
Ruan Luzhang;Zhang Lixun;Wen Long-ying;Sun Qingwei;Liu Naifa
A mitogenomic perspective on the ancient, rapid radiation in the Galliformes with an emphasis on the Phasianidae.
DOI:
10.1186/1471-2148-10-132
发表时间:
2010-05-06
期刊:
BMC evolutionary biology
影响因子:
3.4
作者:
Shen YY;Liang L;Sun YB;Yue BS;Yang XJ;Murphy RW;Zhang YP
通讯作者:
Zhang YP
Mitogenomic analyses propose positive selection in mitochondrial genes for high-altitude adaptation in galliform birds.
线粒体基因组分析提出了鸡形鸟类高海拔适应的线粒体基因的正向选择。
DOI:
10.1016/j.mito.2014.07.012
发表时间:
2014-09
期刊:
Mitochondrion
影响因子:
4.4
作者:
Shen, Xuejuan;Irwin, David M;Shen, Yongyi;Zhang, Yaping
通讯作者:
Zhang, Yaping

数据更新时间:{{ references.updateTime }}

关联基金

藏雪鸡地理种群羽色表型变异与适应进化的生态遗传学研究
批准号:
31372195
批准年份:
2013
资助金额:
82.0
项目类别:
面上项目
Lixun Zhang
通讯地址:
--
所属机构:
--
电子邮件地址:
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