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鼠伤寒沙门菌小RNA GcvB靶基因的预测与验证

基本信息

DOI:
10.11843/j.issn.0366-6964.2020.04.027
发表时间:
2020
期刊:
畜牧兽医学报
影响因子:
--
通讯作者:
杨琦
中科院分区:
其他
文献类型:
--
作者: 潘永;刘丽娟;杨阳;李晨;马光强;杨琦研究方向: -- MeSH主题词: --
关键词: --
来源链接:pubmed详情页地址

文献摘要

该研究进行了靶标RNA GCVB研究,以评估包括GCVB,R1,R2和R3活性因子在内的靶标RNA2活性,以及​​对GCVB研究的评估,以消除GCVB研究的发展,以确定KEGG的数量并进行财富分析,并使用PCR的光度测定。 targetRNA2结果表明,Yeak,TRPB和STM2732的最高活性与小RNA GCVB相同,而Yeak,TrpB和STM2732的数量与7个不同组的数量,Nary,Yeak,Yeak,TRPB和TRPB相同,与Yeak,TRPB,TRPB和TRPB和TRPB和TRPB和TRPB和TRPB的综合。光度PCR结果表明,结果表明,Nary,Yeak,TrpB和STM2732是由于GCVB造成的,并且详细介绍GCVB的条件,上面的水平除法为3.4、9.8、12.1,总计18.37次。以上是结果的陈述,包括低区域RNA GCVB,它是从NARY,YEAK和TRPB接收的小RNA。这项研究的重点是小的RNA GCVB,小的RNA响应机制以及预防引起疾病的疾病的相互作用。
为筛选鼠伤寒沙门菌小RNA GcvB调控的靶基因,本研究通过TargetRNA2软件预测能与GcvB R1、R2和R3区产生作用的基因,将鼠伤寒沙门菌gcvB基因敲除株的转录组测序结果注释到KEGG数据库以及GO富集分析,并利用荧光定量PCR对预测的靶基因进行验证。TargetRNA2的预测结果显示,杂交能量最高的narY、 yeaK、trpB和STM2732基因均能够和小RNA GcvB产生至少7个连续的碱基互补,narY、yeaK和trpB基因分别与鼠伤寒沙门菌无氧呼吸、脯氨酸与tRNA的识别以及色氨酸的合成相关。荧光定量PCR检测结果显示,narY、 yeaK、trpB和STM2732基因在gcvB基因敲除条件下转录水平分别上调3.4、9.8、12.1和18.37倍。以上结果表明,narY、yeaK、trpB和STM2732基因受小RNA GcvB的负调控且可能为直接负调控。本研究为进一步探明小RNA GcvB与靶基因相互作用、小RNA的调控机制以及沙门菌致病机制奠定了基础。
参考文献(0)
被引文献(0)

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关联基金

沙门氏菌中伴侣蛋白Hfq与小RNA的相互作用方式以及对靶基因的调控机理分析
批准号:
31760740
批准年份:
2017
资助金额:
39.0
项目类别:
地区科学基金项目
杨琦
通讯地址:
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所属机构:
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电子邮件地址:
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