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应用QM与ABEEM/MM结合的方法研究NAMI-A的结构性质

基本信息

DOI:
10.6023/a13060606
发表时间:
2013-07
影响因子:
2.5
通讯作者:
Yang Zhongzhi
中科院分区:
化学3区
文献类型:
--
作者: Zou Huiyuan;Zhao Dongxia;Yang Zhongzhi研究方向: -- MeSH主题词: --
关键词: --
来源链接:pubmed详情页地址

文献摘要

The structural properties of the anticancer drug NAMI - A in aqueous solution were studied by the method combining applied quantum mechanics (QM) with the ABEEM fluctuating charge force field (ABEEM/MM). All the structural optimizations were completed under the B3LYP method of DFT with 6 - 31G(d,p) and LanL2DZ basis sets without any restrictive conditions. The results show that the optimized NAMI - A configurations change under the influence of different environments and methods. Compared with the configurations obtained in the gas phase, the configurations obtained by QM/MM iterative optimization change more significantly than those of PCM. The changes of the NAMI - A configurations obtained by QM/MM (ABEEM/MM) iterative optimization are smaller than those of QM/MM (OPLS - AA). In conclusion, the solvent through polarization...
应用量子力学(QM)与ABEEM浮动电荷力场(ABEEM/MM)相结合的方法研究了抗癌药物NAMI-A在水溶液中的结构性质.所有的结构优化都是在DFT的B3LYP方法下采用6-31G(d,p)和LanL2DZ基组完成的,没有加入任何限制性条件.结果表明,优化得到的NAMI-A构型受不同环境及方法的影响均有变化.与气相中得到的构型相比,QM/MM迭代优化得到构型要比PCM的构型变化更明显.QM/MM(ABEEM/MM)迭代优化得到的NAMI-A构型比QM/MM(OPLS-AA)的变化要小.总之,溶剂通过极化
参考文献(0)
被引文献(4)

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关联基金

构建和发展先进的新一代可极化分子力场- - 探索和模拟复杂分子体系结构性能的新方法
批准号:
21133005
批准年份:
2011
资助金额:
280.0
项目类别:
重点项目
Yang Zhongzhi
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