中国反刍动物源十二指肠贾第虫集聚体E宿主特异性遗传基础研究

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号：
    31802181
  • 项目类别：
    青年科学基金项目
  • 资助金额：
    25.0万
  • 负责人：
    王海燕
  • 依托单位：
    河南牧业经济学院
  • 学科分类：
    C1805.兽医寄生虫学
  • 结题年份：
    2021
  • 批准年份：
    2018
  • 项目状态：
    已结题
  • 起止时间：
    2019-01-01 至2021-12-31

项目摘要

Giardia duodenalis, a newly-discovered zoonotic disease, can infect various animals and humans, mostly the ruminants. Applicant research group has found there is a significant genetic difference between G. duodenalis subtypes of assemblage E from different ruminants. Whether the assemblage E subtype presents the host-specific genetic characteristics as the sub-assemblage A and B is required to be further studied. In this project, the ruminantsl-derived G.duodenalis isolates are as the main research object. New 4～6 polymorphic gene loci will be selected and be used in the multilocus sequencde typing (MLST). According to the sequence data of MLST, the genetic polymorphism, the recombination frequence, the linkage disequilibrium, as well as the genetic difference degree among different animal populations will be calculated. The present project will focus on understanding the host-specificgenetic characteristics of G. duodenalis assemblage E from various ruminants in China. The data obtained in this project should have direct significance in elucidating the biology, the transmission among different hosts, and the infection source of G. duodenalis. Moreover, This project will provide technical support for monitoring and tracing the infection source of foodborne/waterborne outbreak cases in China.
十二指肠贾第虫（Giardia duodenalis）是新发人兽共患原虫，可感染多种动物和人类，其中以反刍动物感染最为常见。申请人课题组前期研究发现，中国地区不同反刍动物源集聚体E亚型之间存在显著的遗传差异性，集聚体E亚型是否像集聚体A和B型一样呈现宿主特异性遗传特性有待于深入研究。鉴于此，本项目以我i国西部和高原地区分离鉴定的反刍动物源和人源G.duodenalis集聚体E分离株为主要研究对象，筛选4～6个多态性基因位点进行多位点序列分型（MLST），依据MLST数据计算G.duodenalis的遗传多态性、重组频率、连锁不平衡以及在不同动物群体间的遗传差异程度等，重点研究我国G.duodenalis集聚体E宿主特异性遗传特性。研究结果对于阐明G.duodenalis的生物学特性、在不同宿主间的传播以及感染来源等具有直接意义，同时为我国食源性/水源性暴发病例的监测和溯源等提供技术支持。

结项摘要

十二指肠贾第虫是一种寄生于人和多种哺乳动物肠道内的原虫，可引起以腹泻为主的贾第虫病。该病呈世界性分布，现已列入全世界危害人类健康的10种主要寄生虫病之一 。研究我国不同动物源的十二指肠贾第虫感染率、亚型分布特征、遗传变异规律等特征可为解析其传播动力学、人兽共患传播机制提供基础资料。在本项研究中，我们采集中国非人灵长类、赛马、反刍动物（骆驼、奶牛、牦牛）等动物粪便样品，利用SSU rRNA基因位点对其进行PCR扩增、测序和基因型鉴定，筛选集聚体B和E的阳性分离株，并进行MLST分型，依据 MLST 数据计算十二指肠贾第虫的遗传多态性、重组频率、连锁不平衡以及在不同动物群体间的遗传差异程度。结果显示：1. 区域种群间的两两分析得出，来自中国五个不同地区（西： 新疆；东：上海；南：广东；北：陕西；中原：河南）的奶牛源十二指肠贾第虫集聚体E之间的F ST值为0.243 ~ 0.992和N m值为0.002 ~ 0.779，巨大的分化数值表明十二指肠贾第虫集聚体E分离株在五个地理隔离区存在大量的遗传分化特征和有限基因分流特征；Median-joining network分析形成了五个不同的networks。总之，系列进化、基因流分析和Median-joining network分析表明，奶牛十二指肠贾第虫集聚体E存在地理隔离性特征；2. 确定了中国非人灵长类、赛马的十二指肠贾第虫BIV为优势基因型。但赛马、人类、非人灵长类不同动物的BIV MLGs亚型存在明显遗传差异；种系进化分析表明十二指肠贾第虫亚群BIV存在宿主适应性特征，暗示了十二指肠贾第虫存在从人兽共患性到宿主适应性的定向遗传分化。研究结果可以增强我们对十二指肠贾第虫传播动力学的理解，同时可为我国食源性/水源性感染病例的监测和溯源等提供技术支持。

项目成果

期刊论文数量（6）
专著数量（0）
科研奖励数量（0）
会议论文数量（0）
专利数量（0）
Detection and genetic characterization of Giardia duodenalis in pigs from large-scale farms in Xinjiang, China,
中国新疆大型猪场猪十二指肠贾第鞭毛虫的检测和遗传特征
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    2019
  • 期刊：
    Parasite
  • 影响因子：
    2.9
  • 作者：
    Bo Jing;Ying Zhang;Chunyan Xu;Dongfang Li;Jinming Xing;Dayong Tao;Longxian Zhang;Meng Qi;Haiyan Wang
  • 通讯作者：
    Haiyan Wang
Prevalence and multilocus analysis of Giardia duodenalis in racehorses in China
我国赛马十二指肠贾第鞭毛虫患病率及多位点分析
  • DOI：
    10.1111/imm.13167
  • 发表时间：
    2020
  • 期刊：
    Parasitology Research
  • 影响因子：
    2
  • 作者：
    Meng Qi;Xiangbo Ji;Bo Jing;Longxian Zhang;Haiyan Wang;Mingfei Sun
  • 通讯作者：
    Mingfei Sun
Occurrence, risk factors and genotypes ofEnterocytozoon bieneusiin dogs and cats in Guangzhou, southern China: high genotype diversity and zoonotic concern
中国南方广州犬猫肠细胞虫的发生、危险因素和基因型：高基因型多样性和人畜共患问题
  • DOI：
    10.1186/s12917-020-02421-4
  • 发表时间：
    2020
  • 期刊：
    BMC Veterinary Research
  • 影响因子：
    2.6
  • 作者：
    Wang Haiyan;Lin Xuhui;Sun Yongxiang;Qi Nanshan;Lv Minna;Xiao Wenwan;Chen Yuancai;Xiang Ruiping;Sun Mingfei;Zhang Longxian
  • 通讯作者：
    Zhang Longxian
Dominance of zoonotic genotype D of Enterocytozoon bieneusi in bamboo rats (Rhizomys sinensis)
竹鼠(Rhizomys sinensis)中比氏肠细胞虫人畜共患基因型D的优势
  • DOI：
    10.1016/j.meegid.2019.04.025
  • 发表时间：
    2019
  • 期刊：
    Infection, Genetics and Evolution
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    Wang Haiyan;Liu Qiang;Jiang Xiumei;Zhang Ying;Zhao Aiyun;Cui Zhaohui;Li Dongfang;Qi Meng;Zhang Longxian
  • 通讯作者：
    Zhang Longxian
Duplex TaqMan real-time PCR assay for simultaneous detection and quantification of Anaplasma capra and Anaplasma phagocytophilum infection
双工 TaqMan 实时 PCR 检测同时检测和定量山羊无形体和嗜吞噬细胞无形体感染
  • DOI：
    10.1016/j.mcp.2019.101487
  • 发表时间：
    2020
  • 期刊：
    Molecular and Cellular Probes
  • 影响因子：
    3.3
  • 作者：
    Song Jinxing;Zhao Shanshan;Li Yueqin;Wang Haiyan;Zhang Liwei;Wang Jun;Ning Changshen;Peng Yongshuai
  • 通讯作者：
    Peng Yongshuai

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  • 作者：
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    --
  • 发表时间：
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  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    张正勇;沙敏;冯楠;王海燕
  • 通讯作者：
    王海燕

其他文献

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课题项目：调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要：

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题，其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子，其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而，TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用，影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法，探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用，为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义，并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路：

科学问题：TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达？
前期研究：已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应，但其具体机制尚不明确。
研究创新点：本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线：包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术：TRIM2与病毒RNA的相互作用分析，IFN-β启动子活性检测。
实验模型：使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
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