HDAC1介导的组蛋白修饰对KSHV复制速率的调控机制研究

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    81672006
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    50.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    H2105.疱疹病毒与感染
  • 结题年份:
    2020
  • 批准年份:
    2016
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2017-01-01 至2020-12-31

项目摘要

Kaposi's sarcoma-associated herpesvirus (KSHV) has been documented as the major contributor to primary effusion lymphoma (PEL) and Multicentric Castleman's Disease (MCD), which are B-cell lymphomas and mainly occurs in the immuosuppressed population such as AIDS patients and seniors. Persistent replication of KSHV plays a critical role in the development of KSHV-associated B-cell lymphomas because most B cells in PEL and MCD are latently infected by KSHV. In this proposed project, we will characterize the KSHV replication on its genome with histone acetylation using ChIP-seq and Single Molecule Analysis of Replicated DNA (SMARD) technology. Our aims are: 1) characterizing the KSHV replication controlled by HDAC1-mediated histone acetylation on KSHV genome during latency in B cells and confirming the mechanism of viral replication rate controlled by histone acetylation; 2) Comparing the patterns of histone acetylation and viral replication across KSHV genome in the T and B cells from primary infection of human PBMCs and elucidating the critical role of KSHV replication rate in inducing B-cell immortalization; 3) Establishing the relationship of the HDAC1 inhibitors and KSHV replication rate in infected B-cell lymphomas and primary B cells, and developing B-cell evaluation system for HDAC1 inhibitors, further providing the possibilities for developing HDAC inhibitors (HDACi) for the combination therapy of KSHV associated B-cell lymphomas.
卡波氏肉瘤相关疱疹病毒(KSHV)是原发渗出性淋巴瘤(PEL)和多中心卡斯特曼病(MCD)等B细胞淋巴瘤的主要病原体,多发于免疫力低下的人群。持续复制是KSHV在B细胞中建立潜伏态并永生化B细胞的必要条件。本项目拟利用ChIP-seq和单分子复制DNA分析技术(SMARD)对KSHV基因组上高度组蛋白乙酰化区域的复制状态进行可视化及定量分析,达到以下目的:1)阐明HDAC1通过组蛋白乙酰化修饰控制KSHV复制的单分子特征,验证乙酰化修饰对KSHV复制速率的控制;2)分析原发感染的T和B细胞中KSHV基因组上组蛋白乙酰化修饰和单分子复制的特征,阐明其差异性,并解释该病毒复制能力对其诱导B细胞永生化的重要性;3)量化HDAC1抑制剂与KSHV在感染B细胞中复制速率的对应关系,探索建立一个评估HDAC1抑制剂系统,为研发协同治疗KSHV相关淋巴瘤的组蛋白去乙酰化酶抑制剂(HDACi)奠定基础。

结项摘要

原发性淋巴瘤(primary effusion lymphoma,PEL)是由卡波西肉瘤疱疹相关病毒(Kaposi’s Sarcoma-Associated Herpesvirus,KSHV)引起的B细胞淋巴瘤,多发于免疫力低下的人群。目前,关于PEL的致瘤机制尚不清楚。相关研究已表明细胞转录共激活因子p300能够调节宿主与病毒之间的相互作用,从而控制病毒复制过程。在此项目的支持下,本人带领课题组探索了p300在KSHV感染的BCBL1细胞中的功能。首先构建了稳定敲除p300的B淋巴细胞系,然后通过RNAseq检测了病毒和细胞因子的基因表达,最后分析了细胞内的KSHV基因组拷贝数和病毒粒子的产量以及B淋巴瘤细胞的增殖情况。结果发现p300对抑制BCBL1中的KSHV病毒复制及控制细胞的增殖起着重要作用,并鉴定相关控制B淋巴瘤的关键细胞因子ATF3。这为进一步开发治疗原发性淋巴瘤的药物奠定理论基础。

项目成果

期刊论文数量(4)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(3)
Inhibition of human cytomegalovirus major capsid protein expression and replication by ribonuclease P-associated external guide sequences
核糖核酸酶 P 相关外部引导序列对人巨细胞病毒主要衣壳蛋白表达和复制的抑制
  • DOI:
    10.1261/rna.069682.118
  • 发表时间:
    2019-05-01
  • 期刊:
    RNA
  • 影响因子:
    4.5
  • 作者:
    Deng,Qiudi;Liu,Yujun;Liu,Fenyong
  • 通讯作者:
    Liu,Fenyong
A versatile assay for alkaline phosphatase detection based on thymine-Hg-II-thymine structure generation mediated by TdT
基于 TdT 介导的胸腺嘧啶-Hg-II-胸腺嘧啶结构生成的多功能碱性磷酸酶检测方法
  • DOI:
    10.1016/j.talanta.2018.11.061
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
    Talanta
  • 影响因子:
    6.1
  • 作者:
    Wang Yuanyuan;Yang Li;Li Nan;Sun Chuankai;Xia Yiping;Yuan Libo;Lu Jie;Liu Fenyong;Xing Xiwen
  • 通讯作者:
    Xing Xiwen
p300 promotes cell proliferation through suppressing Kaposi’s sarcoma-associated herpesvirus (KSHV) reactivation in the infected B-lymphoma cells
p300 通过抑制受感染 B 淋巴瘤细胞中卡波西肉瘤相关疱疹病毒 (KSHV) 的再激活来促进细胞增殖
  • DOI:
    10.1016/j.virusres.2020.198066
  • 发表时间:
    2020
  • 期刊:
    Virus Research
  • 影响因子:
    5
  • 作者:
    Chuankai Sun;Yizhen Guo;Wei Zhou;Chuan Xia;Xiwen Xing;Jun Chen;Xin Li;Hua Zhu;Jie Lu
  • 通讯作者:
    Jie Lu
Brevilin A, a Sesquiterpene Lactone, Inhibits the Replication of Influenza A Virus In Vitro and In Vivo
Brevilin A 是一种倍半萜内酯,可抑制甲型流感病毒的体外和体内复制
  • DOI:
    10.3390/v11090835
  • 发表时间:
    2019-09-01
  • 期刊:
    VIRUSES-BASEL
  • 影响因子:
    4.7
  • 作者:
    Zhang, Xiaoli;Xia, Yiping;Xia, Chuan
  • 通讯作者:
    Xia, Chuan

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  • 通讯作者:
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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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