NF-κB分子的选择性剪接对栉孔扇贝免疫应答的调控

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    30901115
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    20.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C1907.水产生物免疫学
  • 结题年份:
    2012
  • 批准年份:
    2009
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2010-01-01 至2012-12-31

项目摘要

NF-κB/IκB通路是一条在进化上比较保守的免疫信号传导通路,其在机体免疫应答反应中发挥着重要作用。通过前期研究,课题组从栉孔扇贝中获得了该通路的多个关键基因,并且发现栉孔扇贝NF-κB分子存在选择性剪接现象。本课题拟采用Genome Walking等技术从栉孔扇贝中克隆NF-κB分子全基因序列及不同剪接异构体的cDNA序列,检测不同NF-κB异构体对免疫应答反应的调控作用,探讨影响NF-κB分子选择性剪接的因素;通过EMSA、Pull down、免疫共沉淀、转染试验等,解析NF-κB异构体转录激活功能的差异以及其与IκB1、IκB2抑制活性的对应关系,探究不同NF-κB异构体间的相互协调方式。通过开展上述研究,深入探讨栉孔扇贝免疫防御的分子机制,为其病害防治和健康养殖提供理论依据;同时为探索已存在数十亿年、从低等生物到人类仍然保留的原始固有免疫信号通路的进化提供证据。

结项摘要

在基金项目的资助下,通过RACE技术从栉孔扇贝中获得了NF-κB、IκB等该通路的多个关键基因,发现NF-κB分子cDNA序列存在不同的长度;分析表明,NF-κB-1分子含有完整RHD结构域和转录激活结构域,而NF-κB-2则仅具有部分RHD结构域,缺乏转录激活结构域;在此基础上,通过Genome walking技术克隆得到NF-κB分子的全基因序列,确认了不同长度的NF-κB分子是同一基因选择性剪接的不同产物。采用Western blot技术分析了NF-κB-1蛋白的细胞分布及LPS刺激后核内蛋白含量的变化情况;结果发现,正常生理状态下,NF-κB-1在胞质和核内均有分布,其中核内含量要高于胞质;在LPS刺激3h和12h后,栉孔扇贝血淋巴细胞核内NF-κB-1蛋白含量显著增加,表明NF-κB已移位到细胞核内调控相关基因的转录。采用NF-κB荧光素酶报告基因系统检测了NF-κB的转录活性和IκB的转录抑制活性;结果发现,NF-κB-1具有显著的转录激活活性(122.43%,P<0.05),而共转染IκB则可显著抑制NF-κB-1的转录激活活性(17.61%,P<0.05)。利用荧光定量PCR 分析了栉孔扇贝NF-κB-1基因在脂多糖(LPS)、肽聚糖(PGN)刺激后的时序表达情况;结果发现,LPS刺激导致NF-κB基因表达水平变化显著:在6 h表达水平为对照组的25.25倍;随后降至对照组水平,在24 h再次升高并达到最大值(59.66倍)。在PGN刺激组,NF-κB基因的表达量在3 h升高至最大值(2.35倍),随后恢复至对照组水平。采用半定量RT-PCR方法检测了LPS刺激后NF-κB-2基因的表达情况;结果发现,在正常生理状态下及LPS刺激早期阶段,NF-κB-2转录本表达水平仍处于较低状态;随着LPS刺激时间的延长,NF-κB-2基因表达水平出现上调,表明NF-κB-2分子可能作为NF-κB/IκB信号通路的负调控分子发挥作用。此外,建立了正常血淋巴细胞以及经鳗弧菌和藤黄微球菌刺激后的血淋巴细胞SAGE文库;分析发现,Toll receptor、TRAF6等NF-κB/IκB信号通路相关分子参与了宿主抵抗鳗弧菌感染的免疫应答。上述结果表明,NF-κB/Iκ通路在栉孔扇贝的免疫应答反应中发挥着重要作用,而NF-κB分子的选择性剪接可能是该信号通路调节方式之一。

项目成果

期刊论文数量(4)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
An inhibitor B homologue from bay scallop Argopecten irradians
抑制剂
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
    Fish &amp; Shellfish Immunology
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Changkao Mu;Yundong Yu;Jianmin Zhao;Lingling Wang;Xiaoyan Song;Huan Zhang;Limei Qiu;Linsheng Song
  • 通讯作者:
    Linsheng Song
A primitive Toll-like receptor signaling pathway in mollusk Zhikong scallop Chlamys farreri
软体动物直孔扇贝栉孔扇贝原始Toll样受体信号通路
  • DOI:
    10.1016/j.dci.2010.12.005
  • 发表时间:
    2011-04-01
  • 期刊:
    DEVELOPMENTAL AND COMPARATIVE IMMUNOLOGY
  • 影响因子:
    2.9
  • 作者:
    Wang, Mengqiang;Yang, Jialong;Song, Linsheng
  • 通讯作者:
    Song, Linsheng
Molecular characterization of a novel big defensin from clam Venerupis philippinarum.
菲律宾蛤蜊新型大防御素的分子表征
  • DOI:
    10.1371/journal.pone.0013480
  • 发表时间:
    2010-10-20
  • 期刊:
    PloS one
  • 影响因子:
    3.7
  • 作者:
    Zhao J;Li C;Chen A;Li L;Su X;Li T
  • 通讯作者:
    Li T
The positive response of a Rel\NF-B homologue in scallop Chlamys farreri during the immune stimulation
Rel\NF- 的积极响应
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
    Fish &amp; Shellfish Immunology
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Zhi Zhou;Mengqiang Wang;Jianmin Zhao;Linsheng Song;Yang Gao;Huan Zhang;Rui Liu;Lingling Wang
  • 通讯作者:
    Lingling Wang

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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