甲基化酶Setd1a调控Oct4转录活性及其在干细胞特性维持和体细胞重编程中的作用和机制研究

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AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31271360
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    80.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C0601.遗传物质结构与功能
  • 结题年份:
    2016
  • 批准年份:
    2012
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2013-01-01 至2016-12-31

项目摘要

Embryonic stem (ES) cells are pluripotent cell lines which can contribute differentiated progeny to all adult tissues. The pluripotent identity of ES cells is governed by a coordinated regulatory network consisting of signaling pathways, key transcriptional factors (e.g. Oct4, Sox2, Klf4 and c-Myc) and epigenetic regulatory factors. While much progress has been made in identification and characterization of the signaling pathways and transcriptional factors important for ES cell pluripotency, less is known for epigenetic regulatory factors involved, and their functional selectivity and specificity. We have carried out a systemic protein-protein interaction analysis examining the interaction of a large number of epigenetic regulatory factors with Oct4, Sox2, Klf4 and c-Myc and uncovered a specific interaction between Setd1a and Oct4. In this proposal, we will investigate the role of Setd1a in transcriptional program regulated by Oct4 and the underlying mechanism. A genome wide transcription and localization study will be carried to determine the transcriptional program and target genes regulated by Setd1a and the functional relationship between Setd1a and Oct4. In addition, we will determine the role of Setd1a in maintenance of ES pluripotency and reprogramming of somatic cells to induced pluripotency cells (iPS). This study will provide new insight into how the specific functional interplay between a transcription factor and epigenetic regulator contributes to regulation of pluripotency.
胚胎干细胞(ES)是一种具有全能性的干细胞,在特定条件下能特化成各种功能细胞,从而构成机体各种复杂的组织器官。研究表明ES细胞的全能性维持受细胞信号通路,核心转录因子(如Oct4, Sox2, Klf4和c-Myc)和表观调控因子等组成的网络协同调控,但表观调控因子的选择性和特异性目前还研究较少。通过系统分析表观调控因子和核心转录因子Oct4, Sox2, Klf4和c-Myc的相互作用,本课题前期工作发现组蛋白甲基化酶Setd1a能特异与Oct4相互作用。在此基础上,本课题拟重点研究Setd1a这一组蛋白H3K4甲基化酶在Oct4的转录调控中的作用,在基因组水平上研究确定Setd1a与Oct4靶基因的相关性,研究确定Setd1a在ES细胞干性维持和细胞重编程中的功能和作用机制。本项目的顺利实施将促进对干细胞核心转录因子与表观调控因子如何协同调控和维持干细胞命运的深入了解。

结项摘要

目前研究表明有限的几个核心转录因子和转录共调控因子在胚胎干细胞的转录调控及干性维持中起着重要作用,但核心转录因子与共调控因子之间如何相互作用及功能协同则还不清楚。我们较系统的分析了胚胎干细胞四个核心转录因子Oct4, Sox2, Klf4 和Myc (简称OSKM)与一系列共调控因子的相互作用,发现两者之间存在共同及特异的相互作用。我们发现在SET1/MLL家族H3K4甲基化酶中,Set1a特异地与Oct4相互作用并且这种相互作用不依赖于Wdr5。我们发现Set1a被Oct4招募至Oct4靶基因并且为Oct4靶基因启动子H3K4甲基化所必须。此外,我们发现Set1a为胚胎干细胞干性维持所必须并且促进体细胞向胚胎干细胞的重编程。基因表达谱式分析及基因组染色质免疫共沉淀分析发现Set1a广泛参与Oct4转录调控并且富集于基因启动子。基因敲除实验证明Set1a不仅为小鼠早期胚胎发育所必须,而且为产生表达Oct4的胚胎细胞所必须。我们的研究工作为OSKM与转录共调控因子的相互作用提供了有价值的信息并且为Set1a在胚胎干细胞及胚胎发育中的重要性提供了分子机制解释。

项目成果

期刊论文数量(3)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
A Methylation-Phosphorylation Switch Determines Sox2 Stability and Function in ESC Maintenance or Differentiation
甲基化-磷酸化开关决定 Sox2 在 ESC 维持或分化中的稳定性和功能
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2014
  • 期刊:
    Molecular Cell
  • 影响因子:
    16
  • 作者:
    Tong; Yufeng;Li; Jiwen;Du; James X.;Wong; Jiemin
  • 通讯作者:
    Jiemin
H3K4 Methyltransferase Set1a Is A Key Oct4 Coactivator Essential for Generation of Oct4 Positive Inner Cell Mass
H3K4 甲基转移酶 Set1a 是生成 Oct4 阳性内细胞团所必需的关键 Oct4 共激活剂
  • DOI:
    10.1002/stem.2250
  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
    Stem Cells
  • 影响因子:
    5.2
  • 作者:
    Li; Jiwen;Li; Jiwen;Wong; Jiemin;Wong; Jiemin
  • 通讯作者:
    Jiemin

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  • 通讯作者:
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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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