基于比较蛋白质组研究策略的食管癌血清蛋白标志物识别及其功能分析

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AI项目解读

基本信息

  • 批准号：
    81072259
  • 项目类别：
    面上项目
  • 资助金额：
    35.0万
  • 负责人：
    尹立红
  • 依托单位：
    东南大学
  • 学科分类：
    H3001.环境卫生
  • 结题年份：
    2013
  • 批准年份：
    2010
  • 项目状态：
    已结题
  • 起止时间：
    2011-01-01 至2013-12-31

项目摘要

本研究通过构建基于凝胶的亚细胞蛋白质组2-DE-MALDI-TOF-MS和基于质谱的SELDI-TOF-MS蛋白芯片两种定量蛋白质组学分析策略，系统分析了细胞和血清中的食管癌相关差异表达蛋白质，初步筛选可用于早期发现食管癌的血清标志物，建立食管癌的血清标志物分类树模型。生物信息学预测差异蛋白的结构，识别具有分泌蛋白特征的候选蛋白进行蛋白功能及其信号通路调控网络的分析。构建候选蛋白的表达载体和siRNA沉默细胞模型，探讨候选蛋白对食管癌细胞的增殖、侵袭和迁移等行为、代谢和信号通路等的影响，结合质谱和免疫分析技术，识别候选蛋白在细胞信号通路的异常翻译后修饰特征，明确候选蛋白在食管癌发病机制中的作用，构建食管癌血清蛋白标志物的指标体系。通过对食管癌高危人群的筛检试验，评价筛检体系的诊断价值，为食管癌高危险人群的识别提供可靠的理论依据和有效的技术手段。

结项摘要

本研究采用8标的iTRAQ分析技术分别对28对食管鳞状细胞癌患者血浆和健康对照者血浆进行差异表达蛋白质组学的LC-MS/MS分析，共筛选得到19个差异蛋白质，其中15个在食管鳞状细胞癌组中低表达，4个在食管鳞状细胞癌组中高表达。GO分析显示，这些蛋白参与了免疫功能、代谢过程、细胞粘附、细胞凋亡等过程的调控。Western blot结果证实，在30对食管鳞状细胞癌患者血浆和健康对照者血浆的验证样本中，ECM-1在病例组和对照组中的蛋白水平差异有统计学意义，提示其可作为食管癌早期诊断的血浆蛋白候选标志。为进一步探讨食管癌的代谢特征在血浆中的表现及其与相关蛋白质的关系，本研究同时采用UPLC-MS技术分析了食管癌的血浆代谢组特征，共筛选得到ESCC组与健康对照组差异表达的小分子代谢物46 个，其中13 个上调，33个下调。利用METLIN对差异表达的差异特征物质以精确质量数进行检索，显示多种代谢分子与磷脂代谢密切相关，提示这一代谢过程在食管癌发生发展中可能发挥了较大的作用。研究还应用双向电泳技术探讨了前期筛选的食管癌相关蛋白MGMT在食管癌发病机制的可能作用，结合质谱技术识分离鉴定了14个与细胞恶性表型相关的差异蛋白。研究发表标注论文12篇，其中SCI收录8篇，会议论文6篇，培养博士研究生2名，硕士研究生2名。

项目成果

期刊论文数量（11）
专著数量（0）
科研奖励数量（0）
会议论文数量（6）
专利数量（0）
Malignant Progression in O-6-Methylguanine-DNA Methyltransferase- Deficient Esophageal Cancer Cells Is Associated with Ezrin Protein
O-6-甲基鸟嘌呤-DNA 甲基转移酶缺陷型食管癌细胞的恶性进展与 Ezrin 蛋白相关
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    2012
  • 期刊：
    DNA and Cell Biology
  • 影响因子：
    3.1
  • 作者：
    Yin; Lihong;Liu; Ran;Sheng; JingYi;Liu; Hui;Wang; Yi;Pan; Enchun;Guo; Wei;Pu; Yuepu;Zhang; Juan
  • 通讯作者：
    Juan
血浆miR-155，miR -20a，miR-183与食管癌发病风险的关联研究
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    2011
  • 期刊：
    中国科技论文在线
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    4. 廖娟; *刘冉; 卢婷; 杨淼; 盛静逸; 王仪; 潘恩春; 郭伟; 尹立红; 浦跃朴.
  • 通讯作者：
    浦跃朴.
Promoter methylation status of MGMT, hMSH2, and hMLH1 and its relationship to corresponding protein expression and TP53 mutations in human esophageal squamous cell carcinoma
人食管鳞癌MGMT、hMSH2、hMLH1启动子甲基化状态及其与相应蛋白表达和TP53突变的关系
  • DOI：
    10.1007/s12032-013-0784-4
  • 发表时间：
    2013
  • 期刊：
    Medical Oncology
  • 影响因子：
    3.4
  • 作者：
    Yaoyao Su • Lihong Yin • Ran Liu • JingYi Sheng •
  • 通讯作者：
    Yaoyao Su • Lihong Yin • Ran Liu • JingYi Sheng •
The Cluster of miR-143 and miR-145 Affects the Risk for Esophageal Squamous Cell Carcinoma through Co-Regulating Fascin Homolog 1
miR-143 和 miR-145 簇通过共同调节 Fascin 同源物 1 影响食管鳞状细胞癌的风险
  • DOI：
    10.1371/journal.pone.0033987
  • 发表时间：
    2012
  • 期刊：
    PLos One
  • 影响因子：
    3.7
  • 作者：
    Liu R;Liao J;Yang M;Sheng J;Yang H;Wang Y;Pan E;Guo W;Pu Y;Kim SJ;Yin L
  • 通讯作者：
    Yin L
Differential expression profiles of microRNAs as potential biomarkers for the early diagnosis of esophageal squamous cell carcinoma
microRNA的差异表达谱作为食管鳞状细胞癌早期诊断的潜在生物标志物
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    2013
  • 期刊：
    Oncology Reports
  • 影响因子：
    4.2
  • 作者：
    Yang; Miao;Liu; Ran;Sheng; Jingyi;Liao; Juan;Wang; Yi;Pan; Enchun;Guo; Wei;Pu; Yuepu;Yin; Lihong
  • 通讯作者：
    Lihong

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其他文献

修复酶基因多态性与食管癌易感性
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
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  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    张文翠;尹立红;浦跃朴
  • 通讯作者：
    浦跃朴
太湖南泉水域产毒微囊藻环境丰度和微囊藻毒素-LR产毒能力
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
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    --
  • 作者：
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  • 通讯作者：
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人乳头状瘤病毒转染对甲基硝基亚硝基胍致人食管上皮Het-1A细胞增殖及凋亡的影响
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  • 发表时间：
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  • 期刊：
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  • 影响因子：
    --
  • 作者：
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  • 通讯作者：
    尹立红
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  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    癌变.畸变.突变
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    潘恩春;刘冉;尹立红;浦跃朴;王仪
  • 通讯作者：
    王仪
错配修复基因的异常表达与淮安食管癌发病的关系
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    癌变畸变突变
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    潘恩春;王仪;尹立红;刘冉;浦跃朴
  • 通讯作者：
    浦跃朴

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相似国自然基金

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  • 批准号：
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AI项目解读示例

课题项目：调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要：

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题，其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子，其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而，TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用，影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法，探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用，为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义，并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路：

科学问题：TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达？
前期研究：已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应，但其具体机制尚不明确。
研究创新点：本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线：包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术：TRIM2与病毒RNA的相互作用分析，IFN-β启动子活性检测。
实验模型：使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
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