腐质霉属及其近似属嗜热丝孢菌属的分类及分子系统学研究
项目介绍
AI项目解读
基本信息
- 批准号:31360012
- 项目类别:地区科学基金项目
- 资助金额:50.0万
- 负责人:
- 依托单位:
- 学科分类:C0101.微生物多样性、分类与系统发育
- 结题年份:2017
- 批准年份:2013
- 项目状态:已结题
- 起止时间:2014-01-01 至2017-12-31
- 项目参与者:宋玉; 李启瑞; 汪家胜; 陶文辰; 王德凤;
- 关键词:
项目摘要
The fungi of Humicola and Thermomyces genera have important economic and ecological value. For a long time, because conidiophores are very short or lack with most species in two genera, the taxonomic criteria of both genera mainly were based on the size and morphological characteristics of conidia. Thus, the delimitation factors between these two genus were ambiguous, and similarity was obvious. There was a great divarication for whether Thermomyces was one synonym of Humicola. The taxonomic confusion on the level of generic and species level was caused by the morphological species could not be delimited clearly and the delimitation criteria of species which were variable and easily affected by environment and cultural condition. Meanwhile, traditionally taxonomy of this fungal group based on morphology was not enough to reflect the evolutionary relationship and was very difficult to identify some ambiguous taxa. This project draws up to use the sequences of three DNA markers (rDNA ITS, EF1а、RPB2) to construct phylogenetic trees and to analyze the phylogenetic relationship of these two genera and species. Hopefully the new taxonomic system and evolutionary relationship suitable for this fungal group were rebuilt by combining the morphology, ecology and phylogeny. Some ambiguous taxa or related species were re-identified. The results will provide the support for systematically developing the taxonomic research of other fungal groups in hyphomycetes.
腐质霉属与嗜热丝孢菌属真菌具重要的经济学及生态学意义。长期以来,由于两属多数种分生孢子梗很短或缺,两属的分类都主要依据侧生厚垣孢子的大小和形态,两属间界定因子不清晰,相似性明显,后者是否为前者的异名属存在很大分歧,用于种间界定的特征都是多变而连续的数量性状且易受环境或培养条件的影响,形态物种间界限不清晰,导致了属、种分类研究的混乱。另外,传统上该类群真菌的形态学划分依据不足反映属、种的系统发育关系,也难以作为一些疑难种的鉴定依据,本项目拟以模式标本或菌株为基础,采用rDNA ITS、EF1а、RPB2基因序列构建系统发育树,分析确定两属、种间系统发育关系,通过形态、生态等表型生物学特征与基因型特征相结合建立适宜该类群趋于自然的新分类系统和演化关系;并以此为依据对两属进行重新界定和划分,澄清部分疑难种或相似种的分类地位。该研究将为深入开展暗色丝孢真菌其它类群真菌的系统分类研究提供技术支持。
结项摘要
腐质霉属(Humicola)和嗜热丝孢菌属(Thermomyces) 两属在形态上相似,仅靠形态特征有时难以准确界定两属;在两属种内鉴定上,用于种间界定的因子少且不稳定,特别是腐质霉属,经过很长一段时间的积累,种的类别增多,该系统显现出混乱,形态物种间界限不清晰,属内疑难种或相似种分类地位存在较大争议;另外,两属真菌的形态学分类不足以反映它们的系统发育关系。基因数据运用正改变学者对微生物种、属以及更高水平的分类认知;从单基因片段的使用到多基因结合进化分析,对微生物的分类位置,有了较为准确的定位。本项目在单基因和多基因分子系统学的基础上,结合形态学研究探讨两属的分类学问题。首先,通过分别构建毛壳科(Chaetomiaceae)的ITS和LSU的单基因及ITS+LSU+TUB多基因系统发育树,讨论了传统的腐质霉属在毛壳科的分类地位及系统发育关系。结果发现:传统的腐质霉属应界定为两个属,其中一个属因包含模式菌株棕黑腐质霉变种主模式(Humicola fuscoatra var. fascoatra, Ex-type),所以仍沿用腐质霉属(Humicola)作为属名,其有性型属推测为Farrowia;另一新属命名为新腐质霉属(Neohumicola gen. nov.),其有性型属推测为Chaetomium。此外,基于ITS、LSU、β-tubulin、RPB2序列重建了腐殖霉属和新腐质霉属属内种间的单基因及多基因的系统发育树,探讨了该属部分种的遗传进化关系。结果:在腐质霉属(Humicola)中,共鉴定出8个种,分别为H. verruculosa、H. fuscoatra、H. irregularis、H. brachypodi、H. pedunclensis和3个未定种Humicola spp.(HSAUP1915、HSAUP0905、HSAUP1001),在新腐殖霉属(Neohumicola gen. nov.)中,共22株菌株,被鉴定为2个新组合种,即N. grisea var. grisea comb. nov.和N. jilongensis comb. nov.。最后,通过ITS序列分析及形态学研究,把4株嗜热丝孢菌属菌株鉴定为疏棉嗜热丝孢菌Thermomyces lanuginosus,并讨论了该属的分类地位。该项目为其它真菌分类单元的系统分类提供借鉴。
项目成果
期刊论文数量(7)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
生于蔷薇科植物上的链格孢属真菌一新种
- DOI:--
- 发表时间:2016
- 期刊:菌物学报
- 影响因子:--
- 作者:杨亚曦;姜于兰;李兴红
- 通讯作者:李兴红
Mycosphere
菌圈
- DOI:--
- 发表时间:2016
- 期刊:Mycosphere
- 影响因子:14.6
- 作者:Chen Y;Ran S F;Dai D Q;Wang Y;Hyde K D;Wu Y M;Jiang Y L
- 通讯作者:Jiang Y L
Novel Pestalotiopsis species from Thailand point to the rich
泰国新拟盘拟盘菌属物种丰富
- DOI:--
- 发表时间:2014
- 期刊:Cryptogamie, Mycologie
- 影响因子:--
- 作者:Yu Song;Narumon Tangthirasunun;Sajeewa S. N. Maharachchikumbura;Yulan Jiang;Junjie;Kevin D. Hyde;Yong Wang
- 通讯作者:Yong Wang
New species of Cephalotrichum, Leptographium, and Myrothecium from soil in China
中国土壤中头孢菌属、细叶霉属和漆斑霉属新种
- DOI:--
- 发表时间:2017
- 期刊:Mycotaxon
- 影响因子:1
- 作者:Yu-Lan Jiang§;Yue-Ming Wu§;Bin Yang;Jun-Jie Xu;Zheng-Gao Zhang;Yue-Li Zhang;Tian-Yu Zhang
- 通讯作者:Tian-Yu Zhang
Four new Humicola species from soil in China
中国土壤腐质霉四个新种
- DOI:10.5248/131.269
- 发表时间:2016-08
- 期刊:Mycotaxon
- 影响因子:1
- 作者:Yu-Lan Jiang;Yue-Ming Wu;Jun-Jie Xu;Yue-Hua Geng;Hong-Feng Wang;Tian-Yu Zhang
- 通讯作者:Tian-Yu Zhang
共 6 条
- 1
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其他文献
拟棘壳孢属的一新种及本属已知种的检索表
- DOI:--
- 发表时间:2019
- 期刊:菌物学报
- 影响因子:--
- 作者:王坤英;吴悦明;陈云;姜于兰
- 通讯作者:姜于兰
贵州茂兰自然保护区子囊菌真菌的多样性
- DOI:--
- 发表时间:2013
- 期刊:贵州农业科学
- 影响因子:--
- 作者:任军;揭春玉;曾琛;姜于兰;王勇;Kevin D.Hyde
- 通讯作者:Kevin D.Hyde
中国新记录种土栖瓶头霉的形态特征与分子系统学分析
- DOI:--
- 发表时间:2013
- 期刊:贵州农业科学
- 影响因子:--
- 作者:揭春玉;王勇;吴石平;姜于兰
- 通讯作者:姜于兰
共 3 条
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姜于兰的其他基金
中国西南地区Ochroconis和Verruconis属的系统分类研究
- 批准号:
- 批准年份:2020
- 资助金额:34 万元
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漆斑霉属的分类学与分子系统学研究
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- 批准年份:2016
- 资助金额:39.0 万元
- 项目类别:地区科学基金项目
中国西南地区齿梗孢属和葡萄穗霉属真菌分类研究
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- 批准年份:2010
- 资助金额:26.0 万元
- 项目类别:地区科学基金项目