蛋白质O-GlcNAc糖基化修饰在胚胎干细胞中的功能研究

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AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    91753206
  • 项目类别:
    重大研究计划
  • 资助金额:
    300.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    B0702.生物分子的化学生物学
  • 结题年份:
    2021
  • 批准年份:
    2017
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2018-01-01 至2021-12-31

项目摘要

Protein O-GlcNAc modification participates in regulating a series of important biological processes. This proposed project focuses on the functional role of dynamic O-GlcNAc modification in embryonic stem cells (ESCs). We will develop bioorthogonal labeling methods and chemical proteomic techniques for large-scale identification of O-GlcNAcylated proteins and modification sites in ESCs. Based on the proteomic profiling results, we will choose important transcription facts with O-GlcNAc modification and exploit the CRISPR/Cas9 technique to construct the knockout-rescue stable cell lines for these factors. In these cells, how O-GlcNAc regulates ESC self-renew and pluripotency through affecting the transcription network will be investigated. This project will facilitate our understanding of O-GlcNAc biology and promote the development of stem cell therapy-based regenerative medicine.
蛋白质O-GlcNAc糖基化修饰参与调控一系列重要的生物学过程。本项目围绕O-GlcNAc动态修饰与胚胎干细胞功能的关系这一关键科学问题,发展针对胚胎干细胞中O-GlcNAc的生物正交标记方法和化学蛋白质组学分析技术,大规模鉴定O-GlcNAc修饰蛋白和修饰位点,并在胚胎干细胞中寻找O-GlcNAc识别蛋白。通过对组学鉴定数据的归纳分析,选定胚胎干细胞中具有O-GlcNAc修饰的关键转录因子,利用CRISPR/Cas9技术构建这些因子的敲除后回补稳定胚胎干细胞系,研究O-GlcNAc如何通过影响转录网络来调控胚胎干细胞的自我跟新和多能性维持。本项目的实施对于理解O-GlcNAc动态修饰的基本生物学性质,促进干细胞治疗等再生医学的发展都具有积极的意义。

结项摘要

本项目聚焦于“O-GlcNAc糖基化在胚胎干细胞中的功能调控”,在O-GlcNAc修饰的化学标记、蛋白质组学分析和O-GlcNAc修饰对胚胎干细胞功能影响等方面开展化学糖生物学研究。项目执行期间,按项目书研究计划开展工作,并根据研究进展和结果对研究方案进行了必要的调整和优化,主要开展了以下几个方面的研究工作:1)开发了新一代的非天然糖代谢标记探针,解决了传统全乙酰化非天然糖具有S-glyco-modification副反应的问题,实现了活细胞中聚糖的高特异性和高效率化学标记;2)构建了基于同位素标记的可切割富集标签的O-GlcNAc修饰位点的定量组学分析平台,实现了O-GlcNAc修饰组的位点鉴定和定量分析;3)开发了点击膨胀显微成像技术(click expansion microscopy, click-ExM),提供了一种简便的、可以在常规共聚焦荧光显微镜上进行超高分辨聚糖荧光成像研究的新方法;4)发展了一种不依赖于polyA的RNA结合蛋白捕获鉴定的新技术CARIC,在整个转录组层面同时鉴定了编码RNA和非编码RNAs的结合蛋白,为研究细胞中蛋白质的O-GlcNAc糖基化修饰提供技术支持;5)研究了重要转录因子ESRRB的O-GlcNAc修饰和相关功能,探索了O-GlcNAc修饰对蛋白质稳定性和蛋白质相互作用的调控功能,在小鼠胚胎干细胞中对O-GlcNAc修饰蛋白进行了大规模鉴定。这些研究工作的开展为研究O-GlcNAc糖基化修饰组学鉴定与胚胎干细胞功能理解提供了新方法和更深入的理解,阐明了O-GlcNAc糖基化可促进ESRRB维持胚胎干细胞的多能性和自我更新能力。

项目成果

期刊论文数量(13)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(5)
唾液酸化聚糖的化学标记和解析
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2020
  • 期刊:
    科学通报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    成波;陈兴
  • 通讯作者:
    陈兴
Click-ExM enables expansion microscopy for all biomolecules
Click-ExM 可对所有生物分子进行扩展显微镜检查
  • DOI:
    10.1038/s41592-020-01005-2
  • 发表时间:
    2020-12-07
  • 期刊:
    NATURE METHODS
  • 影响因子:
    48
  • 作者:
    Sun, De-en;Fan, Xinqi;Chen, Xing
  • 通讯作者:
    Chen, Xing
Capture and Identification of RNA-binding Proteins by Using Click Chemistry-assisted RNA-interactome Capture (CARIC) Strategy
使用点击化学辅助 RNA 相互作用组捕获 (CARIC) 策略捕获和鉴定 RNA 结合蛋白
  • DOI:
    10.3791/58580
  • 发表时间:
    2018-10-01
  • 期刊:
    JOVE-JOURNAL OF VISUALIZED EXPERIMENTS
  • 影响因子:
    1.2
  • 作者:
    Huang, Rongbing;Han, Mengting;Chen, Xing
  • 通讯作者:
    Chen, Xing
Chemical Tagging of Protein Lipoylation
蛋白质脂酰化的化学标记
  • DOI:
    10.1002/anie.202010981
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
    Angewandte Chemie International Edition
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Tang Qi;Guo Yilan;Meng Liying;Chen Xing
  • 通讯作者:
    Chen Xing
Identifying Cell Surface Markers of Primary Neural Stem and Progenitor Cells by Metabolic Labeling of Sialoglycan
通过唾液酸聚糖的代谢标记鉴定原代神经干细胞和祖细胞的细胞表面标志物
  • DOI:
    10.3791/58945
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
    Jove-Journal of Visualized Experiments
  • 影响因子:
    1.2
  • 作者:
    Bai Qing-Ran;Dong Lu;Shen Qin
  • 通讯作者:
    Shen Qin

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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