绿胶霉素类特殊类群甾体的生物合成途径研究

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31670036
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    67.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C0103.微生物组学与代谢
  • 结题年份:
    2020
  • 批准年份:
    2016
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2017-01-01 至2020-12-31

项目摘要

Viridins represented by wortmannin, viridin and demethoxyviridin are a unique class of steroids from fungi, which have shown important biological activities. It was demonstrated very early that they are biosynthesized as a branch of the ergosterol biosynthetic pathway, but the branch point and the biosynthetic logic after branch are still not clear. In our previous study, we have isolated demethoxyvridin and several key biosynthetic intermediates from Nodulisporium sp.. Based on these compounds, we hypothesized that the branch point of viridins and ergosterol biosynthesis occurs before or after 3-ketoreduction in the ergosterol biosynthetic pathway; and cleavage of C20-C22 is responsible for causing the branch, which is then followed by formation of 4,6-furan ring and other structural units. To verify our hypothesis, we have sequenced the whole genome and transcriptome of Nodulisporium sp., and screened out the genes involved in the biosynthesis of ergosterol and all the P450 genes possibly participating in the post-branch biosynthesis. In this project, we will investigate the functions of candidate genes by establishing efficient gene knock-out method based on CRISPR/Cas9 technology and the aspergillus oryzae heterologous expression system well established in our lab, and try to elucidate the biosynthetic pathway of demethoxyviridin, which will provide basic knowledge for understanding the biosynthetic pathways of all viridins and generation of new derivatives with similar structure by combinational biosynthesis.
以渥曼青霉素、绿胶霉素、去甲氧绿胶霉素为代表的绿胶霉素类化合物是一类含有特殊甾核结构且具有重要生物活性的真菌代谢产物。虽然人们早已证明它们是从麦角甾醇途径分支而来,但具体分支点以及此后的生物合成逻辑尚未明确。我们前期从一株多节孢属真菌分离到了去甲氧绿胶霉素及其生物合成的多个中间体。基于此,我们提出绿胶霉素类化合物的分支点发生在麦角甾醇途径的C3羰基还原前后;且C20-C22侧链断裂是引发分支的关键,随后才启动4,6呋喃环等结构单元的合成。由此我们对该菌的基因组和转录组进行了测序,并完成了麦角甾醇生物合成基因以及可能参与分支后反应所有P450酶的分析。本研究拟通过建立高效的CRISPR/Cas9基因敲除法,并利用本实验室成熟的米曲霉表达体系对候选基因进行验证,由此阐明去甲氧绿胶霉素的生物合成途径,为全面揭示绿胶霉素类化合物的生物合成途径及利用组合生物合成手段获取具有此类结构的衍生物奠定基础。

结项摘要

以渥曼青霉素、绿胶霉素、去甲氧绿胶霉素为代表的绿胶霉素类化合物是一类具有特殊4,6呋喃甾核结构且具有重要生物活性的真菌次生代谢产物,不仅具有广谱的抗真菌作用,还具有突出的抗肿瘤活性,其机制主要通过特异性地抑制磷脂酰肌醇-3-激酶(PI3K)这一与肿瘤生长密切相关的信号分子。其中,渥曼青霉素作为经典的PI3K抑制剂,已广泛用于生物学研究,而且以其为原型开发的抗肿瘤药PX-886已经进入II期临床。我们前期的研究还发现绿胶霉素类化合物能显著改善老年痴呆(AD)果蝇的学习记忆能力和抑制A42的聚集,提示其有望开发成新的抗AD药物。因此,阐明绿胶霉素类化合物的生物合成途径具有重要的理论和现实意义。. 本项目首先建立了多节孢属真菌Nodulisporium sp的遗传操作系统,并在该菌株中建立了一种简便高效的基于CRISPR-Cas9技术的基因敲除法。同时,对该菌株进行了全基因组测序,结合生物信息分析、差异转录组分析以及基因敲除,我们首次鉴定了去甲氧绿胶霉素的生物合成基因簇,其包含19个基因,包括15个直接参与生物合成的基因。我们对15个基因进行了逐个敲除,通过分析和分离基因敲除菌株的代谢产物,结合米曲霉异源表达实验,我们阐明了去甲氧绿胶霉素完整的生物合成途径。在此基础上,利用体外酶催化和底物喂养等手段,证实了在去甲氧绿胶霉素的生物合成途径中,存在一种与哺乳动物甾体激素完全不同的孕烷侧链断裂机制,该断裂过程由三个酶通过三步反应完成。进一步的研究发现这三个酶也能催化孕酮的侧链断裂,为甾体药物的生物转化提供了新的酶工具。在研究去甲氧绿胶霉素的生物合成途径中,我们共分离获得了14个单体化合物,包括8个新化合物,我们测试了它们的PI3K激酶抑制活性,并揭示了新的构效关系。本项目首次阐明了去甲氧绿胶霉素的生物合成途径,将为全面揭示绿胶霉素类化合物的生物合成机制以及利用组合生物合成手段丰富该类化合物的结构多样性奠定基础。

项目成果

期刊论文数量(10)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(1)
Biosynthesis of an anti- tuberculosis sesterterpenoid asperterpenoid A
抗结核病双倍萜类化合物 Asperpenoid A 的生物合成
  • DOI:
    10.1039/c8ob02832j
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
    Organic and Biomolecular Chemistry
  • 影响因子:
    3.2
  • 作者:
    Huang Jia Hua;Lv Jian Ming;Wang Qiao Zhen;Zou Jian;Lu Yong Jun;Wang Qing Lin;Chen Dong Ni;Yao Xin Sheng;Gao Hao;Hu Dan
  • 通讯作者:
    Hu Dan
A four-protein metabolon assembled by a small peptide protein creates the pentacyclic carbonate ring of aldgamycins
由小肽蛋白组装的四蛋白代谢物产生了阿霉素的五环碳酸酯环
  • DOI:
    10.1016/j.apsb.2020.07.015
  • 发表时间:
    2021-03
  • 期刊:
    Acta Pharmaceutica Sinica B
  • 影响因子:
    14.5
  • 作者:
    Wang Q;Tang X;Dai P;Wang C;Zhang W;Chen G;Hong K;Hu D;Gao H;Yao X
  • 通讯作者:
    Yao X
Biosynthesis of Fungal Triterpenoids and Steroids
真菌三萜类化合物和类固醇的生物合成
  • DOI:
    10.6023/cjoc201806033
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
    Chinese Journal of Organic Chemistry
  • 影响因子:
    1.9
  • 作者:
    Gao Yaohui;Wang Gaoqian;Huang Huiyun;Gao Hao;Yao Xinsheng;Hu Dan
  • 通讯作者:
    Hu Dan
Biosynthesis of Biscognienyne B Involving a Cytochrome P450-Dependent Alkynylation
涉及细胞色素 P450 依赖性炔基化的 Biscognienyne B 生物合成
  • DOI:
    10.1002/anie.202004364
  • 发表时间:
    2020
  • 期刊:
    Angewandte Chemie International Edition
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Lv Jian-Ming;Gao Yao-Hui;Zhao Huan;Awakawa Takayoshi;Liu Ling;Chen Guo-Dong;Yao Xin-Sheng;Hu Dan;Abe Ikuro;Gao Hao
  • 通讯作者:
    Gao Hao
Biosynthesis of helvolic acid and identification of an unusual C-4-demethylation process distinct from sterol biosynthesis
十六烷酸的生物合成以及不同于甾醇生物合成的不寻常的 C-4-去甲基化过程的鉴定
  • DOI:
    10.1007/s13280-021-01529-7
  • 发表时间:
    2017
  • 期刊:
    Nature Communications
  • 影响因子:
    16.6
  • 作者:
    Lv Jian Ming;Hu Dan;Gao Hao;Kushiro Tetsuo;Awakawa Takayoshi;Chen Guo Dong;Wang Chuan Xi;Abe Ikuro;Yao Xin Sheng
  • 通讯作者:
    Yao Xin Sheng

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    河﨑 照行;ほか;胡丹
  • 通讯作者:
    胡丹

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胡丹的其他基金

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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