A2BP1的表观沉默通过上调SNAI1的m6A甲基化促进结直肠癌侵袭转移的机制研究

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    81902877
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    20.5万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    H1805.肿瘤表观遗传
  • 结题年份:
    2022
  • 批准年份:
    2019
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2020-01-01 至2022-12-31

项目摘要

The transcription factor SNAI1 plays a key role in tumor invasion and metastasis. In our previous study, MeRIP-seq and methylated microarrays data showed that both SNAI1 RNA methylation and A2BP1 promoter methylation levels were increased in colorectal cancer. Moreover, we found that A2BP1 promoter methylation inhibited its expression, and A2BP1 silencing was related to cancer cell invasion and metastasis, clinical recurrence and metastasis, SNAI1 RNA methylation upregulation, and SNAI1 expression upregulation. Considering A2BP1 interacts with SNAI1 RNA, we thus propose a hypothesis that DNA methylation inactivates A2BP1 and inhibits its down-regulating effect on RNA methylation of SNAI1 through recruiting the demethylase ALKBH5, and thereby enhancing SNAI1 expression and promoting tumor invasion and metastasis. This project will further study the function of tumor suppressor gene A2BP1 and its interaction with ALKBH5 and SNAI1 RNA through CRISPR methylation editing, vector construction, QASM, MeRIP, and Co-IP. This study will further elucidate the upstream regulation mechanisms of SNAI1 expression and help develop novel molecular markers and target therapeutics.
转录因子SNAI1在肿瘤侵袭转移中起着关键作用。我们前期通过MeRIP-seq和甲基化芯片发现结直肠癌中SNAI1 RNA m6A甲基化和A2BP1启动子甲基化显著升高。预实验发现,A2BP1启动子甲基化可抑制其表达,A2BP1沉默与细胞侵袭转移、临床复发转移、SNAI1 RNA m6A甲基化上调、SNAI1表达上调相关,A2BP1与SNAI1 RNA存在相互作用。因此,我们提出科学假说:DNA甲基化沉默A2BP1,抑制其募集去甲基酶ALKBH5结合SNAI1 RNA,从而上调SNAI1的RNA m6A甲基化,增强SNAI1的表达和促进结直肠癌的侵袭转移。本课题将通过CRISPR甲基化编辑、载体构建、QASM、MeRIP和Co-IP等技术进一步研究A2BP1的基因功能及其与ALKBH5和SNAI1 RNA的相互作用,探讨调控SNAI1表达的上游机制,为分子标志物和靶点药物的开发提供新思路。

结项摘要

结直肠癌是我国最常见的恶性肿瘤之一,是严重威胁人类健康与生命的疾病,本课题通过使用自主研发的单碱基分辨率下检测基因甲基化水平的新技术QASM、DNA甲基化芯片、RNA-seq、MeRIP、RIP和dot blot等方法,发现了一系列关键DNA甲基化和RNA甲基化位点在结直肠癌中的作用及其调控机制,并在多个医疗中心中验证了其作为肠癌标志物的应用前景、揭示了RNA m6A甲基化及其去甲基酶ALKBH5在结直肠癌发生发展中的作用,系统揭示并验证了ALKBH5的作用靶点及其在结直肠癌发生发展中的作用,本项目发现的关键基因甲基化具有预测预后的临床标志物价值,可作为新的肿瘤分子标志物和治疗靶点应用于临床,为以后设计合理的治疗药物及判断预后,实现我国结直肠癌的精准医疗具有重要意义。

项目成果

期刊论文数量(13)
专著数量(0)
科研奖励数量(1)
会议论文数量(0)
专利数量(1)
Genome-wide analysis identifies critical DNA methylations within NTRKs genes in colorectal cancer.
全基因组分析识别结直肠癌中 NTRKs 基因内的关键 DNA 甲基化。
  • DOI:
    10.1186/s12967-021-02740-6
  • 发表时间:
    2021-02-16
  • 期刊:
    Journal of translational medicine
  • 影响因子:
    7.4
  • 作者:
    Chen Z;Huang Z;Luo Y;Zou Q;Bai L;Tang G;Wang X;Cao G;Huang M;Xiang J;Yu H
  • 通讯作者:
    Yu H
The Addition of Preoperative Radiation Is Insufficient for Lateral Pelvic Control in a Subgroup of Patients With Low Locally Advanced Rectal Cancer: A Post Hoc Study of a Randomized Controlled Trial.
在低度局部晚期直肠癌亚组患者中,增加术前放疗不足以实现侧骨盆控制:一项随机对照试验的事后研究。
  • DOI:
    10.1097/dcr.0000000000001935
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
    Diseases of the Colon & Rectum
  • 影响因子:
    3.9
  • 作者:
    Xie Yumo;Lin Jinxin;Wang Xiaolin;Wang Puning;Zhuang Zhuokai;Zou Qi;Cai Du;Huang Zenghong;Bai Liangliang;Tang Guannan;Huang Meijin;Wang Jianping;Yu Huichuan;Luo Yanxin
  • 通讯作者:
    Luo Yanxin
DNA methylation-based signature of CD8+ tumor-infiltrating lymphocytes enables evaluation of immune response and prognosis in colorectal cancer.
基于 DNA 甲基化的 CD8 肿瘤浸润淋巴细胞特征能够评估结直肠癌的免疫反应和预后。
  • DOI:
    10.1136/jitc-2021-002671
  • 发表时间:
    2021-09
  • 期刊:
    Journal for immunotherapy of cancer
  • 影响因子:
    10.9
  • 作者:
    Zou Q;Wang X;Ren D;Hu B;Tang G;Zhang Y;Huang M;Pai RK;Buchanan DD;Win AK;Newcomb PA;Grady WM;Yu H;Luo Y
  • 通讯作者:
    Luo Y
Systemic Inflammation Status Relates to Anti-Inflammatory Drug Benefit and Survival in Rectal Cancer
全身炎症状态与直肠癌的抗炎药物疗效和生存相关。
  • DOI:
    10.1016/j.jss.2021.08.028
  • 发表时间:
    2021-10-05
  • 期刊:
    JOURNAL OF SURGICAL RESEARCH
  • 影响因子:
    2.2
  • 作者:
    Cao,Xue;Wang,Xiaolin;Yu,Huichuan
  • 通讯作者:
    Yu,Huichuan
Current treatment and surveillance modalities are not sufficient for advanced stage III colon cancer: Result from a multicenter cohort analysis.
目前的治疗和监测方式不足以治疗晚期 III 期结肠癌:多中心队列分析的结果。
  • DOI:
    10.1002/cam4.4417
  • 发表时间:
    2021-12
  • 期刊:
    Cancer medicine
  • 影响因子:
    4
  • 作者:
    Li J;Xie Y;Huang Z;Shen D;Zhuang Z;Zhu M;Huang Y;He R;Wang X;Huang M;Luo Y;Yu H
  • 通讯作者:
    Yu H

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其他文献

直肠癌根治术后的复发类型对复发后远期生存的影响
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
    中华医学杂志
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    禹汇川;骆衍新;王小琳;康亮;黄美近;邓艳红;王磊;汪建平
  • 通讯作者:
    汪建平

其他文献

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禹汇川的其他基金

基于DNA甲基化绘制的肿瘤微环境图谱在评估结直肠癌免疫特征中的研究
  • 批准号:
  • 批准年份:
    2022
  • 资助金额:
    52 万元
  • 项目类别:
    面上项目

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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