系统性红斑狼疮相关候选基因Aiolos的SNP分析及其功能研究

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AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    81401330
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    23.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    H1107.自身免疫性疾病
  • 结题年份:
    2017
  • 批准年份:
    2014
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2015-01-01 至2017-12-31

项目摘要

Systemic lupus erythematosus (SLE) is a prototypic systemic autoimmune disease, the pathogenesis of which remains unclear. It is generally considered that SLE is related with individual genetic variation. Recently, association study on SNPs of candidate gene has been main strategy of SLE pathogenesis. Aiolos is a SLE susceptibility gene found in genome-wide association study among European and American population. Our early study showed that Aiolos mRNA expression level in SLE patients was significantly lower than that in healthy controls, which was correlated with serum C3, C4, total protein and 24-h proteinuria. The case-control study found that there were four polymorphisms in Aiolos that might be associated with SLE susceptibility. On that basis, our study plans to perform the independent and two-stage joint research of SLE related polymorphisms in Aiolos with enlarged sample, analyze the impact of SLE related polymorphisms on the expression of Aiolos, explore the effect of gene polymorphisms and haplotypes on the disease combining the clinical and pathological data, and clarify the action mode and molecular mechanism of the polymorphisms in SLE pathogenesis. The systemic study of the role of Aiolos in SLE might provide new experiment evidence for clinical diagnosis and treatment of this disease.
SLE是典型的全身性自身免疫性疾病,与遗传因素有关,近年来候选基因多态性作为疾病遗传标记的关联性研究成为探讨SLE发病机制的主要策略。Aiolos是最近在欧美人群全基因组关联研究中发现的SLE易感基因,我们的预实验显示SLE患者外周血单核细胞中Aiolos mRNA表达水平较正常人明显降低,其表达与实验室检验指标(如血清补体C3、C4、血清总蛋白以及24小时蛋白尿水平)具有相关性;病例—对照研究发现Aiolos基因中的4个SNP位点可能与SLE易感性相关联,在此基础上本研究拟对SLE相关多态进行二期扩大样本研究,分析SLE相关多态对Aiolos基因表达的影响,并结合临床病例资料阐明SLE相关多态位点的单一位点效应以及多位点联合效应,同时探讨SLE相关多态的作用模式及其与SLE易感性的相关机制,为SLE临床诊断和治疗提供新的实验依据。

结项摘要

SLE是全身性自身免疫性疾病,多种族人群全基因组关联研究发现多个易感基因。本研究探讨SLE易感基因IKZF3-ZPBP2、IRF8、TMEM39A和LAPTM5的多态性与表达情况:流式细胞检测37例健康人、32例SLE患者和35例RA患者外周血T细胞、B细胞和单核细胞IKZF3(Aiolos)蛋白表达,结果显示SLE组Aiolos+CD8+T细胞和Aiolos+CD14+单核细胞的细胞数比例较对照组显著增加,RA组中Aiolos+CD4+T细胞、Aiolos+CD8+T细胞、Aiolos+CD19+B细胞和Aiolos+CD14+单核细胞比例较对照组也显著增加,同时SLE组中Aiolos+CD8+T细胞比例与ESR呈正相关,而RA组中该细胞比例与RF呈正相关,另一方面Aiolos+CD14+单核细胞的比例与实验室多项检验指标具有相关性,包括ESR、肌酐、CRP 、LDH、蛋白尿、白蛋白和ACCPA。上述结果表明,Aiolos表达异常与SLE和RA病变密切相关。PCR-RFLP和MassARRAY对415例SLE患者和470例健康人进行多态分析,结果显示SLE组中Aiolos rs907091基因型CC和等位基因C的频率较对照组显著下降,rs12150079基因型AA和等位基因A的频率在SLE组中则明显升高,而rs9909593基因型AG的频率在SLE组中略有升高,单倍型分析显示SLE组中GGCG频率较对照组显著下降,而SLE组GGTG频率则显著升高。TMEM39A rs12493175基因型CT和CT+TT显著降低SLE风险,TMEM39A rs12493175基因型CT和CT+TT显著降低SLE风险,rs13062955基因型AC和AC+AA也显著降低SLE风险,而rs2282175基因型CT和CT+TT频率在SLE组中略有升高,提示增加SLE风险,单倍型分析显示CGTA频率在SLE组中显著降低。本次研究未发现LAPTM5存在SLE易感位点,其单倍型GGAT频率在SLE组中显著降低;实时定量PCR结果显示LAPTM5 mRNA在SLE外周血单核细胞中表达较对照组显著降低,狼疮肾患者较无狼疮肾患者表达也显著降低,且表达与临床检验指标呈相关性,提示LAPTM5表达异常与SLE严重程度相关。综上所述,本研究为SLE的诊断与治疗提供了新的实验依据。

项目成果

期刊论文数量(6)
专著数量(0)
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专利数量(0)
Association of novel polymorphisms in TMEM39A gene with systemic lupus erythematosus in a Chinese Han population.
TMEM39A基因新多态性与中国汉族人群系统性红斑狼疮的关联
  • DOI:
    10.1186/s12881-017-0405-8
  • 发表时间:
    2017-04-20
  • 期刊:
    BMC medical genetics
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Cai X;Huang W;Liu X;Wang L;Jiang Y
  • 通讯作者:
    Jiang Y
Expression and Polymorphisms of Lysosome-Associated Protein Transmembrane 5 (LAPTM5) in Patients with Systemic Lupus Erythematosus in a Chinese Population
中国人群系统性红斑狼疮患者溶酶体相关蛋白跨膜5(LAPTM5)的表达和多态性
  • DOI:
    10.1007/s10528-015-9682-0
  • 发表时间:
    2015-08-01
  • 期刊:
    BIOCHEMICAL GENETICS
  • 影响因子:
    2.4
  • 作者:
    Cai, Xinze;Qiao, Ying;Jiang, Yi
  • 通讯作者:
    Jiang, Yi
Association between polymorphisms of the IKZF3 gene and systemic lupus erythematosus in a Chinese Han population.
IKZF3基因多态性与中国汉族系统性红斑狼疮的相关性
  • DOI:
    10.1371/journal.pone.0108661
  • 发表时间:
    2014
  • 期刊:
    PloS one
  • 影响因子:
    3.7
  • 作者:
    Cai X;Qiao Y;Diao C;Xu X;Chen Y;Du S;Liu X;Liu N;Yu S;Chen D;Jiang Y
  • 通讯作者:
    Jiang Y
Decreased TIM-3 mRNA expression in peripheral blood mononuclear cells from nephropathy patients
肾病患者外周血单个核细胞TIM-3 mRNA表达降低
  • DOI:
    10.4238/2015.june.12.7
  • 发表时间:
    2015-01-01
  • 期刊:
    GENETICS AND MOLECULAR RESEARCH
  • 影响因子:
    0.4
  • 作者:
    Cai, X. Z.;Liu, N.;Jiang, Y.
  • 通讯作者:
    Jiang, Y.
Overexpression of Aiolos in Peripheral Blood Mononuclear Cell Subsets from Patients with Systemic Lupus Erythematosus and Rheumatoid Arthritis
系统性红斑狼疮和类风湿关节炎患者外周血单核细胞亚群中 Aiolos 过度表达。
  • DOI:
    10.1007/s10528-015-9702-0
  • 发表时间:
    2016-02-01
  • 期刊:
    BIOCHEMICAL GENETICS
  • 影响因子:
    2.4
  • 作者:
    Cai, Xinze;Liu, Xudong;Jiang, Yi
  • 通讯作者:
    Jiang, Yi

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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