离褶伞属异形组的起源与演化研究

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31560009
  • 项目类别:
    地区科学基金项目
  • 资助金额:
    42.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C0101.微生物多样性、分类与系统发育
  • 结题年份:
    2019
  • 批准年份:
    2015
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2016-01-01 至2019-12-31

项目摘要

Lyophyllum section Difformia fungi are delicacy and distributed in the Euro-Asian and North Amarican continets. Taxinomy of the section is still controversal though has made good progress recently. Our previous research on the Section Difformia fungi collected from Hengduan Mountains region revealed that the section is a monophyletic group including at least 12 taxa; which has two ecological groups, saprophytic and ectotrophic. However, divergence time, origin center and evolution history of the section have been not studied. This project will expand collecting specimens and samples from Northern China, Europe, North America, Australia, Japan and Indo-China Peninsula. Based on the molecular phylogenetic analysis of the collections, firstly using the principle of molecular clock, and BEAST application software to estimate divergence time of section Difformia, and using the LAGRANGE and RASP v2.1 beta software, by maximum likelihood algorithm and Bayesian Binary MCMC Analysis respectively, to elucidate its origin center and evolution history. Results of the research will provide scientific base for conservation of the species diversity and sustainable utilization of germplasm resources of the section fungi.
离褶伞属异形组(Lyophyllum section Difformia)中的真菌是珍贵的美味食用菌,广布于亚洲、欧洲和北美洲。申请人前期研究横断山脉地区异形组真菌发现,该组是单系群,至少包含12个种,有腐生菌和外生菌根菌两个生态类群。但是,关于异形组及组下类群的分化时间、起源中心,以及演化历史是不清楚的,也未见报道。因此,本项目拟在原有收集标本和样品的基础上,扩大对中国北方、欧洲、北美洲、澳洲、日本和中南半岛地区标本的采集和借阅,在深入研究该组分子系统学的基础上,利用分子钟原理和BEAST软件,推算出异形组及组下各类群的分化时间;应用LAGRANGE 和RASP v2.1 beta软件,分别采用最大似然法和Bayesian Binary MCMC Analysis进行异形组历史分布重建研究,明确异形组真菌的起源中心和演化历史。研究结果将有助于异形组真菌物种多样性保护和种质资源的持续利用。

结项摘要

离褶伞属异形组真菌是世界广布种,是珍稀的美味食用菌,但关于该组真菌的物种多样性、起源与演化是不清晰的,影响了人们对重要种质资源的保护和利用,所以项目组在4年时间里,共计30次到中国异形组真菌分布的主要区域采集300余标本,从国内外标本馆借阅50余份标本。基于形态学和分子系统学的研究,发现异形组至少包括20个系统发育种,澄清了异物同名,异名同物问题;利用分子钟原理,应用BEAST软件,阐明异形组真菌的分化时间是28.4007百万年前,离褶伞组的分化时间是13.1088百万年前,离褶伞属的分化时间是34.5812百万年前,离褶伞科的分化时间是49.1087百万年前;采用最大似然法(Maxmum Likelihood:ML)和Bayesian Binary MCMC Analysis进行历史分布重建研究,发现异形组真菌起源于亚欧大陆板块,其中横断山脉地区物种最丰富,是物种演化中心之一;营养方式的演化历史是从嗜碳真菌到腐生真菌,再到兼性共生真菌,最后到专性共生真菌,所以嗜碳真菌是异形组真菌的始祖。本研究澄清了异形组真菌中珍稀食用菌的营养方式,为资源的保护提供了理论指导,为核心种质资源驯化栽培和产业化利用指明了研发方向。

项目成果

期刊论文数量(4)
专著数量(2)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Three New Species of Rhizopogon from Southwest China
西南地区根蓬属植物三新种
  • DOI:
    10.11646/phytotaxa.282.2.7
  • 发表时间:
    2016-10
  • 期刊:
    Phytotaxa
  • 影响因子:
    1.1
  • 作者:
    Li Lin;Zhao Yongchang;Zhou Dequn;Yu Fuqiang;Zheng Linyong;Wang Yun;Zhang Xiaolei;Duan Zhongjian;Zhao Xingyun;He Zhihong;Li Shuhong
  • 通讯作者:
    Li Shuhong
A new black truffle species with a basal cavity, Tuber melanoexcavatum from China
具有基腔的黑松露新种,来自中国的Tuber melanoexcavatum
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
    International Journal of Microbiology
  • 影响因子:
    3.4
  • 作者:
    Li SH
  • 通讯作者:
    Li SH
Two new species of Termitomyces (Agaricales, Lyophyllaceae) from China and Thailand
中国和泰国的鸡蚁菌属(伞菌目、灵芝科)二新种
  • DOI:
    10.11646/phytotaxa.439.3.5
  • 发表时间:
    2020-04
  • 期刊:
    Phytotaxa
  • 影响因子:
    1.1
  • 作者:
    SHU-HONG LI
  • 通讯作者:
    SHU-HONG LI
Two new species, Lyophyllum alpinum and Lyophyllum waxy, from tibetan areas China
中国西藏地区的两个新种:高山真姬菇和蜡状真姬菇
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
    Myco Progress
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Li SH
  • 通讯作者:
    Li SH

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其他文献

鱼类Cystatins及其在水产食品中的应用前景
  • DOI:
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  • 发表时间:
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  • 期刊:
    食品工业科技
  • 影响因子:
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  • 作者:
    任阳阳;李树红
  • 通讯作者:
    李树红
建鲤重组Cystatin蛋白的原核表达、鉴定及多克隆抗体制备
  • DOI:
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  • 发表时间:
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  • 期刊:
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  • 影响因子:
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  • 作者:
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  • 通讯作者:
    李树红
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  • DOI:
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  • 发表时间:
    2014
  • 期刊:
    食品工业科技
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  • 作者:
    李树红
  • 通讯作者:
    李树红
Raw264.7细胞向破骨细胞分化诱导培养体系的改良
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  • 发表时间:
    2014
  • 期刊:
    吉林大学学报(医学版)
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  • 作者:
    李新;张舒岩;杨立彬;李树红
  • 通讯作者:
    李树红
鲢鱼卵中低分子CPIs的纯化鉴定及改善鱼糜凝胶强度的效果研究
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2014
  • 期刊:
    食品科学
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    刘玲;李树红
  • 通讯作者:
    李树红

其他文献

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李树红的其他基金

蚁巢伞属真菌系统发育及起源与演化研究
  • 批准号:
  • 批准年份:
    2020
  • 资助金额:
    36 万元
  • 项目类别:
    地区科学基金项目
横断山脉地区离褶伞属的分类及该属系统学研究
  • 批准号:
    31160010
  • 批准年份:
    2011
  • 资助金额:
    47.0 万元
  • 项目类别:
    地区科学基金项目

相似国自然基金

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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