基于高通量筛选方案(STARR-seq)的垂体瘤遗传易感基因区域精细定位和初步功能研究

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    81802496
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    22.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    H1804.肿瘤遗传与进化
  • 结题年份:
    2021
  • 批准年份:
    2018
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2019-01-01 至2021-12-31

项目摘要

Pituitary adenoma (PA) is one of the most common intracranial and neuroendocrine neoplasms, presenting severe clinical manifestations. However, the pathogenesis of PA remains largely unknown. To explore the somatic and germline mutations of PA is a hot topic in this field. Previously, we performed a genome-wide association study to identify three new genetic susceptibility loci (10p12.31, 10q21.1 and 13q12.13) for PA. They may lead to PA by regulating the expression of NEBL, PCDH15 and CDK8, respectively. Further, for fine mapping the causal single nucleotide polymorphisms (SNPs) in these loci, which can affect gene expression by modulating activities of distal regulatory elements, we will apply the self-transcribing active regulatory region sequencing (STARR-seq) strategy in current study. Moreover, a preliminary study will be carried out on the function of target genes. The finding from the present project would help to provide a solid theoretical basis for developing new methods to prevent and treat PA.
垂体瘤是最常见的神经内分泌肿瘤和颅脑肿瘤,临床危害严重,但发病机制不清。探索其肿瘤突变基因和遗传致病基因,一直是该领域的研究热点。申请人前期通过全基因组关联分析研究,在国际上首次发现三个与中国人垂体瘤发病密切相关的遗传易感基因区域(10p12.31,10q21.1和13q12.13),并表明其可能分别通过调控NEBL、PCDH15及CDK8表达而影响垂体瘤发生发展。现为对该三个易感基因区域开展精细定位,本研究将采用高通量基因转录调控序列鉴定方法(STARR-seq)从中筛选并验证以获得具有基因表达调控功能的单核苷酸多态性(SNP)位点,并对其下游靶基因开展初步的功能研究,以期为开发垂体瘤新的防治方法提供坚实的理论依据。

结项摘要

垂体瘤是最常见的神经内分泌肿瘤和颅脑肿瘤,临床危害严重,但至今其发病机制仍然不清。为进一步探索其肿瘤突变基因和遗传致病基因,我们前期已通过全基因组关联分析研究,发现与中国人垂体瘤发病密切相关的遗传易感基因区域。在本项目中,我们首先采用高通量基因转录调控序列鉴定法(STARR-seq),在易感基因区间内对具有基因表达调控功能的单核苷酸多态性(SNP)位点进行精细定位;再通过Hi-C对垂体瘤染色质进行空间结构测序,以初步明确功能型SNP所调控的下游靶基因;最后通过分子生物学实验,验证两者间参与调控作用的组蛋白乙酰化相关蛋白BRD4可为垂体瘤治疗新靶点。总体而言,本研究使得我们对垂体瘤遗传易感基因的作用机制有了更深入的认识,也为开发垂体瘤新的防治方法提供了坚实的理论依据。

项目成果

期刊论文数量(1)
专著数量(0)
科研奖励数量(1)
会议论文数量(1)
专利数量(0)
BRD4 as a therapeutic target for nonfunctioning and growth hormone pituitary adenoma.
BRD4 作为无功能和生长激素垂体腺瘤的治疗靶点
  • DOI:
    10.1093/neuonc/noaa084
  • 发表时间:
    2020-08-17
  • 期刊:
    Neuro-oncology
  • 影响因子:
    15.9
  • 作者:
    Shi C;Ye Z;Han J;Ye X;Lu W;Ji C;Li Z;Ma Z;Zhang Q;Zhang Y;He W;Chen Z;Cao X;Shou X;Zhou X;Wang Y;Zhang Z;Li Y;Ye H;He M;Chen H;Cheng H;Sun J;Cai J;Huang C;Ye F;Luo C;Zhou B;Ding H;Zhao Y
  • 通讯作者:
    Zhao Y

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其他文献

稀土配合物Eu(DBM)_3 phen/聚丙烯复合薄膜的光学性质
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2010-08
  • 期刊:
    发光学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    叶钊;骆永石;任建岳;段佩华;张继森;吕少哲;张立国
  • 通讯作者:
    张立国

其他文献

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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