用外显子组捕获测序技术鉴定Olmsted型掌跖角化症的致病基因

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    81150025
  • 项目类别:
    专项基金项目
  • 资助金额:
    10.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    H12.皮肤病学
  • 结题年份:
    2012
  • 批准年份:
    2011
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2012-01-01 至2012-12-31

项目摘要

Olmsted型掌跖角化症是一种掌跖角化症变异体,为高致畸率和高癌变风险的先天性皮肤综合征。鉴别诊断较为困难,分子机制不详。本项目将在排除相似角化性皮肤病致病基因和连锁分析大致定位的基础上,首次采用全外显子组捕获-Illumina HiSeq 2000测序、全转录组测序等目前最前沿的单基因病基因分析技术,结合传统的分子生物学实验验证手段,在种系(外周血)水平和体细胞(皮肤病理组织)水平上定位、克隆和分析本病的致病基因及其突变(点突变?小插缺?CNV?LOH?)和转录物的变化。并结合STR连锁分析手段,为急需的患者实施产前基因诊断服务。本项目开创Olmsted型掌跖角化症分子机制研究的先河,若能取得预期成果,将为其临床分子诊断、产前诊断、植入前遗传学诊断、掌跖角化症亚型的分子分类以及建立符合统一的遗传学诊断标准、动物模型构建、新药研发、基因治疗和转化医学等的研究提供坚实的理论和实验依据。

结项摘要

Olmsted型掌跖角化症(Olmsted syndrome。OMIM:614594)是一种掌跖角化症变异体,为高致畸率和高癌变风险的先天性皮肤综合征。鉴别诊断较为困难,分子机制不详。2012年,北京大学第一医院杨勇教授课题组首次在国际上发现TRPV3是Olmstyed综合征的致病基因之一(Lin et al. Am J Hum Genet, 2012;90(3):558-964)。本项目在排除相似角化性皮肤病致病基因以及TRPV3基因突变的基础上,首次利用全外显子组捕获 - Illumina HiSeq 2000 测序等目前最前沿的单基因病基因分析技术,结合传统的分子生物学实验验证手段,在种系(外周血)水平水平上分析所收集的一个Olmsted型掌跖角化症大家系的致病基因及其突变。通过全外显子测序,我们将致病基因的范围缩小到12个点突变和1个小插缺。并已筛选到1个可能的致病基因X。与杨勇教授课题组合作,已将部分研究内容整理成文投《Journal of Investigative Dermatology》发表。.

项目成果

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  • 作者:
    杨茹;郑震林;陆世铎;赵靖;张咸宁;陈莉;裴钢;马兰
  • 通讯作者:
    马兰

其他文献

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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