酵母prion蛋白Ure2的功能及其Grx活性的催化机制研究

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31070656
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    38.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C0505.蛋白质、多肽与酶生物化学
  • 结题年份:
    2013
  • 批准年份:
    2010
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2011-01-01 至2013-12-31

项目摘要

酵母prion蛋白Ure2由N端prion结构域和C端功能性结构域组成,在酵母体内具有抗氧化应激和重金属离子毒性的功能。Ure2的C端结构域含有一个和谷氧还蛋白(Grx)空间结构非常相似的硫氧还蛋白样亚结构域,而经典的Grx是非常重要的细胞内抗氧化应激酶类。我们已有的研究发现,Ure2具有一系列Grx相关的功能和活性。经典的Grx活性由其活性中心的CXXC/S基序所催化,而Ure2并不含有Cys残基,是一种不依赖于Cys或自由巯基的非典型Grx。这里,我们将研究Ure2的Grx活性催化反应的具体步骤和反应中间体与Ure2之间的相互作用和电子转移机制,并在Ure2的活性中心构建CXXC/S基序,研究突变体的活性变化,从而阐明Ure2的Grx活性的催化机制。还将建立酵母体内筛选系统,探索Ure2在酵母体内的生理学底物,研究其生理功能及其分子机制。

结项摘要

Ure2是酿酒酵母Saccharomyces cerevisiae中的一种prion蛋白,它决定了酿酒酵母的prion状态 [URE3]。Ure2通常以二聚体的可溶态存在,每个单体包括两个部分:N端1-90位是一段柔性的无折叠结构,它决定了prion状态的生成,并且在Ure2的体外成纤维过程中起着决定性作用;C端是一个球状结构域,起初被发现其在酵母的氮代谢调控中起着重要作用,并且与谷胱甘肽巯基转移酶在三维结构上有着一定的同源性。由于其三维结构上所含有的硫氧还蛋白亚结构域,Ure2被证明具有利用底物谷胱甘肽(GSH)还原巯基-二硫键的谷氧还蛋白活性。在典型的谷氧还蛋白酶活性中心中均含有CXXC(S)基序,为催化所必须;而Ure2并不含有这一序列,因此它代表了一种新颖的谷氧还蛋白酶。为了研究Ure2的催化机理,我们在其活性序列引入典型的CXXC(S)序列;在研究这一系列的活性序列突变体的过程中,发现CPNS突变体展现了一些不同寻常的特性:首先它改变了野生型Ure2所具有的对底物GSH的协同性,暗示其活性序列的改变可能导致了附近结构的某些变化;其次,CPNS突变体展示了高出野生型Ure2 六到七倍的脱氢维生素C还原酶的活力(DHAR),这一点暗示Ure2与单硫谷氧还蛋白家族具有更高的同源性。我们得到了Ure2/CPNS突变体的晶体结构,将其与野生型Ure2比较发现其活性中心区域柔性的变化很可能是改变Ure2/CPNS酶学特征的原因。另外我们比较了Ure2与来自大肠杆菌Escherichia coli的两种GST蛋白YfcG和YghU,通过三维结构上的分析以及构建并研究某些关键残基突变体的酶学性质,我们认为Ure2很可能与YfcG以及YghU同属于一类GST家族。

项目成果

期刊论文数量(11)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(12)
专利数量(0)
The fibrils of Ure2p homologs from Saccharomyces cerevisiae and Saccharoymyces paradoxus have similar cross-beta structure in both dried and hydrated forms
来自酿酒酵母和奇异酵母的 Ure2p 同源物的原纤维在干燥和水合形式下都具有相似的交叉 β 结构
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2011
  • 期刊:
    Journal of Structural Biology
  • 影响因子:
    3
  • 作者:
    Wang; Yi-Qian;Bongiovanni; Marie;Gras; Sally L.;Perrett; Sarah
  • 通讯作者:
    Sarah
Deletion of a Ure2 C-terminal prion-inhibiting region promotes the rate of fibril seed formation and alters interaction with Hsp40
Ure2 C 端朊病毒抑制区的缺失可促进原纤维种子形成的速率并改变与 Hsp40 的相互作用
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2011
  • 期刊:
    Protein Engineering Design and Selection
  • 影响因子:
    2.4
  • 作者:
    Chen; Li;Chen; Li-Jun;Wang; Hai-Yan;Wang; Yi-Qian;Perrett; Sarah
  • 通讯作者:
    Sarah
Chirality of Glutathione Surface Coating Affects the Cytotoxicity of Quantum Dots
谷胱甘肽表面涂层的手性影响量子点的细胞毒性
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2011
  • 期刊:
    Angewandte Chemie International Edition
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Li; Yiye;Zhou; Yunlong;Wang; Hai-Yan;Perrett; Sarah;Zhao; Yuliang;Tang; Zhiyong;Nie; Guangjun
  • 通讯作者:
    Guangjun
Exploiting amyloid: how and why bacteria use cross-beta fibrils
利用淀粉样蛋白:细菌如何以及为何利用交叉β原纤维
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2012
  • 期刊:
    Biochemical Society Transactions
  • 影响因子:
    3.9
  • 作者:
    Sawyer; Elizabeth B.;Claessen; Dennis;Gras; Sally L.;Perrett; Sarah
  • 通讯作者:
    Sarah
Relationship between prion propensity and the rates of individual molecular steps of fibril assembly
朊病毒倾向与原纤维组装单个分子步骤速率之间的关系
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2011
  • 期刊:
    Journal of Biological Chemistry
  • 影响因子:
    4.8
  • 作者:
    Wang; Yi-Qian;Buell; Alex K;Wang; Xin-Yu;Well; Mark E.;Dobson; Christopher M.;Knowles; Tuomas P. J.;Perrett; Sarah
  • 通讯作者:
    Sarah

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  • 作者:
    吴东宇;孙智千;柯莎;袁英;李广庆
  • 通讯作者:
    李广庆

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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