iTRAQ-LC-MS/MS定量蛋白质组学筛选亲神经亚型梅毒螺旋体标志物及其应用价值评估

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    81401749
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    24.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    H2606.检验医学研究新技术与新方法
  • 结题年份:
    2017
  • 批准年份:
    2014
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2015-01-01 至2017-12-31

项目摘要

Neurosyphilis is lack of sensitivity and specificity in diagnosis. So its misdiagnosing rate is very high. Our previous studies showed that molecular typing of the treponema pallidum (Tp) can help the neurosyphilis diagnosis. However, the nucleic acid extraction rate of the syphilis clinicals sample is quite low, which limits the clinical application of genetyping. Fortunately, our further researches indicated that there were different proteins expressed in neurotropic subtype Tp and non-neurotropic subtype Tp by two-dimensional electrophoresis, which suggested that proteomics approach is an available way to find a protein biomarker for neurosyphilis diagnosis. In this study, we will use iTRAQ-LC-MS/MS methodology to screen a specific candidate protein biomarker of the neurotropic Tp subtype; will use western blotting to verify whether the candidate protein is expressed differentially in peripheral blood of the neurosyphilis and non-neurosyphilis patients; further evaluate the cross antigenicity of the candidate protein biomarker; make a comprehensive evaluation to find out a potential serum biomarker for neurosyphilis diagnosis (maybe more than one); chemiluminescence immunoassay should be established to detect the serum peotein biomarker, and further evaluating its value for using as a index of neurosyphilis diagnosis, high-risks group screening and indicator of lumbar puncture. This studies, from the perspective of a our previous research in genetyping, looking for a potential serological biomarker for neurosyphilis diagnosis, are expected to find out a novel criteria for neurosyphilis diagnosis and indicator for lumbar puncture, which have puzzled the clinicians for a long time.
神经梅毒诊断缺乏灵敏、特异的指标,误诊率高。我们前期研究表明:梅毒螺旋体(Tp)基因分型有助于神经梅毒诊断,但临床标本的DNA提取率极低,不适合临床应用;而不同亚型Tp双向电泳蛋白表达谱存在质和量的不同,提示可通过蛋白质组学方法筛选神经梅毒标志物。本项目拟采用iTRAQ-LC-MS/MS定量蛋白质组学方法高通量筛选亲神经亚型Tp菌株候选差异蛋白标志物;采用Western blot方法验证候选蛋白在神经梅毒和非神经梅毒患者外周血中的表达;鉴定差异蛋白的交叉抗原性;综合评价,获得潜在的、可用于神经梅毒诊断的血清标志物(可能不止1个);建立化学发光免疫分析法检测血清蛋白标志物,评估其作为神经梅毒诊断、高危人群筛选、及腰穿指标的价值。本项目研究从已知Tp基因亚型入手,寻找血清中可用于神经梅毒诊断的标志物,有望解决神经梅毒诊断和腰穿指标这一长期困扰临床医生的难题。

结项摘要

近年来,梅毒的流行导致神经梅毒发病率增高。神经梅毒临床表现与其它神经系统性疾病极为相似(被称为“伟大的魔术师”),且缺乏灵敏性特异性的实验室指标,因此其误诊率极高。一直以来,神经梅毒的诊断一直是困扰临床医生、医学检验人员的重大难题,是当前梅毒研究的难点和盲区。值得庆幸的是,我们课题组发现了亲神经梅毒亚型Tp株的存在,其与神经梅毒的发生密切相关,并建立基因分型方法,用于特异性区分亲神经亚型Tp和非亲神经亚型Tp株。这一研究不仅为神经梅毒的诊断提供了一个新的指标,而且对梅毒鉴别复发与再感染等都有重大意义。然而,从患者标本提取足够量的DNA用于梅毒基因分型,然后用于临床诊断在大多数患者中是很难做到的,因此,迫切需要寻找一个比基因分型更加简便快速的方式对神经梅毒进行诊断。本研究中,我们首先采用了iTRAQ-LC-MS/MS定量蛋白质组学方法,初步筛选得到亲神经亚型Tp菌株差异蛋白标志物;再采用Western blot方法验证候选蛋白在神经梅毒和非神经梅毒患者外周血中的表达;综合评价,获得潜在的、可用于神经梅毒诊断的血清标志物,并构建化学发光免疫分析法检测该标志物,评估其作为神经梅毒诊断、高危人群筛选、及腰穿指标的价值。我们的结果发现,iTRAQ-LC-MS/MS方法学初步筛选发现了20个蛋白在亲神经梅毒亚型株中高表达,随后采用RT-PCR和Western blot验证得到了3个(TP0163、TP0956、TpN33)在亲神经梅毒亚型Tp菌株及神经梅毒患者血清中高表达的蛋白。综合分析,最后选取TP0163和TP0956两个蛋白建立化学发光免疫分析法(NS-CIA),分别检测该蛋白在不同患者血清中的表达水平。分析标志物的检测结果与脑脊液指标(如CSF蛋白、白细胞数和梅毒血清学抗体等指标)进行相关性分析,发现新构建方法的神经梅毒判断的的灵敏度为55.26%,特异性为66.13%,对神经梅毒的诊断及腰穿指针的选择具有一定的临床应用价值。此外,在实验过程中我们对神经梅毒患者血清中TPPA滴度变化与神经梅毒诊断以及转归进行了相关性分析,发现血清TPPA不仅可作为神经梅毒的筛查指标(筛查能力优于血清RPR滴度),而且与神经梅毒的转归密切相关,颠覆了传统的“梅毒特异性抗体不能用于疗效监测” 观点。

项目成果

期刊论文数量(11)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(1)
Macrophage migration inhibitory factor as a novel cerebrospinal fluid marker for neurosyphilis among HIV-negative patients
巨噬细胞迁移抑制因子作为 HIV 阴性患者神经梅毒的新型脑脊液标志物
  • DOI:
    10.1016/j.cca.2016.10.018
  • 发表时间:
    2016-12-01
  • 期刊:
    CLINICA CHIMICA ACTA
  • 影响因子:
    5
  • 作者:
    Lin, Li-Rong;Lin, Dan-Hong;Yang, Tian-Ci
  • 通讯作者:
    Yang, Tian-Ci
LncRNA Expression in CD4+T Cells in Neurosyphilis Patient
神经梅毒患者 CD4 T 细胞中 LncRNA 的表达
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2017
  • 期刊:
    Frontiers in Cellular and Infection Microbiology
  • 影响因子:
    5.7
  • 作者:
    Li-Li Liu;Shao-Gang Zhu;Xiao-Yong Jiang;Jun Ren;Yong Lin;Ning-Ning Zhang;Man-Li Tong;Hui-Lin Zhang;Wei-Hong Zheng;Hua-Jun Fu;Hai-Juan Luo;Li-Rong Lin;Jiang-Hua Yan;Tian-Ci Yang
  • 通讯作者:
    Tian-Ci Yang
Whole genome sequence of the Treponema pallidum subsp. pallidum strain Amoy: An Asian isolate highly similar to SS14.
梅毒螺旋体梅毒亚种厦门株的全基因组序列:与 SS14 高度相似的亚洲分离株
  • DOI:
    10.1371/journal.pone.0182768
  • 发表时间:
    2017
  • 期刊:
    PloS one
  • 影响因子:
    3.7
  • 作者:
    Tong ML;Zhao Q;Liu LL;Zhu XZ;Gao K;Zhang HL;Lin LR;Niu JJ;Ji ZL;Yang TC
  • 通讯作者:
    Yang TC
Serological Response Predicts Normalization of Cerebrospinal Fluid Abnormalities at Six Months after Treatment in HIV-Negative Neurosyphilis Patients.
血清学反应可预测 HIV 阴性神经梅毒患者治疗后六个月脑脊液异常的正常化
  • DOI:
    10.1038/s41598-017-10387-x
  • 发表时间:
    2017-08-30
  • 期刊:
    Scientific reports
  • 影响因子:
    4.6
  • 作者:
    Xiao Y;Tong ML;Lin LR;Liu LL;Gao K;Chen MJ;Zhang HL;Zheng WH;Li SL;Lin HL;Lin ZF;Yang TC;Niu JJ
  • 通讯作者:
    Niu JJ
A negative nontreponemal and/or specific antitreponemal IgM test does not exclude active infectious syphilis: evidence from a rabbit infectivity test: A case report.
非梅毒螺旋体和/或特异性抗梅毒螺旋体 IgM 检测呈阴性并不能排除活动性传染性梅毒:来自兔子感染性检测的证据 病例报告
  • DOI:
    10.1097/md.0000000000004520
  • 发表时间:
    2016-08
  • 期刊:
    Medicine
  • 影响因子:
    1.6
  • 作者:
    Lin LR;Tong ML;Gao K;Zhu XZ;Fan JY;Zheng WH;Li SL;Lin HL;Liu LL;Yang TC
  • 通讯作者:
    Yang TC

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其他文献

梅毒血清固定与神经梅毒的关系
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    --
  • 发表时间:
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  • 期刊:
    中华医院感染学杂志
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    李淑莲;林志锋;张惠姗;林惠玲;童曼莉;刘桂丽;林丽蓉;LI Shu-lian,LIN Zhi-feng,ZHANG Hui-shan,LIN Hui-li
  • 通讯作者:
    LI Shu-lian,LIN Zhi-feng,ZHANG Hui-shan,LIN Hui-li
神经梅毒的实验诊断研究进展
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    --
  • 发表时间:
    2012
  • 期刊:
    中国医药导报
  • 影响因子:
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  • 作者:
    吴静宜;童曼莉;李淑莲
  • 通讯作者:
    李淑莲

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树突状细胞来源外泌体miRNAs作为梅毒血清固定诊断标志物的筛选及其应用
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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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