基于阴离子交换色谱分级和功能化氧化石墨烯材料富集的N-磷酸化蛋白质组样品预处理新方法研究

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    21505133
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    21.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    B0401.分离与分析
  • 结题年份:
    2018
  • 批准年份:
    2015
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2016-01-01 至2018-12-31

项目摘要

Protein N-phosphorylation regulates a series of essential functions in life processes, such as nucleosome assembly, cell transcription, signal transduction and so forth. However, traditional methods are difficult to enrich N-phosphopeptides because of its acid-lability, which leads to current international research on N-phosphoproteomics in its infancy. To better understand the roles of N-phosphorylated proteins in life processes, it is urgent to develop new methods for N-phosphoproteome sample pretreatment. The project intends to develop new technologies including O-phosphopeptide dephosphorylation, anion exchange chromatography fractionation and functionalized graphene oxide enrichment, and establish a universal, high selectivity and high efficiency approach for N-phosphoproteome sample pretreatment by integrating the above technologies, which will provide important technical support for promoting the process of N-phosphoproteome research.
蛋白质的N-磷酸化修饰在核小体组装、细胞转录、信号转导等生命过程中发挥了举足轻重的作用。然而由于N-磷酸化肽段对酸敏感,因此采用传统方法难以富集,进而导致了目前国际上对N-磷酸化蛋白组学的研究尚处于起步阶段。为深入了解N-磷酸化蛋白质在生命过程中发挥的作用,亟需发展N-磷酸化蛋白质组样品预处理新方法。本项目拟发展O-磷酸化肽去磷酸化、阴离子交换色谱分级和功能化氧化石墨烯材料富集等新技术,并通过上述技术的集成,建立具有普适性的、高选择性和高效的N-磷酸化蛋白质组样品预处理新方法,为推动N-磷酸化蛋白组的研究进程提供重要的技术支撑。

结项摘要

发生在组氨酸、赖氨酸、精氨酸侧链氨基的磷酸化修饰,称为N-磷酸化修饰。研究表明N-磷酸化修饰在核心生命活动过程中起到重要作用。由于P-N酰胺键对酸敏感,传统富集方法所需强酸条件易导致P-N键水解。本项目以发展高效的N-磷酸化修饰富集方法为研究目标,发展了多种新型富集材料和新方法用于N-磷酸化修饰富集,以促进N-磷酸化蛋白质组学发展。具体研究内容如下:.1. 以双二甲基吡啶胺双锌离子为磷酸根识别基团,以单分散亚二微米核壳微硅球作为固载基质,制备了新型的双二甲基吡啶胺双锌离子功能化亚二微米核壳微球。功能材料成功用于中性条件下快速富集N-磷酸化肽段;得益于单分散介孔性质,on-tip富集的回收率比自由溶液富集提高4倍。在大肠杆菌酶解产物中鉴定到32个N-磷酸化位点,对应于40个蛋白质,其中5个蛋白质具有激酶性质。研究表明富集作用力包括配位作用、静电作用和亲水相互作用。该研究开创了功能材料用于N-磷酸化修饰富集研究的先河。.2. 利用双二甲基吡啶胺双锌离子与氧化石墨烯表面的π-π堆积作用,制备双二甲基吡啶胺双锌离子功能化氧化石墨烯材料,功能材料具有固载量高、层状结构、分散性好、非特异性吸收少的特点,成功用于中性条件下N-磷酸化蛋白质快速富集。在100倍非磷酸化蛋白质干扰下,材料对N-磷酸化蛋白质的富集因子高到137.9。.3. 发展双二甲基吡啶胺双锌离子功能材料富集结合β-消除的富集策略,减少O-磷酸化肽段对N磷酸化修饰鉴定的干扰,提高N-磷酸化肽段鉴定效率和数目。研究表明经过消除β-消除后10条N-磷酸化肽段平均质谱离子得分从32.9提高到45.4。 .4. 利用二甲基化标记和对角线色谱分离的原理,在赖氨酸磷酸化位点标记轻重二甲基化标记,利用标记和色谱保留时间差异,发展了新型的赖氨酸磷酸化位点鉴定新方法。在100000倍非磷酸化肽段干扰下,实现了赖氨酸磷酸化选择性富集。更重要的是实现了真核生物赖氨酸磷酸化鉴定,共鉴定112个赖氨酸磷酸化位点,实现色谱分离用于真核生物赖氨酸磷酸化富集分离研究。.

项目成果

期刊论文数量(1)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(7)

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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